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文檔簡介
內(nèi)容研究進(jìn)展一.液體活檢1)cfDNA&ctDNA
&
CTC概念和2)液體活檢應(yīng)用和意義二.CTC/CTSC研究方法和進(jìn)展三.
的研究液態(tài)活檢來源于腫瘤組織,存在于血液中:循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)腫瘤外泌體exosome提示腫瘤發(fā)展進(jìn)程及抗藥性等信息,指導(dǎo)化精準(zhǔn)治療Diaz
LA
Jr,
Bardelli
A.Liquid
Biopsies:
Genoty579–586Circulating
Tumor
DNA.
J
Clin
Oncol.
2014;
32(6):cfDNAWhat:循環(huán)游離DNA,機(jī)體細(xì)胞入外周血循環(huán)后發(fā)生部分降解的內(nèi)源性DNA。高度片段化,約170bp。Source:正常細(xì)胞、異常細(xì)胞(如腫瘤細(xì)胞), DNA等State:半衰期短,動態(tài)表達(dá)量,核小體以單個(gè)、雙聯(lián)或三聯(lián)的形式進(jìn)入血液,并逐步分解。cfDNA(cell-free
DNA)ctDNAWhat:循環(huán)腫瘤DNA,是指腫瘤細(xì)胞DNA經(jīng)脫落或細(xì)胞凋亡后進(jìn)入循環(huán)系種特征性的腫瘤生物標(biāo)記物,可以被定性、定量和追蹤。
Source:來源于腫瘤細(xì)胞的cfDNA,屬于cfDNA的一種類型。不同患者的水平差異顯著,受腫瘤負(fù)荷,分期等因素的影響ctDNA(circulating
tumorDNA)cfDNA
&
ctDNAEllen
Heitzer,Peter
Ulz,and
Jochen
B.Geig.Circulating
Tumor
DNA
as
a
Liquid
Biopsy
for
Cancer.Clinical
Chemistry
.
2015,112–1231
:
CAPP-Seq
(
cancerby
deep
sequencing
)alized個(gè)profiling體化深度NimbleGen分析方法:利用定制化的SeqC Z
Choice
Library作為”篩選器“對樣本靶向捕獲后再深度測序,靈敏度高,特異性強(qiáng)且經(jīng)濟(jì)可行。2:利用數(shù)字錯(cuò)誤抑制(
IDES
)的方法和
CAPP-seq(ctDNA
方法),能夠檢測到頻率低至0.004%的突變等位AM
,
Lovejoy
A
F
,
Klass
DM,
et
al.
Integrated
digital
error
suppression
for
improved
detectionof
circulating
tumor
DNA.
Nature
Biotechnology(2016)
:10.1038/nbt.3520ctDNA-高通量cfDN段譜系分析Deep
sequencingofcirculating
cell-freeDNA
yields
a
dense,genome-wide
map
ofnucleosomeoccupancythat
enablesidenti?cationofits
cell-types
oforigin,potentially
enabling
thenoninvasive
monitoring
of
a
broader
set
of
clinical
conditionsMatthew
W.
Snyder,
Martin
Kircher,Andrew
J.
Hillet
al.
Cell-free
DNA
Comprises
an
In
Vivo
NucleosomeFootprint
that
Informs
Its
Tissues-Of-Origin.Cell.
2016
Jan
14;164(1-2):57-68.CTCWhat:循環(huán)腫瘤細(xì)胞,是指從實(shí)體瘤中脫離出來并進(jìn)入外周血液循環(huán)的腫瘤細(xì)胞。Source:腫瘤和轉(zhuǎn)移灶都會CTC??蓹z測到的CTC是腫瘤細(xì)胞在循環(huán)系統(tǒng)微環(huán)境下生存競爭的結(jié)果。CTC(circulating
tumorcells)液體活檢應(yīng)用價(jià)值(監(jiān)測腫瘤特異性突變發(fā)現(xiàn)腫瘤復(fù)發(fā))Ellen
Heitzer,Peter
Ulz,and
Jochen
B.Geig.Circulating
Tumor
DNA
as
a
Liquid
Biopsy
for
Cancer.Clinical
Chemistry
.
2015,112–123液體活檢應(yīng)用價(jià)值(分析耐藥株的遺傳變異)Ellen
Heitzer,Peter
Ulz,and
Jochen
B.Geig.Circulating
Tumor
DNA
as
a
Liquid
Biopsy
for
Cancer.Clinical
Chemistry
.
2015,112–123液體活檢優(yōu)勢及前景液態(tài)活檢無侵入性、可頻繁多次檢測及快速反應(yīng)能力均體現(xiàn)出發(fā)展?jié)摿薮髴?yīng)用價(jià)值。將削減無效腫瘤醫(yī)療開支、降低醫(yī)療成本。適應(yīng)癥廣泛,如
、結(jié)直腸癌、肺癌、胃癌、食管癌等常見腫瘤均可用液態(tài)活檢技術(shù)進(jìn)行
與監(jiān)測。2015年
發(fā)布的腫瘤治療計(jì)劃的四大舉措之一:“液態(tài)活檢”血漿開發(fā)新方法來評估治療反應(yīng)以及抵抗可能的耐藥性。根據(jù)中國國家
中心發(fā)布的數(shù)據(jù),我國5年內(nèi)
為
且仍存活的病例數(shù)約為749萬。也是液態(tài)活檢巨大的市場。CTC研究概況CTC與轉(zhuǎn)移的關(guān)系CTC異質(zhì)性與腫瘤治療CTC應(yīng)用和意義CTC研究方法CTCs
(circulating
tumor
cells,
CTCs)Ashworth早在1896年就提出了循環(huán)腫瘤細(xì)胞的概念。侵入循環(huán)系統(tǒng)的腫瘤細(xì)胞,大部分由于機(jī)體的免疫識別、機(jī)械及自身凋亡在短期內(nèi),只有極少數(shù)存,在適于自身存活和增殖的或組織形成轉(zhuǎn)移灶。CTC與腫瘤轉(zhuǎn)移Simon
A
Joosse,
Tobias
M
G es,
and
Klaus
Pan .
Biology,
detection,
and
clinical
implications
ofcirculating
tumor
cells.
EMBO
Mol
Med.
2015
;
7(1):
1–11.Brouwer
A,
De
Laere
B,
Peeters
D,
et
al.consequences
of
heterogeneity
in
the
circulating
tumor
cellcompartment.
Onco .
2016Mar
9. :10.18632/onco
.8015.CTC異質(zhì)性CTC應(yīng)用和意義CTCs腫瘤轉(zhuǎn)移腫瘤治療CTCs數(shù)量改變反映了腫瘤細(xì)胞對各種治療方案的敏感性和有效性,為
化治療提供依據(jù)。監(jiān)測早期轉(zhuǎn)移、
癌結(jié)腸癌、肺癌、胃癌、肝癌、胰
多種腫瘤監(jiān)測CTCs
表達(dá)/突變,找到藥物敏感的靶點(diǎn),指導(dǎo)
化治療CTC優(yōu)化治療方案2014年GoldKorn,接受多西他賽聯(lián)合阿曲生坦治療的轉(zhuǎn)移性去勢抵抗性
癌患者,基線循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTC數(shù)量可預(yù)后,3周時(shí)CTC升高提示總生存較差,有望作為重新指導(dǎo)和優(yōu)化治療的較好指標(biāo)。Goldkorn
A,Ely
B,Quinn
DI,et
al.Circulating
Tumo
cell
counts
are
Prognostic
of
overall
survival
in
SWOG
S0421:a
Phase
IIITrial
of
docetaxel
with
or
without
atrasentan
For
Metastatic
castration
resistant
prostate
cancer.J
Clin
Oncol2014
32(11):1136-1142.Bian
L,Wang
T,Liu
Y,et
al.Evaluation
of
treatment
response
for
breast
cancer:are
we
Entering
the
eraof
”biological
Complete
remission”?.Chin
J
Cancer
Res.2012,24:403-407.2012年Bian,乳癌患者在接受化療(白蛋白結(jié)合型紫杉醇+卡培他濱+曲妥珠單抗)前后CTC變化。治療前:CTC
3,HER-2+;1療程:CTC
0。6療程:病理學(xué)CR。證實(shí)CTC值在
治療早期發(fā)生顯著變化,能夠準(zhǔn)確預(yù)示療效,能夠科學(xué)指導(dǎo)選擇治療方案。CTCs的研究方法Ramdane
Harouaka
,
Zhigang
Kang
,Si-Zheng
,
Liang
Cao.
Circulating
tumor
cells:
Advances
inysis,
and
challenges
for
clinical
applications.
Pharmacology
&
Ther
utics.2014;isolation
and141:209–221.研究方法(1)-Cell
SearchCellSearch系統(tǒng)是唯一經(jīng)FDA批準(zhǔn)進(jìn)入臨床應(yīng)用的CTCs檢測方案。原理:EpCAM抗體標(biāo)識的微磁珠從全血中捕獲細(xì)胞,用免疫熒光識EpCAM+CK+CD45?進(jìn)行磁性分離。CTCEpCAMCKDAPICD45CellSearch數(shù)據(jù)解讀:7.5ML外周血判斷閾值:轉(zhuǎn)移性CTCs≥5
細(xì)胞癌CTCs
≥5細(xì)胞結(jié)腸癌:CTCs≥3細(xì)胞表明預(yù)后不良3.目前FDA只批準(zhǔn)用于以上三種腫瘤CTCs的研究方法(2)-
CTCs的研究方法(3)-Xiaohui
Nia,
Minglei
Zhuo,
Zhe
Sua,et
al.
Reproducible
copy
number
variation
patterns
among
singlecirculating
tumor
cells
of
lung
cancer
patients.
PNA,2013,52(110)
21083-21088.Xiaohui
Nia,
Minglei
Zhuo,
Zhe
Sua,et
al.
Reproducible
copy
number
variation
patterns
among
singlecirculating
tumor
cells
of
lung
cancer
patients.
PNA,2013,52(110)
21083-21088.Ramdane
Harouaka
,
Zhigang
Kang
,
Si-Zheng
,
Liang
Cao.
Circulating
tumor
cells:
Advances
inysis,
and
challenges
for
clinical
applications.
Pharmacology
&
Ther
utics.2014;isolation
and141:209–221.CTCs的分離方法(1)CTCs的分離方法(2)-體外培養(yǎng)Min
Yu
,
Aditya
Bardia
,
Nicola
Aceto,
et
al.
Ex
vivo
culture
of
circulatingbreast
tumor
cellsforindividualized
testingof
drug
susceptibility.
Science.
2014
;
345(6193):
216–220.Papanicolaou
staining
foruncultured
primaryRepresentative
images
ofnonadherent
CTCimmunofluorescentstaining
:CK:
red;Ki67:yellow;CD45
:green;DAPI:
blue.CTSC研究概況CTSC定義CSC,CTC,CTSC三者關(guān)系CTSC研究進(jìn)展CTSC研究難點(diǎn)和未來方向CTSC背景介紹循環(huán)腫瘤干細(xì)胞(circulating
tumor
stem
cells,CTSCs):CTCs中具有干細(xì)胞特性,即自我更新及分化潛能的一小群細(xì)胞。作為標(biāo)志物CTSC具有更重要的臨床價(jià)值。EMT可使CTCs獲得干細(xì)胞特性,而具有藥物耐受性和高侵襲性。CTSC已在包括肝癌,
,胃癌,結(jié)直腸癌等多種腫瘤中被證實(shí)。CSC
,CTC,CTSC(腫瘤轉(zhuǎn)移等級結(jié)構(gòu)圖)MH,
Imrali
A,
Heeschen
C.Circulating
cancer
stem
cells:
the
importance
to
select.Chin
J
Cancer
Res.2015
Oct;27(5):437-49.MarkersforCTSCMH,
Imrali
A,
Heeschen
C.Circulating
cancer
stem
cells:
the
importance
to
select.Chin
J
Cancer
Res.2015
Oct;27(5):437-49.CTSC研究進(jìn)展學(xué)者們采用不同的表面標(biāo)志物組合來定義CTSC:Epcam/CK/CD44/CD24;
Epcam/CK/ALDH1/CD24Epcam/CK/Vimentin/Fibernectin;Epcam/CK/TWISTI/Akt2PDKaEpcam/Muc1/HER2Baccelli
I,Schneeweiss
A,Riethdorf
S,et
a1.Identification
of
a
population
of
blood
circulating
tumor
cells
from
breast
cancerpatients
that
initiates
metastasis
in
axenografiassay[J].Nat
Biotechnol,2013,31(6):539.544.Kasimir—Bauer
S,Hoffmann0,Wallwiener
D,et
a1.Expression
Of
stem
cell
and
epithelial—mesenchymal
transition
markersinPrimary
breast
cancer
Patients
With
circulating
tumor
cells
[J].Breast
Cancer
Res,2012,14(1):R15.CTSC研究進(jìn)展Yu
M.Bardia
A,Wittner
BS.et
a1.Circulating
breast
tumor
cells
Exhibit
dynamic
changes
InEpithelial
and
mesenehymal
eompostion[J].Science,2013,339(6119):580-584.EPCAM
low
MET
highCD47
high
CD44
high2013年復(fù)旦大學(xué)附屬肝癌
及研究組通過研究123例肝癌患者CTCs相關(guān)腫瘤干細(xì)胞免表標(biāo)記物,包括CD133、ABCG2、CD90、β-catenin、E-cadherin以及
Vimentin。2013年Liu等鑒于ICAM-1可能是肝癌干細(xì)胞標(biāo)志物,也采用流式細(xì)胞術(shù)檢測了肝癌血樣,發(fā)現(xiàn)部分病例可檢出CD45-ICAM-1+細(xì)胞,這樣的細(xì)胞具有較強(qiáng)的體外成球和體內(nèi)致瘤能力。Y.F.,
et
al.,
Circulating
stem
cell-like
epithelial
cell
adhesion
molecule-positive
tumor
cells
indicate
poor
prognosis
of
hepatocellularcarcinoma
after
curative
resection.
Hepatology,
2013.
57(4):
p.
1458-68。Liu
S,
Li
N,
Yu
X,
et
al.
Expression
of
intercellular
adhesionmolecule
1
by
hepatocellular
carcinoma
stem
cells
and
circulating
tumorcells[J].
Gastroenterology,
2013,
144(5):1031-1041肝癌CTSCs研究進(jìn)展的研究CSC
andmiRNACTC
andCTSC項(xiàng)目研究基礎(chǔ)—前期基金支持1.2014年福建省衛(wèi)教聯(lián)合項(xiàng)目:結(jié)直腸癌循環(huán)腫瘤細(xì)胞和腫瘤干細(xì)胞的分子機(jī)制研究(WKJ-FJ-14)個(gè)2012年福建省科技廳重點(diǎn)項(xiàng)目:《循環(huán)腫瘤細(xì)胞與腫瘤干細(xì)胞在體化治療中的應(yīng)用研究》(2012Y0017);2012年福建省衛(wèi)生廳青年課題:《結(jié)直腸癌循環(huán)腫瘤細(xì)胞及其上皮間質(zhì)變標(biāo)志物的定量檢測》(2012-2-13);2012年福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目:《miR-148
-靶蛋白網(wǎng)絡(luò)在肝癌干細(xì)胞中調(diào)控機(jī)制研究》(2012J05138);2011年福建省醫(yī)學(xué)創(chuàng)新課題:《
循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)及其單細(xì)胞多的臨床意義》(2011-CX-16);6.
2011年福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目:《循環(huán)腫瘤細(xì)胞及其耐藥表達(dá)水平在晚期化療敏感性中的應(yīng)用研究》(2011J01141)-基金支持2016年福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目:《miR-194調(diào)控肝癌干細(xì)胞的靶 和
LncRNA
鑒定》(2016J01436)2009年福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目:《靶向
干細(xì)胞的樹突狀瘤苗抗腫瘤的研究》(2009J01118)2008年福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目:《miRNA靶向肝癌SP、NSP細(xì)胞
差異表達(dá)的研究》(2008J0077)MoFlo速流式細(xì)胞分選系統(tǒng)稀有細(xì)胞檢測的靈敏度高分選速度快研究基礎(chǔ)設(shè)備CSC-
Side
population(SP)
assayIt
is
generally
accepted
that
SP
cellspossess
stem
cellcharacteristics.Critical:
Optimize
Hoechst
33342
stainingprocedure
to
achieve
a
consistent
andtumorigenic
SP
subtype
as
SP
approach
isbased
on
the
functional
property
of
CSCs
toexclude
Hoechst-33342-dye
via
ABCtransporters.SPNSP-MoFloysis
and
sorting-Sphere
formation
assayFloating
sphereswereformed
bySP
cells,
while
none
byNSP
cellsHep-3BPLC/PRF/5Huh-7實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)-Tumors
formed
in
NOD/SCID
micePLC/PRF/5Huh-7Hep-3BWeek
12;1×103
cells;SP:
blue
arrow;NSP:
redarrow.miRNA
profiling
result
by
RT-qPCRmiRNA
IDSP/NSP
Fold
changesP<0.05miR-9-3miR-9*-2.41miR-23b-2.12miR-27b-2.35miR-96-2.8miR-151-3p-2.65miR-151-5p-2.57miR-183*-2.23miR-183-3.16miR-194-2.03miR-146a-3.44miR-148b-3.14miR-340-3p-2.85miR-421-2.32miRNA
IDSP/NSP
Fold
changesP<0.05miR-135b*-3.55miR-489-3.28miR-15a-2.79miR-21-2.67miR-22-2.5miR-365-2.47miR-450a-5p-2.46miR-7a-2.44miR-26b-2.28miR-125a-5p-2.27miR-25-2.22miR-
126-3p-2.15miR-182-2.14A
total
of
370
miRNA
species
were yzed
in
PLC/PRF/5 SP
and
NSP
cells,
27
miRNAswere
identified
as
differentially
expressed,
all
of
which
were
down-regulated
in
SP
.實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)-miR-148b在SP中低表達(dá)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)--miR-148b改變SP比例實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)--miR-148b改變增殖與耐藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)-miR-148b改變遷移侵襲與血管生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)-miR-148b過表達(dá)抑制腫瘤生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)-miR-148b沉默促進(jìn)腫瘤生成研究方案——CTC/CTSC研究方案——分選流程已完成200例鼻咽癌患者CTC檢測,100例患者CTC檢測,100例肺癌患者CTC檢測,150例直腸癌患者CTC/CTSC檢測,具備完善的CTC檢測技術(shù)流程。在研項(xiàng)目:150例初診未治腸癌患者,
其全病程臨床資料并抽取各階段血樣,分析患者各個(gè)時(shí)期
CTCs/CTSCs
數(shù)
值
,
以
PSF
為
觀
察
點(diǎn)
,
評
估
CTCs/CTSCs數(shù)值與臨床分期、預(yù)后、治療方案及療效等情況的相關(guān)性,
尤其是手術(shù)配合細(xì)胞治療的療效觀察,開發(fā)CTC/CTSC在療效評估中的應(yīng)用。研究數(shù)據(jù)入組初診未治腸癌患者150例患者全程臨床資料并抽取各階段血樣(TIL組:根治術(shù)前、術(shù)后第一次細(xì)胞治療后、細(xì)胞治療2個(gè)周期后、細(xì)胞治療3個(gè)周期后……對照組:根治術(shù)前、術(shù)后7天、術(shù)后1月,術(shù)后2月……每月一次)利用Moflo對CTCs/CTSCs計(jì)數(shù)患者各個(gè)時(shí)期CTCs/CTSCs數(shù)值與臨床分期、預(yù)后、治療方案及療效等情況相關(guān)性以PSF為觀察點(diǎn),評估手術(shù)配合細(xì)胞治療的療效觀察難點(diǎn)和CTC/CTSC研究難點(diǎn)稀有性:僅占PBMC的1/106活性:難以保持細(xì)胞活性進(jìn)行后續(xù)研究單細(xì)胞性:細(xì)胞稀少難以進(jìn)行后續(xù)研究分選精度可達(dá)到1/106可保持分選后細(xì)胞的活性進(jìn)行單細(xì)胞水平RNA
提取和預(yù)擴(kuò)增,保證下游基因表達(dá)譜分析的質(zhì)量MoFlo速流式細(xì)胞分選系統(tǒng)REPLI-gWTASingleCell
Kit本項(xiàng)目關(guān)鍵技術(shù)流式分析CTC敏感性專一性檢測研究數(shù)據(jù)研究數(shù)據(jù)CTCs的畫門模式研究數(shù)據(jù)CTSCs的畫門模式CTCs的檢測研究數(shù)據(jù)研究數(shù)據(jù)CTSCs的檢測首診初治結(jié)直腸癌患者CTC/CTSC檢測分析結(jié)果<3≧3Age(years)0.157≦6025(50.0)1015>6025(50.0)1312Sex0.205female20(40.0)1010man30(60.0)1317Tumor
size(cm)0.189<526(52.0)1313≧524(48.0)1014TNM
stage0.072I5(10.0)41II11(22.0)92III29(58.0)218IV5(10.0)14T
stage0.118T12(4.0)11T25(10.0)50T34(8.0)31T439(78.0)2613RLNM0.032N017(34.0)143N121(42.0)1011N212(24.0)102M
(metastasis)0.024M045(90.0)3411M15(10.0)14PatientCharacteristicsNumber(%)CTC、CTSC(CD44+)p-value研究數(shù)據(jù)結(jié)直腸癌患者轉(zhuǎn)移后化療期間CTC/CTSC變化研究數(shù)據(jù)CTC分選分選白細(xì)胞對照:DAPI+/CD45-/Epcam-分選CTC細(xì)胞:DAPI+/CD45-/Epcam+實(shí)驗(yàn)方案研究數(shù)據(jù)-表達(dá)譜聚類圖腫瘤組織
正常組織
CTC細(xì)胞
白細(xì)胞對照實(shí)驗(yàn)方法區(qū)域中
與表達(dá)的相關(guān)分析圖表達(dá)譜比較組雜交近年文章1. Qinying
Liu, mei
Xu,
Shenghong,
et
al.miRNA-148b
suppresses
hepatic
cancer
stem
cell
bying
neuropilin1.
Bioscience
Reports,
2015;35(4).2. Xu
YM,
Xie
YQ,
Wang
XR,
et
al.
Identification
of
cancer
stem
cells
from
hepetocellular
carcinoma
cell
linesand
their
related
microRNAs.Oncol
Rep.
2013.
30:
2056-62.3.,
,
,
等.
患者循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測的臨床意義.中華腫瘤防治雜志,
2015,22(13):1009-1013.4. Identification
of
perioperative
circulating
tumor
cells
and
potential
biomarkers
of
circulating
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