高通量測(cè)序應(yīng)用-課件

高通量測(cè)序的應(yīng)用1高通量測(cè)序的應(yīng)用1高通量測(cè)序的用途2高通量測(cè)序的用途2高通量測(cè)序的用途基因組序列的物種進(jìn)行重測(cè)序，鑒定SNP，indel及基因組結(jié)構(gòu)變化；對(duì)含有全基因組序列且轉(zhuǎn)錄本注釋較好的物種開(kāi)展轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究，解析細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的數(shù)量變化及其結(jié)構(gòu)信息。3高通量測(cè)序的用途基因組序列的物種進(jìn)行重測(cè)序，鑒定SNP，in高通量測(cè)序現(xiàn)狀

第二代測(cè)序技術(shù)，又稱(chēng)超高通量測(cè)序。目前，科學(xué)家正為1000美元完成一個(gè)基因組測(cè)序而努力。多家研究單位正在為此展開(kāi)競(jìng)爭(zhēng)，而且進(jìn)展比預(yù)期的更快。4高通量測(cè)序現(xiàn)狀

第二代測(cè)序技術(shù)，又稱(chēng)超高通量測(cè)序。目前，科學(xué)高通量測(cè)序原理高通量測(cè)序方法原理示意圖5高通量測(cè)序原理高通量測(cè)序方法原理示意圖5高通量測(cè)序平臺(tái)高通量測(cè)序的三大平臺(tái)：Illumina公司的Solexa測(cè)序儀，羅氏公司(Roche)的454測(cè)序儀，ABI公司的SOLiD測(cè)序儀6高通量測(cè)序平臺(tái)高通量測(cè)序的三大平臺(tái)：6高通量測(cè)序特點(diǎn)速度快通量高結(jié)果一致性好簡(jiǎn)便高效7高通量測(cè)序特點(diǎn)速度快7高通量測(cè)序在基因組上應(yīng)用應(yīng)用于人基因組重測(cè)序動(dòng)植物、細(xì)菌基因組測(cè)序8高通量測(cè)序在基因組上應(yīng)用應(yīng)用于人基因組重測(cè)序8高通量測(cè)序在mRNA表達(dá)譜的應(yīng)用將miRNA的標(biāo)記與線(xiàn)性放大相結(jié)合，只需要幾皮克純化的miRNA就能獲得高敏感度的miRNA芯片表達(dá)譜。9高通量測(cè)序在mRNA表達(dá)譜的應(yīng)用將miRNA的標(biāo)記與線(xiàn)性放大高通量測(cè)序在microRNA中的應(yīng)用高通量、低成本易于尋找新片段及作用位點(diǎn)10高通量測(cè)序在microRNA中的應(yīng)用高通量、低成本10高通量測(cè)序在CHIP-CHIP的應(yīng)用相對(duì)refseq，染色質(zhì)免疫沉淀以后的DNA直接進(jìn)行測(cè)序,可以直接獲得蛋白與DNA結(jié)合的位點(diǎn)信息相對(duì)ChIP-chip,ChIP-seq可以檢測(cè)更小的結(jié)合區(qū)段、未知的結(jié)合位點(diǎn)、結(jié)合位點(diǎn)。11高通量測(cè)序在CHIP-CHIP的應(yīng)用相對(duì)refseq，染色高通量測(cè)序在甲基化的應(yīng)用對(duì)于DNA甲基化的檢測(cè)，目前采用：甲基化DNA富集并結(jié)合高通量測(cè)序，可以檢測(cè)到全基因組范圍內(nèi)的甲基化現(xiàn)象。特點(diǎn)：高效，準(zhǔn)確12高通量測(cè)序在甲基化的應(yīng)用對(duì)于DNA甲基化的檢測(cè)，目前采用：甲特異片段測(cè)序血漿DNA測(cè)序游離RNA測(cè)序13特異片段測(cè)序血漿DNA測(cè)序13未來(lái)----高通量測(cè)序會(huì)成為臨床輔助工具致病基因堿基突變14未來(lái)----高通量測(cè)序會(huì)成為臨床輔助工具致病基因14Thankyou！15Thankyou！15高通量測(cè)序的應(yīng)用16高通量測(cè)序的應(yīng)用1高通量測(cè)序的用途17高通量測(cè)序的用途2高通量測(cè)序的用途基因組序列的物種進(jìn)行重測(cè)序，鑒定SNP，indel及基因組結(jié)構(gòu)變化；對(duì)含有全基因組序列且轉(zhuǎn)錄本注釋較好的物種開(kāi)展轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究，解析細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的數(shù)量變化及其結(jié)構(gòu)信息。18高通量測(cè)序的用途基因組序列的物種進(jìn)行重測(cè)序，鑒定SNP，in高通量測(cè)序現(xiàn)狀

第二代測(cè)序技術(shù)，又稱(chēng)超高通量測(cè)序。目前，科學(xué)家正為1000美元完成一個(gè)基因組測(cè)序而努力。多家研究單位正在為此展開(kāi)競(jìng)爭(zhēng)，而且進(jìn)展比預(yù)期的更快。19高通量測(cè)序現(xiàn)狀

第二代測(cè)序技術(shù)，又稱(chēng)超高通量測(cè)序。目前，科學(xué)高通量測(cè)序原理高通量測(cè)序方法原理示意圖20高通量測(cè)序原理高通量測(cè)序方法原理示意圖5高通量測(cè)序平臺(tái)高通量測(cè)序的三大平臺(tái)：Illumina公司的Solexa測(cè)序儀，羅氏公司(Roche)的454測(cè)序儀，ABI公司的SOLiD測(cè)序儀21高通量測(cè)序平臺(tái)高通量測(cè)序的三大平臺(tái)：6高通量測(cè)序特點(diǎn)速度快通量高結(jié)果一致性好簡(jiǎn)便高效22高通量測(cè)序特點(diǎn)速度快7高通量測(cè)序在基因組上應(yīng)用應(yīng)用于人基因組重測(cè)序動(dòng)植物、細(xì)菌基因組測(cè)序23高通量測(cè)序在基因組上應(yīng)用應(yīng)用于人基因組重測(cè)序8高通量測(cè)序在mRNA表達(dá)譜的應(yīng)用將miRNA的標(biāo)記與線(xiàn)性放大相結(jié)合，只需要幾皮克純化的miRNA就能獲得高敏感度的miRNA芯片表達(dá)譜。24高通量測(cè)序在mRNA表達(dá)譜的應(yīng)用將miRNA的標(biāo)記與線(xiàn)性放大高通量測(cè)序在microRNA中的應(yīng)用高通量、低成本易于尋找新片段及作用位點(diǎn)25高通量測(cè)序在microRNA中的應(yīng)用高通量、低成本10高通量測(cè)序在CHIP-CHIP的應(yīng)用相對(duì)refseq，染色質(zhì)免疫沉淀以后的DNA直接進(jìn)行測(cè)序,可以直接獲得蛋白與DNA結(jié)合的位點(diǎn)信息相對(duì)ChIP-chip,ChIP-seq可以檢測(cè)更小的結(jié)合區(qū)段、未知的結(jié)合位點(diǎn)、結(jié)合位點(diǎn)。26高通量測(cè)序在CHIP-CHIP的應(yīng)用相對(duì)refseq，染色高通量測(cè)序在甲基化的應(yīng)用對(duì)于DNA甲基化的檢測(cè)，目前采用：甲基化DNA富集并結(jié)合高通量測(cè)序，可以檢測(cè)到全基因組范圍內(nèi)的甲基化現(xiàn)象。特點(diǎn)：高效，準(zhǔn)確27高通量測(cè)序在甲基化的應(yīng)用對(duì)于DNA甲基化的檢測(cè)，目前采用：甲特異片段測(cè)序血漿DNA測(cè)序游離