《細菌的生態(tài)特性》課件

細菌的生態(tài)特性微小生命無限影響課程目標了解細菌的生態(tài)學重要性認識細菌在自然界的基本作用掌握細菌的主要生態(tài)特征理解細菌的適應性與生存策略認識細菌在生態(tài)系統(tǒng)中的作用細菌的發(fā)現(xiàn)歷史1列文虎克的貢獻1676年首次觀察到微生物2巴斯德的開創(chuàng)性工作證明微生物存在并研究其作用3科赫的純培養(yǎng)技術建立微生物研究方法論基礎細菌的基本特征大小和形態(tài)通常為0.5-5微米球形、桿形、螺旋形等多種形態(tài)結構特點無細胞核的原核生物具有細胞壁和細胞膜部分具有莢膜和鞭毛細菌的多樣性10K+已知種類已正式命名和描述的細菌種類1T+總體估計地球上可能存在的細菌種類總數(shù)99%未發(fā)現(xiàn)比例尚未被人類發(fā)現(xiàn)和研究的細菌細菌的生存環(huán)境土壤每克土壤含數(shù)十億細菌分解有機質(zhì)、固氮、改善土壤結構水體淡水和海洋中大量存在參與水質(zhì)凈化和食物鏈循環(huán)空氣以氣溶膠形式存在通過空氣傳播擴散極端環(huán)境熱泉、深海、鹽湖、冰川展現(xiàn)驚人適應能力細菌的生態(tài)適應性溫度適應從冰點以下到100℃以上都有細菌生存pH值適應從強酸性到強堿性環(huán)境均有細菌分布鹽度適應從淡水到飽和鹽水都存在適應的細菌壓力適應從常壓到深海高壓環(huán)境均有細菌生存細菌的營養(yǎng)方式自養(yǎng)細菌能利用無機物合成有機物通過光能或化學能固定CO?是生態(tài)系統(tǒng)中的初級生產(chǎn)者異養(yǎng)細菌依賴外源有機物質(zhì)獲取營養(yǎng)分解有機物獲取能量和碳源在物質(zhì)循環(huán)中起分解者作用自養(yǎng)細菌的生態(tài)作用光合自養(yǎng)細菌藍細菌、紫色細菌等利用光能合成有機物產(chǎn)生氧氣，貢獻全球約30%的光合作用化能自養(yǎng)細菌硝化細菌、硫細菌等利用無機化合物氧化釋放能量參與氮、硫等元素的生物地球化學循環(huán)異養(yǎng)細菌的生態(tài)作用腐生細菌分解死亡有機物釋放養(yǎng)分回到生態(tài)系統(tǒng)寄生細菌在宿主體內(nèi)生活并獲取營養(yǎng)可能引起疾病共生細菌與宿主互利共生如根瘤菌、腸道菌群細菌的生長曲線1延滯期細菌適應環(huán)境，準備分裂2對數(shù)期細菌快速分裂，數(shù)量指數(shù)增長3穩(wěn)定期新生細胞與死亡細胞數(shù)量平衡4衰亡期養(yǎng)分耗盡，代謝產(chǎn)物積累，死亡率增加影響細菌生長的環(huán)境因素溫度影響酶活性和代謝速率每種細菌有最適生長溫度范圍pH值影響細胞膜功能和酶活性多數(shù)細菌喜好中性pH環(huán)境氧氣決定呼吸方式好氧、厭氧、兼性厭氧菌營養(yǎng)物質(zhì)碳源、氮源、磷源等生長必需的物質(zhì)基礎細菌的繁殖方式二分裂最常見的無性繁殖方式細胞DNA復制后分裂為兩個子細胞理想條件下20分鐘可完成一次分裂芽殖少數(shù)細菌的繁殖方式母細胞表面形成小芽，發(fā)育成新細胞孢子形成抵抗不良環(huán)境的生存策略形成耐熱、耐干燥、耐輻射的休眠體細菌的群體行為群體感應通過釋放信號分子感知種群密度協(xié)調(diào)群體行為如生物發(fā)光調(diào)控基因表達生物膜形成細菌附著于表面形成復雜結構產(chǎn)生胞外多糖物質(zhì)增強抗逆性和抵抗性自然界和醫(yī)學領域廣泛存在細菌的運動能力趨化性向有利環(huán)境移動，遠離有害環(huán)境鞭毛運動利用鞭毛旋轉產(chǎn)生推進力滑動運動分泌黏液或利用特殊結構滑行細菌與其他微生物的相互作用競爭關系爭奪共同資源和生態(tài)位分泌抗生素抑制競爭者協(xié)同關系代謝產(chǎn)物互相利用形成互利共生群落捕食關系原生動物捕食細菌細菌被噬菌體感染細菌與植物的相互作用根際微生物促進植物生長，提高養(yǎng)分吸收植物病原菌引起植物疾病，導致作物減產(chǎn)固氮菌與豆科植物共生，將大氣氮轉化為氨植物保護菌產(chǎn)生抗菌物質(zhì)，抵抗病原體細菌與動物的相互作用腸道微生物群提供營養(yǎng)和免疫保護病原菌可引起感染性疾病共生細菌助消化和防御病原體細菌在土壤生態(tài)系統(tǒng)中的作用有機質(zhì)分解將復雜有機物轉化為簡單化合物養(yǎng)分循環(huán)參與碳、氮、磷等元素的轉化土壤結構改善分泌胞外物質(zhì)增強土壤團粒結構生物防控抑制土傳病原體，保護植物健康細菌在水生生態(tài)系統(tǒng)中的作用水質(zhì)凈化分解有機污染物，降解毒素食物鏈基礎作為微型食物網(wǎng)的重要組成部分生物地球化學循環(huán)驅(qū)動水體中元素轉化與能量流動生態(tài)系統(tǒng)平衡調(diào)節(jié)水生環(huán)境中的生物群落結構細菌在大氣中的作用大氣成分調(diào)節(jié)影響溫室氣體濃度參與大氣化學反應云凝結核促進云滴形成影響降水過程大氣污染物降解分解有機揮發(fā)物凈化大氣環(huán)境細菌在碳循環(huán)中的作用細菌在氮循環(huán)中的作用氮的固定將大氣中N?轉化為氨硝化作用將氨氧化為硝酸鹽反硝化作用將硝酸鹽還原為N?氨化作用有機氮轉化為銨細菌在硫循環(huán)中的作用硫的氧化硫化物→硫→硫酸鹽如硫桿菌屬硫的還原硫酸鹽→硫化氫如硫酸鹽還原菌有機硫轉化有機硫化合物的合成與分解硫代謝的多樣化途徑細菌在磷循環(huán)中的作用1有機磷的礦化將有機磷轉化為無機磷酸鹽2磷的可溶化釋放土壤中不溶性磷酸鹽3磷的固定將可溶性磷轉變?yōu)榧毎M分4磷的再循環(huán)細菌死亡分解釋放體內(nèi)磷細菌在極端環(huán)境中的適應嗜熱菌生長適溫50-80℃以上熱穩(wěn)定酶系統(tǒng)嗜冷菌能在0℃以下生長膜脂肪酸不飽和度高嗜鹽菌適應高鹽環(huán)境滲透調(diào)節(jié)能力強嗜酸菌和嗜堿菌分別適應極酸極堿環(huán)境pH平衡調(diào)節(jié)機制細菌的抗逆性機制芽胞形成產(chǎn)生高度抗逆的休眠結構休眠狀態(tài)代謝活動降至最低維持生存應激反應感知環(huán)境脅迫并迅速調(diào)整代謝基因表達調(diào)控激活抗逆相關基因應對環(huán)境變化細菌的基因水平轉移轉化作用吸收環(huán)境中的外源DNA1接合作用通過直接接觸傳遞質(zhì)粒轉導作用噬菌體介導的基因轉移細菌的進化與適應突變DNA序列隨機變化提供遺傳變異基礎自然選擇適應環(huán)境的基因型被保留適應性進化的核心機制水平基因轉移跨物種的基因交流加速進化和適應過程細菌在生物地球化學循環(huán)中的作用生態(tài)平衡維持調(diào)節(jié)生態(tài)系統(tǒng)功能穩(wěn)定能量流動能量在生態(tài)系統(tǒng)中的傳遞和轉化元素轉化C、N、P、S等元素的氧化還原與轉移細菌與氣候變化溫室氣體的產(chǎn)生與消耗甲烷、二氧化碳、氧化亞氮產(chǎn)甲烷菌與甲烷氧化菌平衡碳匯作用微生物固碳減緩大氣CO?增加土壤和海洋中的細菌固碳作用氣候反饋機制氣候變化影響細菌活性細菌活性變化反過來影響氣候細菌在環(huán)境污染治理中的應用生物修復利用細菌降解污染物石油泄漏、重金屬污染廢水處理活性污泥法中微生物作用降解有機污染物有機污染物降解分解農(nóng)藥、塑料、持久性有機物轉化有毒物質(zhì)為無害產(chǎn)物細菌在農(nóng)業(yè)中的應用生物肥料固氮菌、解磷菌增加養(yǎng)分有效性生物農(nóng)藥蘇云金芽孢桿菌防治害蟲土壤改良改善土壤結構和健康作物保護誘導植物抗病性細菌在工業(yè)中的應用發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)酒精、乳酸、氨基酸等生物能源生產(chǎn)生物燃料、沼氣、氫氣生物塑料制造可降解塑料替代品工業(yè)酶制品洗滌劑、紡織品、造紙用酶細菌在醫(yī)藥領域的應用抗生素生產(chǎn)鏈霉素、四環(huán)素等疫苗開發(fā)滅活菌苗、減毒活菌苗益生菌制品雙歧桿菌、乳酸菌制劑基因治療載體工程細菌傳遞治療基因細菌與人類健康人體微生物組人體攜帶約39萬億個微生物細胞超過人體細胞數(shù)量基因數(shù)量是人類基因組的100倍以上益生菌作用維持腸道菌群平衡增強免疫功能輔助營養(yǎng)物質(zhì)吸收合成維生素K和部分B族維生素病原菌防控預防感染性疾病傳播食品安全監(jiān)測抗菌藥物合理使用細菌耐藥性問題應對策略抗生素管理和新藥研發(fā)耐藥性傳播通過水平基因轉移迅速擴散耐藥機制酶降解、外排系統(tǒng)、靶點變異新興病原菌發(fā)現(xiàn)與鑒定分子生物學和基因組學技術新病原體快速檢測方法傳播途徑跨物種傳播環(huán)境變化促進新病原體出現(xiàn)防控措施全球監(jiān)測網(wǎng)絡快速響應和疫苗開發(fā)細菌在食品安全中的角色食品腐敗分解食品營養(yǎng)成分產(chǎn)生異味和毒素食源性病原菌沙門氏菌、李斯特菌引起食物中毒發(fā)酵食品生產(chǎn)奶酪、酸奶、泡菜提高食品風味和保存性細菌生態(tài)學研究方法培養(yǎng)法傳統(tǒng)分離純培養(yǎng)技術2分子生物學方法PCR、DGGE、FISH等技術宏基因組學方法直接測序環(huán)境樣本全部DNA單細胞技術研究個體細胞基因組和功能細菌群落結構分析變形菌門厚壁菌門擬桿菌門放線菌門其他多樣性指數(shù)評估群落結構種群動態(tài)反映環(huán)境變化功能基因分析揭示生態(tài)過程細菌生態(tài)位理論生態(tài)位概念細菌在生態(tài)系統(tǒng)中的功能角色資源利用和環(huán)境適應范圍生態(tài)位分化不同細菌種類發(fā)展特殊功能減少競爭提高共存可能性生態(tài)位重疊多種細菌共同利用相似資源競爭或協(xié)同關系形成細菌種群動態(tài)種群增長模型預測細菌數(shù)量變化密度依賴性限制無限增長種間競爭塑造群落結構細菌群落演替1原始演替在全新環(huán)境中建立群落如新形成的火山巖上2次生演替擾動后群落的恢復過程如土壤污染后的恢復3演替機制先鋒物種改變環(huán)境促進后續(xù)物種定植4穩(wěn)定群落最終形成相對穩(wěn)定的平衡狀態(tài)多樣性和功能最優(yōu)化細菌在生物修復中的應用石油污染修復降解烴類化合物重金屬污染修復吸附、轉化有毒重金屬有機污染物降解分解農(nóng)藥、染料、塑料放射性物質(zhì)處理微生物固定放射性元素細菌與生物控制害蟲生物防治蘇云金芽孢桿菌產(chǎn)生的晶體蛋白對鱗翅目昆蟲有選擇性毒性環(huán)境友好型害蟲控制方法植物病害防控拮抗細菌抑制病原微生物生長誘導植物產(chǎn)生系統(tǒng)抗性減少化學農(nóng)藥使用生態(tài)平衡維持保持有益微生物群落多樣性通過微生物調(diào)控防止病蟲害爆發(fā)細菌與生物地理學分布格局全球范圍內(nèi)的細菌分布規(guī)律擴散機制風力、水流、生物載體傳播地理隔離效應獨特環(huán)境促進細菌特化細菌與生態(tài)系統(tǒng)功能能量流動維持生態(tài)系統(tǒng)能量傳遞有機質(zhì)分解將復雜有機物轉化為簡單物質(zhì)初級生產(chǎn)力光合細菌固定碳源細菌與生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定性3X穩(wěn)定性提升高多樣性系統(tǒng)比低多樣性更穩(wěn)定40%功能冗余度多種細菌可執(zhí)行相同生態(tài)功能2X恢復能力多樣化細菌群落更快從干擾中恢復細菌與生態(tài)工程人工濕地利用微生物凈化污水去除氮磷和有機污染物生物濾池微生物膜處理廢氣降解揮發(fā)性有機物生態(tài)堤壩微生物群落穩(wěn)定土壤結構防止水土流失細菌與全球變化碳循環(huán)反饋溫度上升影響土壤微生物呼吸加速或減緩氣候變化海洋酸化影響改變海洋微生物群落結構影響海洋碳泵功能土壤微生物組變化影響植物生長和養(yǎng)分循環(huán)改變生態(tài)系統(tǒng)生產(chǎn)力細菌與生物多樣性保護微生物多樣性評估基因組測序與環(huán)境監(jiān)測確定保護優(yōu)先級保護策略原位保護自然環(huán)境中的微生物群落關注特殊生態(tài)系統(tǒng)微生物生物資源庫建設收集保存重要細菌資源建立基因和菌種資源中心細菌在環(huán)境監(jiān)測中的應用1生物指示劑敏感菌群反映環(huán)境變化2生態(tài)毒理學評價細菌測試評估污染物毒性3環(huán)境質(zhì)量評估群落結構變化指示環(huán)境健康4預警系統(tǒng)細菌傳感器監(jiān)測水質(zhì)變化細菌與生態(tài)系統(tǒng)服務調(diào)節(jié)服務氣候調(diào)節(jié)、水質(zhì)凈化、土壤形成供給服務食品生產(chǎn)、藥物來源、生物材料文化服務科研教育、生態(tài)旅游資源細菌與生態(tài)系統(tǒng)管理微生物資源利用可持續(xù)開發(fā)細菌資源生態(tài)系統(tǒng)健康評估細菌群落作為健康指標可持續(xù)管理策略基于生態(tài)原理的微生物調(diào)控生態(tài)平衡維持促進有益菌群平衡發(fā)展細菌生態(tài)學前沿研究單細胞技術揭示個體差異合成生物學構建人工生態(tài)系統(tǒng)微生物組學研究整體功能細菌生態(tài)學面臨的挑戰(zhàn)1未可培養(yǎng)微生物研究99%環(huán)境細菌難以實驗室培養(yǎng)功能預測與驗證基因存在不等于功能表達生態(tài)系統(tǒng)復雜性無數(shù)生物間相互作用網(wǎng)絡難以模擬細菌生態(tài)學的未來展望跨學科研究生態(tài)學、分子生物學、生物信息學結合全方位理解微