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年白芍行業(yè)技術(shù)分析:白芍為中藥現(xiàn)代化發(fā)展奠定基礎(chǔ)慢性萎縮性胃炎作為胃癌前病變,嚴(yán)峻威逼人類健康,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)在其治療藥物上缺乏公認(rèn)有效的方案,而中醫(yī)藥在該疾病治療方面呈現(xiàn)出獨(dú)特優(yōu)勢與潛力。近年來,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接技術(shù)的進(jìn)展,為深化探究中藥治療疾病的作用機(jī)制供應(yīng)了新途徑,諸多討論借助這些技術(shù)挖掘中藥活性成分和作用靶點(diǎn),為中藥現(xiàn)代化進(jìn)展奠定基礎(chǔ)。在此背景下,對柴胡-白芍治療慢性萎縮性胃炎作用機(jī)制的討論,有助于進(jìn)一步明確中藥藥對的治療原理,推動中醫(yī)藥在該疾病治療領(lǐng)域的進(jìn)展。

一、篩選白芍與柴胡活性成分及靶點(diǎn),明確藥對基礎(chǔ)信息

《2025-2030年全球及中國白芍行業(yè)市場現(xiàn)狀調(diào)研及進(jìn)展前景分析報告》指出,在討論柴胡-白芍治療慢性萎縮性胃炎的過程中,首要步驟是借助TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選藥物活性成分及靶點(diǎn)。以“柴胡”“白芍”為關(guān)鍵詞,依據(jù)口服生物利用度(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行檢索,最終篩選出柴胡的活性成分12個、白芍的活性成分8個,去重后共得到柴胡-白芍藥對的活性成分19個。同時,獲得柴胡的作用靶點(diǎn)320個,白芍行業(yè)的作用靶點(diǎn)115個,去除重復(fù)靶點(diǎn)后,確定柴胡-白芍藥物作用靶點(diǎn)共190個。通過STRING數(shù)據(jù)庫和Uniprot數(shù)據(jù)庫對藥物靶點(diǎn)的基因名進(jìn)行校正,確保數(shù)據(jù)的精確?????性,這些活性成分和作用靶點(diǎn)為后續(xù)討論藥對治療慢性萎縮性胃炎的機(jī)制供應(yīng)了基礎(chǔ)信息。

二、獵取慢性萎縮性胃炎疾病靶點(diǎn)與交集靶點(diǎn),鎖定潛在作用靶點(diǎn)

為了找到柴胡-白芍藥對與慢性萎縮性胃炎之間的關(guān)聯(lián)靶點(diǎn),討論人員在GeneCards數(shù)據(jù)庫、TTD數(shù)據(jù)庫和OMIM數(shù)據(jù)庫中,設(shè)置關(guān)鍵詞為“chronicatrophicgastritis”,物種限定為“Homosapiens”,篩選并去除重復(fù)靶點(diǎn)后,得到慢性萎縮性胃炎疾病靶點(diǎn)972個。將柴胡-白芍的藥物作用靶點(diǎn)與疾病靶點(diǎn)取交集,借助Venny2.1.0在線平臺獲得二者的交集靶點(diǎn)87個。這些交集靶點(diǎn)是柴胡-白芍藥對可能作用于慢性萎縮性胃炎的潛在靶點(diǎn),為后續(xù)深化討論藥對的作用機(jī)制指明白方向。

三、構(gòu)建中藥-活性成分-交集靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),篩選白芍相關(guān)主要活性成分

將中藥、活性成分和交集靶點(diǎn)等信息導(dǎo)入Cytoscape3.9.1平臺,構(gòu)建中藥-活性成分-交集靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖。經(jīng)過網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析,該網(wǎng)絡(luò)圖共有107個節(jié)點(diǎn)和211條邊。通過對網(wǎng)絡(luò)圖的分析,依據(jù)度值大小篩選出主要活性成分,其中度值排名前五的活性成分是槲皮素、山柰酚、異鼠李素、β-谷甾醇、豆甾醇。這表明白芍中的部分活性成分在柴胡-白芍藥對治療慢性萎縮性胃炎中可能發(fā)揮著關(guān)鍵作用,這些主要活性成分將成為后續(xù)討論的重點(diǎn)對象。

四、構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),確定白芍相關(guān)核心靶點(diǎn)

運(yùn)用STRING數(shù)據(jù)庫對87個交集靶點(diǎn)進(jìn)行蛋白交互分析,在Cytoscape3.9.1平臺中構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖,該網(wǎng)絡(luò)圖由872個節(jié)點(diǎn)和1900條邊交互組成。借助拓?fù)浞治霁C取網(wǎng)絡(luò)圖相關(guān)數(shù)據(jù),依據(jù)度值大小篩選出核心靶點(diǎn),其中排名前五的AKT1、JUN、TNF、CASP3和IL-6是柴胡-白芍治療慢性萎縮性胃炎的核心靶點(diǎn)。這些核心靶點(diǎn)在細(xì)胞的生長、增殖、代謝、免疫反應(yīng)以及凋亡等多種生理過程中發(fā)揮著重要作用,白芍與柴胡可能通過作用于這些核心靶點(diǎn)來實(shí)現(xiàn)對慢性萎縮性胃炎的治療。

五、進(jìn)行GO功能與KEGG通路富集分析,解析白芍作用機(jī)制

借助David數(shù)據(jù)庫對交集靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能和KEGG通路富集分析。GO功能富集分析結(jié)果顯示,柴胡-白芍藥對治療慢性萎縮性胃炎相關(guān)靶點(diǎn)共涉及718個條目,其中生物過程(BP)共富集到557個條目,主要涉及基因表達(dá)的正向調(diào)控、凋亡過程的負(fù)向調(diào)控、對外源性刺激的反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)等;細(xì)胞組分(CC)共富集到61個條目,主要涉及細(xì)胞外空間、胞液、含蛋白復(fù)合物、細(xì)胞漿等;分子功能(MF)共富集到100個條目,主要涉及酶結(jié)合、相同的蛋白質(zhì)結(jié)合、蛋白質(zhì)結(jié)合、泛素蛋白連接酶結(jié)合等。KEGG通路富集分析共富集到158個條目,主要涉及癌癥通路、IL-17信號通路、TNF信號通路等。這些結(jié)果表明白芍與柴胡組成的藥對在治療慢性萎縮性胃炎過程中,通過參加多種生物過程、作用于不同的細(xì)胞組分和分子功能,以及調(diào)控多條信號通路來發(fā)揮作用。

六、分子對接驗證,明確白芍活性成分與核心靶點(diǎn)結(jié)合活性

通過PubChem數(shù)據(jù)庫獵取主要活性成分的2D結(jié)構(gòu),運(yùn)用Chem3D19.0軟件將其轉(zhuǎn)換為3D結(jié)構(gòu),并調(diào)整至最低能量狀態(tài)。在RCSBPDB數(shù)據(jù)庫中檢索、下載核心靶點(diǎn)的晶體結(jié)構(gòu),運(yùn)用PyMol3.2軟件去除水分子和殘基配體,在AutoDockTools-1.5.7軟件進(jìn)行分子對接。結(jié)果顯示,主要活性成分與核心靶點(diǎn)具有較好的結(jié)合活性,其中槲皮素、山柰酚、異鼠李素與AKT1、CASP3的結(jié)合能均-7.0kcal/mol,說明它們的結(jié)合活性較強(qiáng)。這進(jìn)一步證明了白芍中的活性成分能夠與核心靶點(diǎn)穩(wěn)定結(jié)合,從而發(fā)揮治療慢性萎縮性胃炎的作用。

綜上所述,本討論運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接技術(shù),深化探究了柴胡-白芍藥對治療慢性萎縮性胃炎的作用機(jī)制。討論發(fā)覺,柴胡-白芍藥對可能通過槲皮素、山柰酚、異鼠李素、β-谷甾醇、豆甾醇等主要活性成分,作用于AKT1、JUN、TNF、CASP3、IL-6等核心靶點(diǎn),通過調(diào)控IL-17、TNF信號通路發(fā)揮免疫作用,進(jìn)而修復(fù)胃黏膜防備因子,達(dá)到治療慢性萎縮性胃炎的目的。該討論為白芍行業(yè)在慢性萎縮性胃炎治療中的應(yīng)用供應(yīng)了理論依據(jù),也為后續(xù)開發(fā)基于柴胡-白芍的治療藥物奠定了基礎(chǔ),同時有助于推動中醫(yī)藥在慢性萎縮性胃炎治療領(lǐng)域的進(jìn)一步進(jìn)展。

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