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文檔簡介
多肽化學(xué)已經(jīng)走過了一百多年的光輝歷程,1902年,EmilFischer首先起先關(guān)注多肽合成,
由于當(dāng)時(shí)在多肽合成方面的學(xué)問太少,進(jìn)展也相當(dāng)緩慢當(dāng)時(shí)合成采納了苯甲酰,乙酰愛護(hù),
脫去相當(dāng)困難,而且簡潔導(dǎo)致肽鏈斷裂。直到1932年,MaxBergmann等人起先運(yùn)用節(jié)氧鍛
基(Z)來愛護(hù)a-氨基,該愛護(hù)基可以在催化氫化或氫澳酸的條件下定量脫除,多肽合成才
起先有了肯定的發(fā)展。到了20世紀(jì)50年頭,隨著越來越多的生物活性多肽的發(fā)覺,大大推
動(dòng)了有機(jī)化學(xué)家們對(duì)■多肽合成方法以與愛護(hù)基的探討,因此這一階段的探討成果也特別豐富,
人們合成了大量的生物活性多肽,包括催產(chǎn)素(oxylocin),胰島素等,同時(shí)在多肽合成方
法以與氨基酸愛護(hù)基上面也取得了不少成果,這為后來的固相合成方法的出現(xiàn)也供應(yīng)了試驗(yàn)
和理論基礎(chǔ)。也就是這個(gè)階段,F(xiàn)redSanger獨(dú)倉U了氨基酸序列測(cè)定方法,并為此獲得了1958
年的Nobel化學(xué)獎(jiǎng)。還是他后來獨(dú)創(chuàng)了DNA序列檢測(cè)方法,并于1980年再次獲得了Nobel
化學(xué)獎(jiǎng),成為到目前為止唯一獲得兩次Nobel化學(xué)獎(jiǎng)的科學(xué)家。1963年,Merrifield提出了
固相多肽合成方法(SPPS),這個(gè)在多肽化學(xué)匕具有里程碑竟義的合成方法,一出來.就
由于其合成便利,快速,現(xiàn)在已經(jīng)成為多肽合成的首選方法,隨后的發(fā)展也證明白該方法不
僅僅是一種合成方法,而且也帶來了有機(jī)合成上的一次革命,并成為了一支獨(dú)立的學(xué)科,固
相有機(jī)合成(SPOS)。當(dāng)然,Merrifield也因此榮獲了1984年的Nobel化學(xué)獎(jiǎng)。也正是Merrifield,
他經(jīng)過了反復(fù)的篩選,最終屏棄了茉氧默基(Z)在固相上的運(yùn)用,首先將叔丁氧城基(BOC)
用于愛護(hù)*氨基并在固相多肽合成上運(yùn)用,其可以在酸性條件下定量的脫除,反應(yīng)也特別
快速,在30min就可以反應(yīng)完仝。由于叔丁氧埃基(BOC)方法中,氨基酸側(cè)鏈的愛護(hù)基
團(tuán)大多基于葦基(Bzl),因此也稱為BOC-Bzl策略。同時(shí),Merrifield在20世紀(jì)60年頭末
獨(dú)創(chuàng)了第一臺(tái)全自動(dòng)多肽合成儀,并首次合成生物蛋白酶,核糖核酸兩(124個(gè)氨基酸)。
隨后的多肽化學(xué)探討主要集中在固相合成樹脂,多肽縮合試劑,氨基酸愛護(hù)基的探討。1972,
LouCarpino首先將9-防甲氮默基(FMOC)用于愛護(hù)a-氨基,其在堿性條件下可以快速脫
除,10min就可以反應(yīng)完全,而且由于其反應(yīng)條件溫柔,快速得到廣泛運(yùn)用,到了20世紀(jì)
80年頭取代了叔丁氧談基(BOC),成為了固相多肽合成中的首選合成方法。該方法中敘
基酸的側(cè)性大多基于叔丁基(But),因此,也稱為FMOC-But策略。同時(shí),在多肽合成樹
脂,縮合試劑以與氨基酸愛護(hù),包括合成環(huán)肽的氨基酸上交愛護(hù)上也取得了豐碩的成果。
進(jìn)入21世紀(jì),隨著蛋白質(zhì)組學(xué)的探討深化,對(duì)于多肽化學(xué)的要求不僅僅是合成方法,而更
多的集中在多肽標(biāo)記與修而方法,以與蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽的合成以與長肽或蛋白合成。
?多肽化學(xué)合成的基本介紹
多肽化學(xué)合成方法,包括液相和固相兩種方法。液相合成方法現(xiàn)在主要采
納BOC和Z兩種愛護(hù)方法,現(xiàn)在主要應(yīng)用在短肽合成,如阿斯巴甜,力
肽,催產(chǎn)素等,其相對(duì)與固相合成,具有愛護(hù)基選擇多,成本低廉,合成
規(guī)模簡潔放大的很多優(yōu)點(diǎn)。與固相合成比較,液相合成主要缺點(diǎn)是,合成
范圍小,一般都集中在1。個(gè)氨基酸以內(nèi)的多肽合成,還有合成中須要對(duì)
中間體進(jìn)行提純,時(shí)間長,工作量大。固相合成方法現(xiàn)在主要采納FMOC
和BOC兩種方法,它具有合成便利,快速,簡潔實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,而且可以
比較簡潔的合成到30個(gè)氨基酸左右多肽。
1.1.氨基酸愛護(hù)基
20種常見氨基酸,依據(jù)側(cè)鏈可以分為幾類:脂肪族氨基酸(Ala,Gly,
Vai,Leu,He,),芳香族氨基酸(Phe,Tyr,Trp,His),酰胺或竣
基側(cè)鏈氨基酸(Asp,Glu,Asn,Gin),堿性側(cè)鏈氨基酸(Lys,Arg),
含硫氨基酸(Cys,Met),含醇氨基酸(Ser,Thr),亞氨型基酸(Pro)。
多肽化學(xué)合成中氨基酸的愛護(hù)特別關(guān)鍵,干脆確定了合成能夠勝利的關(guān)鍵。
因?yàn)槌R姷?0中氨基酸中有很多都是帶有活性側(cè)鏈的,須要進(jìn)行愛護(hù),
一般要求,這些愛護(hù)基在合成過程中穩(wěn)定,無副反應(yīng),合成結(jié)束后可以完
全定量的脫除。合成中須要進(jìn)行愛護(hù)的痣基酸包括:Cys,Asp,Glu,
His,Lys,Asn,Gin,Arg,Ser,Thr,Trp,Tyr。須要進(jìn)行愛護(hù)的基
團(tuán):羥基,竣基,琉基,氨基,酰胺基,胭基,口引味,咪哇等。其中Trp
也可以不愛護(hù),因?yàn)橛肐噪性質(zhì)比較穩(wěn)定。當(dāng)然在特殊的狀況下,有些氨基
酸也可以不愛護(hù),象,Asn,Gin,Thr,Tyro
表1常見3種氨基脫除條件
TFAHBr/TFAH2/Pd-CPiperidine/DMF
Bocyynn
Znyyn
Fmocnyny
圖1常見3種氨基愛護(hù)基結(jié)構(gòu)
氨基酸側(cè)鏈愛護(hù)基團(tuán)特別多,同一個(gè)側(cè)鏈有多種不同的愛護(hù)基,可以在不
同的條件下選擇性的脫除,這點(diǎn)在環(huán)肽以與多肽修飾上具有很重要的意義。
而且側(cè)鏈愛護(hù)基和選擇的合成方法有親密的關(guān)系,液相和固相不一樣,固
相中BOC和FMOC策略也不一樣,從某種意義上看,多肽化學(xué)就是氨基
酸愛護(hù)基的敏捷運(yùn)用與搭配。關(guān)于側(cè)鏈愛護(hù)基的運(yùn)用,請(qǐng)參考王德心的《固
相有機(jī)合成一一原理與應(yīng)用指南》第四章,我們這里主要介紹Cys,Lys,
Asp的幾種愛護(hù)基與其脫除方法。Cys最常見的愛護(hù)基有三種,Trt,Acm,
Mob,這三個(gè)愛護(hù)基可以完成多對(duì)二硫鍵多肽的合成。Lys最常見的愛護(hù)
基有:Boc,Fmoc,Trt,Dde,Allyl,這對(duì)于固相合成環(huán)肽供應(yīng)了很多
正交的愛護(hù)策略。Asp最常見的愛護(hù)基有:Otbu,OBzl,OMe,OA11,
OFm,同樣也供應(yīng)了多種正交的愛護(hù)策略。
表2琉基常見愛護(hù)基
結(jié)構(gòu)脫除條件
簡稱
TrtQTFA,HCl/HOAc,
I2/MeOH
AcmI2/MeOH,Hg2+
MobHF,TFMSA,Hg2+
表3氨基常見愛護(hù)基
結(jié)構(gòu)脫除條件
簡稱
TrtQTFA,HOAc,HCOOH
Boc0HCl/HOAc,
—|-0-U-
TFA/DCM
FmocPip/DMF,
NaOH/MeOH
0
DdeH2NNH2/DMF
AllylPd(Ph3P)4,嗎咻/THF
表3竣基常見愛護(hù)基
結(jié)構(gòu)脫除條件
簡稱
OtbuITFA,HOAc,HCOOH
OBzlH2/Pd,HF,TFMSA
OMe§—0-CHaNaOH/MeOH
OA11卜。^XPd(Ph3P)4,nW/THF
OFm2名Pip/DMF,DBU/DMF
1.2.多肽縮合試劑
目前多肽合成中,主要采納竣基活化方法來完成接肽反應(yīng),最早運(yùn)用的是
將氨基酸活化為酰氯,疊氮,對(duì)稱酸酊以與混合酸酊的方法,但是由于這
些條件下,存在氨基酸消旋,以與反應(yīng)試劑危急以與制備比較困難,漸漸
被后來的縮合試劑取代,依據(jù)其結(jié)構(gòu)可以分為兩種:縮合試劑主要有:碳
二亞胺型,^鹽型(Uronium)。
1.2.1,碳二亞胺型
主要包括:DCC,DIC,EDC.HC1等。采納DCC進(jìn)行反應(yīng),由于反應(yīng)
中生成的DCU,在DMF中溶解度很小,產(chǎn)生白色沉淀,所以一般不用在
固相合成中,但是由于其價(jià)格便宜,在液相合成中,可以通過過濾除去,
應(yīng)用仍舊相當(dāng)廣泛。EDC.HC1因?yàn)槠渌芙庑缘奶攸c(diǎn),在多肽與蛋白的
連接中運(yùn)用比較多,而且也相當(dāng)勝利。但是該類型的縮合試劑的一個(gè)最大
的缺點(diǎn),就是假如單獨(dú)運(yùn)用,會(huì)有比較多的副反應(yīng),但是探討表明假如在
活化過程中添加HOBt,HOAt等試劑,可以將其副反應(yīng)限制在很低的范
圍。其反應(yīng)機(jī)理如下:
圖2DIC活化反應(yīng)機(jī)理
1.2.2,^鹽型
鹽型縮合試劑反應(yīng)活性高,速度快,現(xiàn)在運(yùn)用特別廣泛,主要包括:HBTU,
TBTU,HATU,PyBOP等。該試劑運(yùn)用過程中須要添加有機(jī)堿,如,二
異丙基乙胺(DIEA),N-甲基嗎琳(NMM),該試劑加入后,才能活化
氨基酸。其反應(yīng)機(jī)理如下:
圖3TBTU活化反應(yīng)機(jī)理
1.3.多肽合成方法比較
1.3.1.液相多肽合成(solutionphasesynthesis)
液相多肽合成現(xiàn)在仍舊廣泛的運(yùn)用,在合成短肽和多肽片段上具有合成規(guī)
模大,合成成本低的顯著優(yōu)點(diǎn),而且由于是在均相中進(jìn)行反應(yīng),可以選擇
的反應(yīng)條件更加豐富,象一些催化氫化,堿性水解等條件,都可以運(yùn)用,
這在固相中,運(yùn)用卻由于反應(yīng)效率低,以與副反應(yīng)等緣由,無法應(yīng)用。液
相多肽合成中主要采納BOC和Z兩種反應(yīng)策略。
0
H2N-CH^-O,
M、
10j。一o
—L-O-^-H-CHC-N-CH^-O
I加加,
射
6=0DCC
?。。彷
A
1NaObiMeOH
2HCI>H0Ac
,
4—OH
盥LoAarv
dH2口
圖4液相合成Glu-Trp
1.3.2.固相多肽合成
1DIEA
2.20%Pip<DMF
1.DIC/H0B!
220%P腹CMF
H^N-CH^-H-CHS-OH
Olu-Trp
圖5FMOC固相合成Ghi-Trp
固相多肽合成現(xiàn)在運(yùn)用的主要有兩種策略:BOC和FMOC兩種。BOC
方法合成過程中,須要反復(fù)運(yùn)用TFA脫BOC,而且在最終從樹脂上切割
下來須要運(yùn)用HF,由于HF必需運(yùn)用特地的儀器進(jìn)行操作,而且切割過
程中簡潔產(chǎn)生副反應(yīng),因此現(xiàn)在運(yùn)用受到試驗(yàn)條件限制,運(yùn)用也漸漸削減。
FMOC方法反應(yīng)條件溫柔,在一般的試驗(yàn)條件下就可以進(jìn)行合成,因此,
也得到了特別廣泛的應(yīng)用。
1.3.2.1.固相合成中常用樹脂
固相合成中樹脂,一般都是聚苯乙烯-二乙烯苯材料,大小在75-150Mm,
交聯(lián)度在1-2%之間,現(xiàn)在運(yùn)用的大多是1%,因?yàn)檫@種交聯(lián)度下,樹脂
在DMF,DCM中具有很好的溶脹性能,立體上是一個(gè)空間網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),反
應(yīng)物分子可以在樹脂內(nèi)部自由移動(dòng)。樹脂中最關(guān)鍵的部分是連接手臂,它
一端連接在樹脂上,一端作為反應(yīng)位點(diǎn)。目前廣泛運(yùn)用的樹脂有:PAM,
MBHA,Wang,2-Cl-Trt,Rink-Amide-MBHA等。其中PAM,MBHA
是用在BOC策略中,因?yàn)槠鋵?duì)酸特別穩(wěn)定,須要在HF,TFMSA等強(qiáng)酸
條件下才能夠切割下來。
PAMRmk-Amtde
圖6固相合成常用樹脂
1.3.2.2.筋三酮檢測(cè)
固相多肽合成中,主要是通過檢測(cè)樹脂上游離氨基來推斷連接效率,檢測(cè)
方法稱為Kaiser方法,其檢測(cè)結(jié)果,假如有游離氨基的時(shí)候,顯示蘭色,
或紅褐色(pro,ser,His)。
Kaiser試劑包括:
A,6%前三酮的乙醇溶液
B,80%苯酚的乙醛溶液
C,2%0.001MKCN的毗I定溶液
配制中的叱咤須要經(jīng)過苛三酮處理后,重蒸后再運(yùn)用。檢測(cè)過程,取少量
樹脂,加入A,B,C各2-3滴,100C下加熱l?2min,假如溶液有蘭
色,或樹脂出現(xiàn)蘭色,紅褐色,表明還有游離氨基,否則說明連接完全。
還有其它檢測(cè)游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,苦味酸法,澳芬蘭法等。
圖7黃三酮檢測(cè)原理
1.3.2.3.固相合成切割方法
固相合成完成之后,必需選擇合適的切割試劑將多肽從樹脂上切割下來,
然后經(jīng)過冰乙酸沉淀,離心收集沉淀,經(jīng)過HPLC分別純化,冷凍干燥得
到最終產(chǎn)品。由于選擇的樹脂不同,氨基酸序列不同,在切割時(shí)候,選擇
的切割方法也不完全相同,一般都是選擇酸性條件下切割的條件,對(duì)于
PAM,MBHA樹脂,一般采納HF切割,切割過程中須要添加對(duì)甲苯酚,
對(duì)瑞基苯酚,苯甲健等試劑。而對(duì)于Wang,Rink-Amide,Trt樹脂,一
般采納TFA切割,切割過程中加入,乙二硫醇,苯甲硫雄,水,三異丙基
硅烷,苯酚等。這些添加試劑主要作為碳正離子俘獲試劑運(yùn)用,目的是俘
獲切割反應(yīng)過程中生成的碳正離子,削減這些碳正離子對(duì)部分氨基酸側(cè)鏈
的進(jìn)攻導(dǎo)致的副反應(yīng),比較簡潔產(chǎn)生副反應(yīng)的氨基酸有:Trp,Tyro切割
試劑用量一般10-15ml/g樹脂。常用的切割配比:
HF/p-cresol/p-thiocresol(90/5/5),TFA/TIS/EDT/H2O
(94/1/2.5/2.5),反應(yīng)一般是在室溫條件下2h-4h。
1.3.3.多肽合成中主要問題
1.3.3.1.消旋與其反應(yīng)機(jī)理
多肽合成過程中,部分氨基酸在活化的過程中會(huì)導(dǎo)致不同程度的消旋,特
殊簡潔消旋的氨基酸有:Cys,His,Phe,當(dāng)然這些消旋化還和溶劑,溫
度以與合成中的有機(jī)堿等因素有關(guān)。對(duì)于這些氨基酸,可以通過采納高效
縮合試劑,削減反應(yīng)時(shí)間,可以削減消旋的比例,一般條件選擇適當(dāng),消
旋化都可以限制在5%以內(nèi)。消旋反應(yīng)機(jī)理如下:
圖8消旋反應(yīng)機(jī)理
1.3.3.2,二酮哌嗪(DKP)反應(yīng)
DKP副反應(yīng)出現(xiàn)在FMOC-Wang樹脂合成過程中,主要出現(xiàn)在第一個(gè)氨
基酸為Pro的時(shí)候,當(dāng)其次個(gè)負(fù)基酸脫FMOC的時(shí)候,a-氨基被游離出
來之后,馬上對(duì)Wang樹脂的節(jié)酯鍵進(jìn)行分子內(nèi)胺解,生成六元環(huán)二酮哌
嗪衍生物,同時(shí)從Wang樹脂上釋放出來,導(dǎo)致反應(yīng)終止。該反應(yīng)特別快
速,文獻(xiàn)報(bào)道采納50%Pip/DMF,脫Imin,4min的條件,但是我們?cè)?/p>
驗(yàn)證明在多數(shù)狀況下,即使是lmin左右反應(yīng)就超過了20%o因此一般在
末端第一個(gè)氨基酸為Pr。的時(shí)候,建議采納2-Cl-Trt樹脂合成,由于該
樹脂巨大的空間阻力,可以完全消退該副反應(yīng)。這個(gè)副反應(yīng)在BOC策略
合成過程中,卻可以完全避開,因?yàn)锽OC在運(yùn)用TFA脫除后,使氨基以
TFA鹽的形式存在,從而失去了親核性,不能進(jìn)攻芳酯鍵。
圖9DKP反應(yīng)機(jī)理
1.3.3.3.困難序列多肽合成
固相多肽合成中也常常遇到多肽合成失敗或合成效率很低的問題,這里面
的主要緣由是由于多肽序列引起的,因?yàn)橛行┒嚯男蛄性跇渲闲纬蒔-
折疊,變更了樹脂的溶脹性能,還有可能將反應(yīng)的活性位點(diǎn)埋藏在樹脂里
面,這樣使得反應(yīng)很難進(jìn)行,目前報(bào)道運(yùn)用的主要方法有:
?運(yùn)用混合溶劑,DMSO/DMF,6N朋噬/DMF溶液
?提高反應(yīng)溫度,或采納微波方法
?運(yùn)用高離液鹽,LiCl,NaClO4等。
?運(yùn)用溶脹性能更好的PEG-PS樹脂,同時(shí)削減樹脂擔(dān)載量
(0.05-0.2mmol/g)
1.4.合成多肽分析鑒定方法
多肽的分析鑒定方法有多肽一級(jí)結(jié)構(gòu),二級(jí)結(jié)構(gòu)鑒定,多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)包括:
質(zhì)譜分析,氨基酸組成分析,氨基酸序列分析。二級(jí)結(jié)構(gòu)包括:圓二色譜
(CD),NMR,X-衍射等方法。
1.4.1.純度分析
多肽的純度分析,一般都采納HPLC進(jìn)行分析,選擇RP-C18,粒徑5|uni,
孔徑300A,4.6X150mm,流淌相:A,0.1%TFA/H2O;B,0.1%
TFA/ACN,洗脫梯度,5%B-65%B,時(shí)間30min。也有些多肽,特殊
是短肽,由于親水性強(qiáng),在C18上保留很弱,須要變更條件,這里主要
有兩種方法:一個(gè)變更分析梯度,可以將起始梯度改為2%,等度或小梯
度洗脫;另外一個(gè)方法是在流淌相中加入強(qiáng)離子對(duì)試劑,如七氟丁酸,十
八烷基磺酸鈉等。
1.4.2.一級(jí)結(jié)構(gòu)分析
1.4.2.1.質(zhì)譜分析
質(zhì)譜分析的目的主要是確證分子量,當(dāng)然采納MS/MS可以部分的了解多
肽序列的信息,但是這個(gè)須要比較全的數(shù)據(jù)庫作為基礎(chǔ),分析才能比較精
確。由于多肽性質(zhì)不穩(wěn)定,須要采納軟電離技術(shù),目前多肽分析主要運(yùn)用
了電噴霧(ESI-MS),基質(zhì)協(xié)助激光解吸(MALDI-MS)。其中ESI-MS
通常會(huì)給出多電荷峰,電荷數(shù)目和多肽序列上氨基,服基,咪哇基的數(shù)目
有關(guān),因此,常常給出了雙電荷,三電荷等離子峰『MALDI-MS可以分
析蛋白大分子,而且通常狀況下很少帶多電荷,因此數(shù)據(jù)干脆對(duì)應(yīng)了分子
離子峰,簡潔分析。此外,通常在分析長肽或蛋白過程中,須要添加NH4,
Na,K等離子,提高靈敏度,所以一般在MS中出現(xiàn)一組峰,分別對(duì)應(yīng):
(M+H)+,(M+NH4)+,(M+Na)+,(M+K)+。
1.4.2.2.氨基酸組成分析
氨基酸組成分析一般須要產(chǎn)品的純度較高,它可以給出多肽中氨基酸的種
類,數(shù)目。分析過程首先通過酸水解破壞肽鍵,典型酸水解的條件是:真
空條件下,110℃,用6M鹽酸水解16至72小時(shí)。酸水解雖然很有用,
但酸水解條件下不能獲得完整的氨基酸分析,因?yàn)樘於0泛凸劝滨0返?/p>
側(cè)鏈含有酰胺鍵,用于切斷蛋白質(zhì)肽鍵的酸也可以將天冬酰胺轉(zhuǎn)換為天冬
氨酸,谷氨酰胺轉(zhuǎn)換為谷氨酸。由于水解溫度比較高,色氨酸的呼噪環(huán)簡
潔被空氣氧化,即使在密封的管中,色氨酸的呼I味環(huán)也幾乎都被破壞了。
因此蛋白質(zhì)的色氨酸含量往往是通過它的紫外汲取光譜估計(jì)的,也可以通
過堿水解分析色氨酸的含量。半胱氨酸在酸水解中也不能精確測(cè)定,要精
確測(cè)量須要在蛋白質(zhì)水解之前進(jìn)行氧化或竣甲基化,形成的衍生物在酸水
解之后才能定量。
1.4.2.3.氨基酸序列分析
氨基酸序列分析的基木原理是Edman降解,主要涉與耦聯(lián)、水解、萃取
和轉(zhuǎn)換等4個(gè)過程。首先運(yùn)用苯異硫劄酸酯(PITC)在pH9.。的堿性條
件下對(duì)蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行處理,PITC與肽鏈的N-端的氨基酸殘基反應(yīng),
形成苯氨基硫甲酰(PTC)衍生物,即PTC-肽。然后PTC-肽用三氟乙酸
處理,N-端氨基酸殘基肽鍵被有選擇地切斷,釋放出該氨基酸殘基的唾理
咻酮苯胺衍生物。接下來將該衍生物用有機(jī)溶劑(例如氯丁烷)從反應(yīng)液
中萃取出來,而去掉了一個(gè)N-端氨基酸殘基的肽仍留在溶液中。萃取出來
的唾座咻酮苯胺衍生物不穩(wěn)定,經(jīng)酸作用,再進(jìn)一步環(huán)化,形成一個(gè)穩(wěn)定
的苯乙內(nèi)酰硫版(PTH)衍生物,即PTH-氨基酸。留在溶液中的削減了
一個(gè)氨基酸殘基的肽再重復(fù)進(jìn)行上述反應(yīng)過程,整個(gè)測(cè)序過程現(xiàn)在都是通
過測(cè)序儀自動(dòng)進(jìn)行。
1.4.3.二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
1.4.3.1.圓二色譜(CD)
圓二色譜是一種特殊的汲取譜,它通過測(cè)量蛋白質(zhì)等生物大分子的圓二色
光譜,從而得到生物大分子的二級(jí)結(jié)構(gòu),簡潔、快捷,廣泛應(yīng)用在蛋白質(zhì)
折疊,蛋白質(zhì)構(gòu)象探討,的動(dòng)力學(xué)等領(lǐng)域。圓二色譜紫外區(qū)段
(190-240nm),主要生色團(tuán)是肽鏈,這一波長范圍的CD譜包含了生
物大分子主鏈構(gòu)象的信息。a-螺旋構(gòu)象的CD譜在222nm、208nm處
呈負(fù)峰,在190nm旁邊有一正峰。0-折疊構(gòu)象的CD譜,在217-218nm
處有一負(fù)峰,在195-198nm處有一強(qiáng)的正峰。無規(guī)則卷曲構(gòu)象的CD譜
在198nm旁邊有一負(fù)峰,在220nm旁邊有一小而寬的正峰。
1.4.3.2.核磁共振(NMR)
隨著二維、三維以與四維NMR的應(yīng)用,分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)處理技術(shù)的
發(fā)展,使NMR漸漸成為大分子結(jié)構(gòu)物質(zhì)分析的主要方法之一。NMR可
用于確定氨基酸序列、分布以與構(gòu)象。目前,NMR在分析分子中含少于
30個(gè)氨基酸的小肽時(shí)是特別有用的,分析結(jié)果快速精確。
1.4.3.3.X-衍射
X-衍射可獲得有關(guān)化合物晶型的干脆信息,而且可以推斷相對(duì)與肯定構(gòu)型。
?多肽標(biāo)記與修飾
目前多肽標(biāo)記與修飾的內(nèi)容特別多,廣泛應(yīng)用在多肽藥物,多肽生物學(xué),
多肽抗體以與多肽試劑的探討中。目前應(yīng)用廣泛的有:非放射性核素標(biāo)記
(C13,H2),熒光標(biāo)記(FAM,FITC),生物素標(biāo)記,磷酸化修飾等。
2.1.非放射性核素標(biāo)記
目前在非放射性核素標(biāo)記中,運(yùn)用廣泛的仍舊是C13,H2,因?yàn)槠溥\(yùn)用
平安,放射性小?,F(xiàn)在有比較完全的非放射性標(biāo)記的氨基酸,可以依據(jù)正
常的多肽合成方法將標(biāo)記好的氨基酸干脆連接到多肽上。
2.2.熒光標(biāo)記
熒光標(biāo)記由于沒有放射性,試驗(yàn)操作簡潔。因此,目前在生物學(xué)探討中熒
光標(biāo)記應(yīng)用特別廣泛,熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游
離竣基的采納的方法與接肽反應(yīng)相同,也采納HBTU/HOBt/DIEA方法
連接。但是對(duì)于FITC標(biāo)記,須要在連接FITC前,增加一個(gè)氨基己酸,
避開在切割的過程中被TFA切割掉。
2.3.生物素標(biāo)記
生物素-親合素系統(tǒng)(biotin-avidinsystem,BAS),是7。年頭后期應(yīng)用
于免疫學(xué),并得到快速發(fā)展的一種新型生物反應(yīng)放大系統(tǒng)。由于它具有生
物素與親合素之間高度親和力與多級(jí)放大效應(yīng),并與熒光素、酶、同位素
等免疫標(biāo)記技術(shù)有機(jī)地結(jié)合,使各種示蹤免疫分析的特異性和靈敏度進(jìn)一
步提高。主要有用于標(biāo)記多肽敏基的生物素N-羥基丁二酰亞胺酯(BNHS)
和生物素對(duì)硝基酚酯(pBNP),其中以BNHS最常用,當(dāng)然,也可以干脆
運(yùn)用生物素也可以標(biāo)記,因?yàn)槠浣Y(jié)構(gòu)上有個(gè)游離的竣基,采納
HBTU/HOBt/DIEA方法縮合,由于生物素的溶解度低,運(yùn)用
DMSO/DMF的混合溶劑增加溶解度。
2.4.磷酸肽合成
磷酸肽在生命過程中發(fā)揮重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Ser,Thr,
Tyro目前磷酸肽合成一般都采納磷酸化氨基酸,目前運(yùn)用的都是單葦基
磷酸化氨基酸,Tyr也可以干脆運(yùn)用磷酸化募基酸。磷酸化氨基酸的連接
一般采納HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采納該方法合成磷酸化也
有缺點(diǎn),特殊是在合成多磷酸化多肽或長肽的時(shí)候,連接效率低,最終產(chǎn)
品純度很低,對(duì)于這種磷酸化多肽,我們考慮采納后磷酸化方法,其合成
過程就是在多肽合成結(jié)束后,選擇性脫去要標(biāo)記的氨基酸的側(cè)鏈愛護(hù)基,
對(duì)于Tyr,Thr可以干脆運(yùn)用側(cè)鏈不愛護(hù)的氨基酸進(jìn)行反應(yīng),而Ser可以
采納Fmoc-Ser(trt),在1%TFA/DCM條件下可以定量的脫除。后
磷酸化,采納雙茉基亞磷酰胺,四氮?座生成亞磷酰胺四喋活性中間體,連
接到羥基上,隨后在過氧酸下氧化生成磷?;?,完成反應(yīng)。
?蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽
多肽在與蛋白受體結(jié)合發(fā)揮功能的時(shí)候,總是先折疊出某些特殊的結(jié)構(gòu),
多肽類似物合成主要是為了模擬這些結(jié)構(gòu),保持或提高生物活性,同時(shí)也
為了變更多肽的穩(wěn)定性,提高其抗酶解實(shí)力。
3.1.a-螺旋多肽
Q-螺旋是蛋白結(jié)構(gòu)中最為一般的一種,但是一般多肽在溶液中大多是無規(guī)
卷曲的,目前運(yùn)用最多的方法是多肽保持Q-螺旋結(jié)構(gòu)就是在多肽表面通過
共價(jià)鍵將處在Q-螺旋結(jié)構(gòu)的兩個(gè)氨基酸連接起來,選擇的位點(diǎn)(i,i+4或
i,i+7),選擇的化學(xué)鍵包括:二硫鍵,硫酸鍵,酰胺鍵,烯燃鍵(RCM)
等方法。
3.1.1.二硫鍵
二硫鍵廣泛存在與蛋白結(jié)構(gòu)中,對(duì)穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)具有特別重要的意義,二
硫鍵一般是通過序列中的2個(gè)Cys的疏基,經(jīng)氧化形成。形成二硫鍵的方
法很多:空氣氧化法,DMSO氧化法,過氧化氫氧化法等。二硫鍵的合成
過程,可以通過Ellman檢測(cè)以與HPLC檢測(cè)方法對(duì)其反應(yīng)進(jìn)程進(jìn)行監(jiān)測(cè)。
3.1.2.硫醒鍵
硫醮鍵的形成可以通過序列中的Lys,將濱乙酸連接到Lys的側(cè)鏈氨基上,
利用其和硫基的特異性反應(yīng),反應(yīng)在緩沖溶液中進(jìn)行,快速高效。
3.1.3.酰胺鍵
多肽的內(nèi)酰胺環(huán)肽的合成一般是利用Lys,Asp(Glu)的選擇性愛護(hù),
在固相上干脆環(huán)化。BOC策略中可以采納BOC-Lys(Fmoc),BOC-Asp
(OFm),FMOC策略中可以采納FMOC-Lys(Aloe),FMOC-Asp
(Allyl)o對(duì)于首尾環(huán)肽,還可以先合成愛護(hù)的多肽,然后在液相中環(huán)化
生成目標(biāo)多肽。
3.1.4.烯妙鍵(RCM)
RCM反應(yīng)是一個(gè)過渡金屬催化反應(yīng),其反應(yīng)中運(yùn)用催化劑:
(Cy3P)2C12Ru=CHPh,可以催化烯燃環(huán)化,過程中脫去一分子乙烯。
Fmoc-X-Resin
I120%pip/DMF
|2.Fmoc-X1/HBTU/HOBtDIEA
Xn-X-Resin
(Cy3P)2C12Ru=CHPh,
DCM,reflux
Xn-X-Resin
1.cleavagereag
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