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第一章 1、氨基酸的等電點(diǎn)( PI )( isoelectric point ): 在某一PH的溶液中,氨基酸解離成陽(yáng)離子和陰離子的趨勢(shì)及程度相同,成為堿性離子,呈電中性,此時(shí)溶液的PH稱(chēng)為該氨基酸的等電點(diǎn)。2、谷胱甘肽(GSH):由Glu、Cys、Gly組成,分子中半胱氨酸的巰基是該化合物的主要功能基團(tuán)。(1)是體內(nèi)重要的還原劑,保護(hù)蛋白質(zhì)和酶分子中的巰基免遭氧化,使蛋白質(zhì)處于活性狀態(tài)。(2)具有嗜核性,與外源的嗜電子毒物(致癌劑、藥物)結(jié)合,從而阻斷這些化合物與DNA、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合,以保護(hù)機(jī)體免遭毒物侵害。3、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)(primary structure):在蛋白質(zhì)分子中,從N-端至C-端的氨基酸排列順序。穩(wěn)定其主要化學(xué)鍵是肽鍵和二硫鍵。4、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondary structure):指蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對(duì)空間位置。穩(wěn)定它的主要化學(xué)鍵是氫鍵。主要包括螺旋、折疊、轉(zhuǎn)角、無(wú)規(guī)卷曲。5、肽單元(肽平面)(peptide unit):多肽分子中肽鍵的6個(gè)原子(C1、C、O、N、H、C2)位于同一平面,即肽單元。是蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要結(jié)構(gòu)單位。6、螺旋(-helix):以碳原子為轉(zhuǎn)折點(diǎn),以肽鍵平面為單位,盤(pán)曲成右手螺旋的結(jié)構(gòu)。螺旋上升一圈含3.6個(gè)氨基酸殘基,螺距0.54nm。氨基酸的側(cè)鏈伸向螺旋的外側(cè)。螺旋的穩(wěn)定是靠氫鍵。氫鍵方向與長(zhǎng)軸平行。7、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)(tertiary structure):指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置,即整條肽鏈所有原子在三維空間的排布位置。其形成與穩(wěn)定主要依靠次級(jí)鍵,如疏水鍵、鹽鍵、氫鍵、范德華力等。8、結(jié)構(gòu)域(domain):是三級(jí)結(jié)構(gòu)層次上的局部折疊區(qū),折疊得較為緊密,各有獨(dú)特的空間構(gòu)象,并承擔(dān)不同的生物學(xué)功能。9、分子伴侶(molecular chaperons):一類(lèi)幫助新生多肽鏈正確折疊的蛋白質(zhì)。它可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開(kāi),如此反復(fù)進(jìn)行,可防止錯(cuò)誤的聚集發(fā)生,使肽鏈正確折疊。其對(duì)蛋白質(zhì)分子中二硫鍵的形成起到非常重要的作用。10、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu):(quarternary structure):兩個(gè)或兩個(gè)以上的亞基之間彼此以非共價(jià)鍵相互作用形成更為復(fù)雜的空間構(gòu)象。各亞基間的結(jié)合力主要是氫鍵和離子鍵。11、蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)( PI ) isoelectric point :當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一PH時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,靜電荷為零,此時(shí)溶液的PH稱(chēng)為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。12、蛋白質(zhì)變性(denaturation):在某些理化因素下,蛋白質(zhì)的特定空間構(gòu)象被破壞,有序的空間結(jié)構(gòu)變?yōu)闊o(wú)序,從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變以及生物活性的喪失。其主要發(fā)生在二硫鍵和非共價(jià)鍵的破壞,變性不涉及一級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。13、蛋白質(zhì)的復(fù)性(renaturation):若蛋白質(zhì)變性程度較低,去除變性因素后,有些蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能。 第二章 1、DNA變性(DNA denaturation):某些理化因素會(huì)導(dǎo)致DNA雙鏈互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵斷裂,使雙鏈DNA解離為單鏈。只改變其二級(jí)結(jié)構(gòu),不涉及它的核苷酸序列。2、DNA復(fù)性(退火 annealing)(DNA renaturation):變性的DNA在適當(dāng)條件下,兩條彼此分開(kāi)的DNA單鏈重新締合成雙螺旋結(jié)構(gòu)的過(guò)程。3、DNA解鏈溫度(溶解溫度)(melting temperature)(T M):在解鏈過(guò)程中,紫外吸收值達(dá)到最大值的50%時(shí)所對(duì)應(yīng)的溫度。4、分子雜交(hybridization):兩條來(lái)源不同的核酸單鏈間,因部分堿基互補(bǔ),經(jīng)退火處理可以形成雜交雙螺旋結(jié)構(gòu)。 第三章 1、酶的活性中心(active center):酶的必需基團(tuán)在一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但必需基團(tuán)在空間結(jié)構(gòu)上彼此靠近,組成具有特定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,能和底物特異結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。包括結(jié)合基團(tuán)和催化基團(tuán)。2、同工酶(isoenzyme、isozyme):可以催化相同的化學(xué)反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。3、酶的特異性(specificity):一種酶僅作用于一種或一類(lèi)化合物,或一定的化學(xué)鍵,催化一定的化學(xué)反應(yīng)并生成一定的產(chǎn)物。酶的這種特性稱(chēng)為酶的特異性或?qū)R恍浴?、米氏常數(shù)(Km):酶的特性常數(shù)之一,數(shù)值等于酶促反應(yīng)速率為最大速率一半時(shí)的底物濃度,單位為mol/L。Km值大小反映酶與作用物親和力的大小。5、酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)(allosteric regulation):某些小分子化合物與酶的活性中心以外的某一部位發(fā)生非共價(jià)鍵結(jié)合,引起酶分子構(gòu)象改變,從而使酶催化活性改變.6、酶的化學(xué)修飾調(diào)節(jié)(chemical modification):酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)在另一種酶的催化下,可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價(jià)修飾,使酶的構(gòu)象發(fā)生改變,從而改變酶活性的過(guò)程。酶的化學(xué)修飾主要有磷酸化與脫磷酸、腺苷化與脫腺苷、甲基化與脫甲基等。7、酶原(zymogen):有些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或出分泌,或在其發(fā)揮催化功能前只是酶的無(wú)活性前提,這種前體即是酶原。第四章 1、糖酵解(glycolysis):在機(jī)體缺氧條件下,葡萄糖經(jīng)過(guò)一系列酶促反應(yīng)生成丙酮酸進(jìn)而還原生成乳酸的過(guò)程。其反應(yīng)場(chǎng)所在細(xì)胞胞質(zhì)(胞漿)。2、底物水平磷酸化(substrate-level phosphorylation):與脫氫反應(yīng)偶聯(lián),直接將高能代謝物分子中的能量轉(zhuǎn)移至ADP(GDP)中,生成ATP(GTP)的過(guò)程。3、糖的有氧氧化(aerobic oxidation):指在機(jī)體氧供充足時(shí),葡萄糖徹底氧化成H2O和CO2,并釋放出能量的過(guò)程。是機(jī)體主要供能方式。部位:胞液及線(xiàn)粒體。4、三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle . TCA cycle):指乙酰輔酶A和草酰乙酸縮合生成含三個(gè)羧基的檸檬酸,反復(fù)進(jìn)行脫氫脫羧,又生成草酰乙酸,再重復(fù)循環(huán)反應(yīng)的過(guò)程。反應(yīng)部位為線(xiàn)粒體。5、磷酸戊糖途徑(pentose phosphate pathway):葡萄糖生成磷酸戊糖及NADPH+H+,前者再進(jìn)一步轉(zhuǎn)變成3-磷酸甘油醛和6-磷酸果糖的反應(yīng)過(guò)程。其意義是生成磷酸戊糖和NADPH+H6、糖原分解 (glycogenolysis ):習(xí)慣上指肝糖原分解成為葡萄糖的過(guò)程,亞細(xì)胞定位于胞漿。7、糖異生(gluconeogenesis):從非糖物質(zhì)(乳酸、甘油、生糖氨基酸等)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛱窃倪^(guò)程。主要在肝、腎細(xì)胞的胞漿及線(xiàn)粒體中進(jìn)行。 第五章 1、脂肪動(dòng)員(fat mobilization):儲(chǔ)存在脂肪中的甘油三酯被脂酶逐步水解為游離脂酸(FFA)和甘油并釋放入血,通過(guò)血液運(yùn)輸至其他組織氧化利用的過(guò)程。 關(guān)鍵酶:激素敏感性甘油三脂肪酶(HSL)2、酮體(ketone body):脂酸-氧化后形成的乙酰CoA在肝細(xì)胞線(xiàn)粒體中轉(zhuǎn)化為酮體,即脂酸在肝細(xì)胞分解氧化時(shí)產(chǎn)生的特有中間代謝物,包括:乙酰乙酸、-羥丁酸、丙酮。 第六章 1.生物氧化(biological oxidation):物質(zhì)在生物體內(nèi)進(jìn)行的氧化,主要指糖、脂肪、蛋白質(zhì)等在體內(nèi)分解時(shí)逐步釋放能量,最終生成CO2和H2O的過(guò)程。2.呼吸鏈(respiratory chain)(電子傳遞鏈)(electron transfer chain):代謝物脫下的成對(duì)氫原子(2H)通過(guò)多種酶和輔酶所催化的連鎖反應(yīng)逐步傳遞,最終與氧結(jié)合生成水,這一系列酶和輔酶稱(chēng)呼吸鏈 。3、底物水平磷酸化(substrate-level phosphorylation):與脫氫反應(yīng)偶聯(lián),直接將高能代謝物分子中的能量轉(zhuǎn)移至ADP(GDP)中,生成ATP(GTP)的過(guò)程。4、氧化磷酸化(oxidative phosphorylation):由代謝物脫下的氫,經(jīng)線(xiàn)粒體氧化呼吸鏈電子傳遞釋放能量,偶聯(lián)驅(qū)動(dòng)ADP磷酸化生成ATP的過(guò)程。5、P/O值:氧化磷酸化過(guò)程中,每消耗1/2摩爾O2所消耗無(wú)機(jī)磷的摩爾數(shù)所生成ATP的摩爾數(shù)。即一對(duì)電子通過(guò)氧化呼吸鏈傳遞給氧所生成的ATP數(shù)。 第七章 1、營(yíng)養(yǎng)必須氨基酸:在人體內(nèi)不能自身合成,必須由食物提供的氨基酸。包括:甲硫氨酸(Met)、色氨酸(Trp)、賴(lài)氨酸(Cys)、纈氨酸(Val)、異亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、苯丙氨酸(Phe)、蘇氨酸(Thr)(假設(shè)來(lái)寫(xiě)一兩本書(shū))。2、蛋白質(zhì)的腐敗作用:未被消化的蛋白質(zhì)和未被吸收的氨基酸在大腸下部受大腸桿菌的分解作用。是腸道細(xì)菌本身的代謝過(guò)程,以無(wú)氧分解為主。3、氨基酸代謝庫(kù)(metabolic pool):分布于體內(nèi)各處參與代謝的氨基酸。分為外源性(食物蛋白質(zhì)經(jīng)消化而被吸收的氨基酸)和內(nèi)源性(體內(nèi)組織蛋白質(zhì)降解產(chǎn)生的氨基酸、體內(nèi)合成的非必須氨基酸)4、氨基酸的脫氨基作用: 指氨基酸脫去-氨基生成相應(yīng)-酮酸的過(guò)程5、氨基酸的轉(zhuǎn)氨基作用:在轉(zhuǎn)氨酶的催化下, 某一氨基酸的a-氨基轉(zhuǎn)移到另一種a-酮酸的酮基 上,生成相應(yīng)的氨基酸;原來(lái)的氨基酸則轉(zhuǎn)變成a-酮酸。6、聯(lián)合脫氨基作用:是體內(nèi)氨基酸脫氨基的主要方式,兩種脫氨基方式的聯(lián)合作用(轉(zhuǎn)氨基作用和氧化脫氨基作用),使氨基酸脫下-氨基生成-酮酸的過(guò)程。 7、一碳單位(one carbon unit):某些氨基酸在分解代謝過(guò)程中產(chǎn)生含有一個(gè)碳原子的基團(tuán),不能單獨(dú)游離存在,與四氫葉酸結(jié)合而參與代謝。第八章 1、嘌呤核苷酸-從頭合成途徑(de novo synthesis pathway):嘌呤核苷酸的從頭合成途徑是指利用磷酸核糖、氨基酸、一碳單位及二氧化碳等簡(jiǎn)單物質(zhì)為原料,經(jīng)過(guò)一系列酶促反應(yīng),合成嘌呤核苷酸的途徑。合成部位:肝、小腸和胸腺。腦、骨髓無(wú)法進(jìn)行此途徑。2、嘌呤核苷酸的補(bǔ)救合成:是指體內(nèi)有些組織(腦、骨髓等)缺乏從頭合成的酶,只能利用現(xiàn)成的嘌呤堿或嘌呤核苷為原料合成嘌呤核苷 酸的過(guò)程,稱(chēng)為補(bǔ)救合成。組織器官:腦、骨髓。部位:胞液。 第九章 1、變構(gòu)調(diào)節(jié)(allosteric regulation):小分子化合物與酶分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)象變化,從而改變酶的活性,這種調(diào)節(jié)稱(chēng)為酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)或別構(gòu)調(diào)節(jié)。2、酶的化學(xué)修飾調(diào)節(jié)(chemical modification):酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)在另一種酶的催化下,可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價(jià)修飾,使酶的構(gòu)象發(fā)生改變,從而改變酶活性的過(guò)程。酶的化學(xué)修飾主要有磷酸化與脫磷酸、腺苷化與脫腺苷、甲基化與脫甲基等。 第十章 1、半保留復(fù)制(semi-conservative replication):母鏈DNA解開(kāi)為兩股單鏈,各自作為模板按堿基配對(duì)原則規(guī)律,合成與模板互補(bǔ)的子鏈,使得兩個(gè)子細(xì)胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致。2、逆轉(zhuǎn)錄(reverse transcription):是RNA指導(dǎo)下的DNA合成作用,即以RNA為模板,由dNTP聚合生成DNA的過(guò)程。3、移框突變(frame-shift mutation):指缺失或插入(核苷酸)的突變,引起三聯(lián)密碼的閱讀方式改變,其后果是翻譯出一級(jí)結(jié)構(gòu)完全不同的另一種蛋白質(zhì)。 第十一章 1、轉(zhuǎn)錄 (transcription) :生物體以DNA為模板合成RNA的過(guò)程。2、不對(duì)稱(chēng)轉(zhuǎn)錄(asymmetric transcription):在DNA分子雙鏈上,一股鏈作為模板指引轉(zhuǎn)錄(模板鏈),另一股鏈不轉(zhuǎn)錄(編碼鏈),模板鏈并非總是在同一單鏈上。3、啟動(dòng)子(promoter):位于操縱子的調(diào)控序列,是RNA聚合酶結(jié)合模板DNA的部位,也是控制轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵部位。啟動(dòng)子包含了三個(gè)功能部位-轉(zhuǎn)錄的起始部位: 10區(qū)-結(jié)合部位(核心酶) 35區(qū)-識(shí)別部位(因子)4、轉(zhuǎn)錄空泡(transcription bubble):由核心酶DNARNA形成的轉(zhuǎn)錄復(fù)合體。5、順式作用元件(cis-acting element):真核生物編碼基因兩側(cè)的DNA序列,可影響自身基因的表達(dá)活性,通常是非編碼序列。(分類(lèi):?jiǎn)?dòng)子、增強(qiáng)子、沉默子)6、反式作用因子(trans-acting factors):能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋白質(zhì)。7、斷裂基因(split gene):真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開(kāi)但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì)。這些基因即斷裂基因。8、核酶(ribozyme):具有酶促活性的RNA稱(chēng)為核酶第十二章 1、翻譯(translation):指以新生的mRNA為模板,把核酸中由A、G、C、U四種符號(hào)組成的遺傳信息,破譯為蛋白質(zhì)分子中20種氨基酸排列順序的過(guò)程。2、開(kāi)放閱讀框架(open reading frame ORF):從mRNA-5端起始密碼子AUG到3-端終止密碼子之間的核苷酸序列。3、多聚核糖體(polysome):mRNA與多個(gè)核糖體形成的聚合物,可以使蛋白質(zhì)生物合成以高速度、高效率進(jìn)行。4、分泌性蛋白質(zhì)( secretory proteins ):穿過(guò)合成所在的細(xì)胞到其它組織細(xì)胞去的蛋白質(zhì),可統(tǒng)稱(chēng)為分泌性蛋白質(zhì)。5、信號(hào)肽(single peptide):未成熟分泌型蛋白質(zhì)中可被細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)識(shí)別的特征性氨基酸序列。(富含疏水性氨基酸,有堿性N-末端、疏水核心區(qū)和加工區(qū)三個(gè)區(qū)段) 第十三章 1、操縱子(operon):通常由2個(gè)以上的編碼序列與啟動(dòng)序列(promotor)、操縱序列(operator)以及其它調(diào)節(jié)序列在基因組中成簇串聯(lián)組成。2、啟動(dòng)序列(promotor):RNA聚合酶結(jié)合并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的特異DNA序列。原核生物的啟動(dòng)序列按功能的不同可分為三個(gè)部位,即起始部位、結(jié)合部位、識(shí)別部位。3、操縱序列(operator):與啟動(dòng)序列毗鄰或接近的DNA序列,是原核阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。其DNA序列常與啟動(dòng)序列交錯(cuò)、重疊。4、順式作用元件(cis-acting element):真核生物編碼基因兩側(cè)的DNA序列,可影響自身基因的表達(dá)活性,通常是非編碼序列。(分類(lèi):?jiǎn)?dòng)子、增強(qiáng)子、沉默子)5、反式作用因子(trans-acting factors):能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋白質(zhì)。6、基本轉(zhuǎn)錄因子(general transcription factors):是RNA聚合酶結(jié)合啟動(dòng)子所必需的一組蛋白因子,決定三種RNA(mRNA、tRNA及rRNA)轉(zhuǎn)錄的類(lèi)別。7、特異轉(zhuǎn)錄因子(special transcription factors):為個(gè)別基因轉(zhuǎn)錄所必需,決定該基因的時(shí)間、空間特異性表達(dá)。 第十四章 1、DNA克隆(recombinant DNA):應(yīng)用酶學(xué)的方法,在體外將各種來(lái)源的遺傳物質(zhì)(同源的或異源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)與載體DNA接合成一具有自我復(fù)制能力的DNA分子復(fù)制子,繼而通過(guò)轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染宿主細(xì)胞,篩選出含有目的基因的轉(zhuǎn)化子細(xì)胞,再進(jìn)行擴(kuò)增提取獲得大量同一DNA分子,也稱(chēng)基因克隆或重組DNA (recombinant DNA)。2、質(zhì)粒 (plasmid):能在宿主細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立自主復(fù)制;帶有某些遺傳信息, 會(huì)賦予宿主細(xì)胞一些遺傳性狀。 3、限制性核酸內(nèi)切酶(restriction endonuclease):識(shí)別DNA的特異序列,并在識(shí)別位
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