網(wǎng)上生物醫(yī)學(xué)信息資源檢索_第1頁
網(wǎng)上生物醫(yī)學(xué)信息資源檢索_第2頁
網(wǎng)上生物醫(yī)學(xué)信息資源檢索_第3頁
網(wǎng)上生物醫(yī)學(xué)信息資源檢索_第4頁
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網(wǎng)絡(luò)信息檢索工具和技術(shù)常用綜合性搜索引擎常用醫(yī)學(xué)搜索引擎常用生物學(xué)專業(yè)網(wǎng)站國內(nèi)電子期刊數(shù)據(jù)庫國外電子期刊數(shù)據(jù)庫,網(wǎng)上生物學(xué)信息資源檢索,網(wǎng)絡(luò)信息檢索是利用網(wǎng)絡(luò)資源進(jìn)行的信息檢索。網(wǎng)絡(luò)信息資源大致可分為兩類:一類是來自正式文獻(xiàn)信息源的信息,內(nèi)容可靠,質(zhì)量高,一般都有檢索平臺。另一類是各類網(wǎng)站上的信息,這些信息包羅萬象,良莠不齊,一般用搜索引擎等網(wǎng)絡(luò)工具進(jìn)行檢索。,概述,瀏覽偶然發(fā)現(xiàn):這是在網(wǎng)絡(luò)上發(fā)現(xiàn)、檢索的原始方法。順“鏈”而行:通過Web頁的超級鏈接進(jìn)行訪問。輸入網(wǎng)址直接訪問利用搜索引擎通過搜索引擎來查找自己想要的網(wǎng)址或信息是最快捷,也是最佳的檢索途徑。,網(wǎng)絡(luò)信息檢索方法,Internet網(wǎng)絡(luò)(因特網(wǎng))擁有包羅萬象的豐富的信息資源,這些信息種類繁多、存儲地點(diǎn)分散、雜亂無序,要想獲得自己特定需要的信息,必須要掌握有效的網(wǎng)絡(luò)信息檢索工具和技術(shù)。,網(wǎng)絡(luò)信息檢索工具和技術(shù),網(wǎng)絡(luò)上的工具包括有:,基于菜單式的檢索工具和基于關(guān)鍵詞的檢索工具,如Gopher、WAIS等。最為常用的是基于超文本的檢索工具,如IE瀏覽器可以采用WWW方式檢索。利用FTP可進(jìn)行文件傳輸。利用Telnet可以登錄到遠(yuǎn)程的主機(jī)上。網(wǎng)絡(luò)上還有網(wǎng)絡(luò)指南工具稱為搜索引擎。,是WorldWideWeb的縮寫,它是采用超文本鏈接技術(shù)組織信息的分布式信息系統(tǒng),是Internet中應(yīng)用最廣泛的網(wǎng)絡(luò)工具之一。,E-mail,E-mail是ElectronicMail(電子郵件)的縮寫,利用電子郵件可以收發(fā)文本、聲音、圖像、影視等信息。由于其成本低、速度快、使用方便,E-mail是網(wǎng)絡(luò)上最常用的工具。,FTP,文件傳輸(FileTransferProtocol,簡稱FTP),這是一種實時的網(wǎng)絡(luò)聯(lián)機(jī)檢索工具。它能方便地實現(xiàn)Internet上異種機(jī)、異種操作系統(tǒng)之間的文件傳輸。FTP根據(jù)指定的地址與遠(yuǎn)程FTP服務(wù)器連接,即可瀏覽到可供下載的文件目錄,并根據(jù)自己的需要選擇下載。,Archie,Archie是一種自動標(biāo)題檢索軟件,可周期性的連接世界各地的FTP服務(wù)器,并將這些服務(wù)器可供下載的文件的文件名和路徑搜集在一起組成Archie數(shù)據(jù)庫,便于利用文件名和目錄進(jìn)行快速檢索。使用FTP可利用IE瀏覽器實現(xiàn)。在地址欄輸入要訪問的FTP服務(wù)器地址,采用匿名登錄,就能看到服務(wù)器提供的文件目錄,可選擇下載。,搜索引擎,搜索引擎(SearchEngine)是Internet上信息資源的檢索系統(tǒng),是查詢信息最實用、最方便、最快捷的工具。一般的搜索引擎均提供兩種方式供用戶檢索,一是提供將信息分類管理的樹型結(jié)構(gòu),讀者只需進(jìn)入不同的目錄層次即可查詢。二是提供按關(guān)鍵詞查詢的全文檢索。,網(wǎng)上搜索引擎很多,每個搜索引擎均有其一定的收錄范圍和規(guī)模,索引方式也不同,沒有任何一個搜索引擎能提供絕對完整全面的檢索。因此,要想獲得較為全面的檢索結(jié)果,必須盡可能選用若干搜索引擎進(jìn)行檢索。以下列舉一些常用搜索引擎的網(wǎng)址供參考。,綜合性搜索引擎有,Google:,常用生物醫(yī)學(xué)主題搜索引擎,Biomednet:,Telnet,Telnet即遠(yuǎn)程登錄,利用這種方式,你可以登錄到遠(yuǎn)程的主機(jī)上,就好象計算機(jī)是直接連接到遠(yuǎn)程服務(wù)器上的一個終端。如果你出差時需要查詢存放在單位主機(jī)里的資料時,就可以通過遠(yuǎn)程登錄方式和本單位主機(jī)連接,即可調(diào)用存儲在主機(jī)上的資料。當(dāng)然,你必須具備連接服務(wù)器的條件,擁有服務(wù)器上的合法用戶和口令。,電子論壇,電子論壇是上網(wǎng)用戶就某個感興趣的問題交換信息的園地。其表現(xiàn)形式為兩類:一是分散形式,如郵件列表(MailingList)。任何發(fā)往郵件列表管理器的郵件均被復(fù)制并被發(fā)送給郵件列表中的所有成員。二是集中式,如新聞組(Newsgroup)、USENET、電子公告板(BBS)等。用戶發(fā)送和閱讀的信息集中在某臺服務(wù)器上,由系統(tǒng)管理員管理。,可從以下網(wǎng)站中查詢生物醫(yī)學(xué)方面的通訊組和電子論壇:,近年來,全文檢索系統(tǒng)、多媒體檢索系統(tǒng)的發(fā)展非常迅速。這些系統(tǒng)中存儲的對象是信息源本身,而不是信息線索,有利于原始文獻(xiàn)資源共享。但由于信息占用空間大,響應(yīng)速度較慢,多采用自然語言標(biāo)引,易發(fā)生誤檢、漏檢,尚有待進(jìn)一步研究改進(jìn)。,Yahoo!(,常用綜合性搜索引擎,Google(,Google的檢索界面非常簡潔,同時也是眾多國際知名門戶網(wǎng)站搜索引擎技術(shù)提供商。Google具有以下特點(diǎn):檢索網(wǎng)頁數(shù)量達(dá)24億,搜索引擎中排名第一;支持多達(dá)132種語言,包括簡體中文和繁體中文;網(wǎng)站只提供搜索引擎功能,界面簡潔典雅,速度極快;專利網(wǎng)頁級別技術(shù)PageRank能夠提供準(zhǔn)確率極高的搜索結(jié)果;,可靠Google智能化的“手氣不錯”功能,提供可能最符合要求的網(wǎng)站;“網(wǎng)頁快照”功能,能從Google服務(wù)器里直接取出緩存的網(wǎng)頁。具有獨(dú)到的圖片搜索功能;具有強(qiáng)大的新聞組搜索功能;等等。,Lycos(,Lycos網(wǎng)站創(chuàng)立于1995年,是全球最受歡迎的知名網(wǎng)站群之一。Lycos提供分類目錄導(dǎo)航、關(guān)鍵詞檢索和高級檢索功能。,Excite(,由斯坦福大學(xué)的學(xué)生開發(fā)的能在大型數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行快速概念檢索的搜索引擎。,AOL(,AOL界面清新,使用了Google的技術(shù),按目錄方式查找十分便捷。,百度搜索(,百度搜索引擎擁有世界上最大的中文信息庫,總量達(dá)到4500萬頁以上。百度搜索引擎技術(shù)被認(rèn)為是第二代中文搜索引擎核心技術(shù)的代表,國內(nèi)20多家網(wǎng)站如新浪搜索、搜弧、中國人等均使用了百度搜索引擎作為站點(diǎn)搜索的支持。,新浪(,新浪網(wǎng)搜索引擎是面向全球華人的網(wǎng)上資源查詢系統(tǒng)。其收錄的資源相當(dāng)豐富,目前共有20余萬個網(wǎng)站,是互聯(lián)網(wǎng)上規(guī)模最大的中文搜索引擎之一。新浪網(wǎng)提供的查詢服務(wù)有網(wǎng)站、網(wǎng)頁、新聞、軟件、游戲等。提供的檢索功能有一般檢索、進(jìn)階檢索、高級搜索、圖片搜索等。一般搜索提供“分類檢索”和“關(guān)鍵詞查詢”兩種查找方法。,搜狐(,搜狐是國內(nèi)最著名的中文搜索引擎之一,成立于1996年8月。已逐步發(fā)展成為最受用戶喜愛的綜合性門戶網(wǎng)站,是目前國內(nèi)影響力最大的分類搜索引擎。搜狐提供的查詢服務(wù)有網(wǎng)站、網(wǎng)頁、新聞、網(wǎng)址、軟件五類信息。搜狐檢索功能有關(guān)鍵詞查詢、分類查詢(目錄導(dǎo)航)、高級搜索三種。,網(wǎng)易(,網(wǎng)易是國內(nèi)較早成立的大型門戶網(wǎng)站之一。它在與世界領(lǐng)先的搜索引擎技術(shù)商Google合作的基礎(chǔ)上,正式啟用自行研發(fā)的功能齊全的搜索引擎技術(shù),并新增了關(guān)鍵詞廣告搜索服務(wù)。網(wǎng)易提供目錄、網(wǎng)站、中文網(wǎng)頁、所有網(wǎng)頁、新聞等信息的查詢服務(wù)。提供分類檢索(目錄導(dǎo)航)、關(guān)鍵詞檢索功能,未提供多項目查詢界面。,BioMedNet(生物醫(yī)學(xué)網(wǎng),BMN)()BMN是常用的醫(yī)學(xué)搜索引擎之一,由美國許多大學(xué)、政府機(jī)構(gòu)、非盈利學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)合作支持,Elsevier出版社經(jīng)營。同時,BMN可向用戶免費(fèi)提供包括MEDLINE、EMBASE在內(nèi)的多個生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫,提供上百種生物醫(yī)學(xué)期刊的全文和15000多篇綜述文獻(xiàn),是檢索生物醫(yī)學(xué)資源的重要網(wǎng)站。使用BMN前用戶須經(jīng)簡單注冊。,常用生物醫(yī)學(xué)搜索引擎,HealthWeb(),HealthWeb是美國中西部地區(qū)衛(wèi)生科學(xué)圖書館和相關(guān)機(jī)構(gòu)合作開發(fā)的衛(wèi)生資源指南系統(tǒng)。HealthWeb提供的列表內(nèi)容主要是從基礎(chǔ)到臨床各個學(xué)科的名稱,再加上其熱門話題,共有約71個類目。關(guān)鍵詞檢索提供基本檢索和高級檢索兩種檢索方式。,37oC醫(yī)學(xué)網(wǎng)(),37醫(yī)學(xué)網(wǎng)是由第四軍醫(yī)大學(xué)建立的醫(yī)學(xué)大型綜合性網(wǎng)站。為臨床醫(yī)生、醫(yī)學(xué)科研人員、醫(yī)學(xué)院校師生提供各類國內(nèi)外最新的醫(yī)學(xué)動態(tài)信息、內(nèi)容豐富的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn),以及醫(yī)學(xué)繼續(xù)教育服務(wù)及各類專題學(xué)術(shù)會議等全方位的醫(yī)學(xué)信息服務(wù)。采用先進(jìn)的科學(xué)分類方法,全中文界面,有方便的網(wǎng)上查詢,還有獨(dú)特的關(guān)鍵詞搜索等等,為中文用戶提供了一種方便、快捷的醫(yī)學(xué)信息獲得手段。,美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)美國國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterofBiotechnolgoyInformation,簡稱NCBI)成立于1988年。NCBI的主頁分為四個部分:最上面的是工具欄,左側(cè)列出了NCBI提供的各種服務(wù),中間部分是NCBI的最新消息,右側(cè)是各種熱點(diǎn)鏈接。以下對NCBI的工具欄作一簡要介紹。,常用生物學(xué)專業(yè)網(wǎng)站,PubMedPubMed可以免費(fèi)獲得MEDLINE和PREMEDLINE的文獻(xiàn)信息,并通過記錄間的相關(guān)鏈接,獲取其相關(guān)基因、蛋白質(zhì)序列以及蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)等信息。,EntrezEntrez是NCBI1991年開發(fā)研制的集成數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng),它包括的數(shù)據(jù)庫有:PubMed、Nucleotidesequencedatabase、Proteinsequnecdatabase(包括GenBank)、Structrues、Genome、PopSet、OMIM、Taxonomy、Books、ProbeSet、3DDomains、UniSTS、SNP、CDD等。從這些數(shù)據(jù)庫中可以獲取核苷酸序列、蛋白質(zhì)序列、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)、基因組信息、生物學(xué)門類以及MEDLINE和PREMEDLINE的信息。,BLASTBLAST是BasicLocalAlignmentSearchTool的英文縮寫,譯為堿基局部對準(zhǔn)檢索工具,是由NCBI提供的一種序列類似性檢索程序。序列的類似性比較,對確定新的基因以及對疾病的基因診斷及原因確定具有重要的意義。利用BLAST還可以進(jìn)行核苷酸序列、蛋白質(zhì)序列等的同源性分析。,GenBankGenBank由NCBI負(fù)責(zé)管理,它是一個公共數(shù)據(jù)庫,每兩個月一個版本,提供所有公開發(fā)表的核酸和蛋白質(zhì)序列及其生物學(xué)注釋和書目文獻(xiàn)等信息等。在NCBI的主頁上先點(diǎn)擊Entrez,再點(diǎn)擊Nucleotides,即可進(jìn)入其頁面。,OMIM人類孟德爾遺傳聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(OMIM),是人類基因和遺傳疾病的目錄數(shù)據(jù)庫。它不僅包括基因和遺傳疾病有關(guān)的文本信息、圖片以及參考文獻(xiàn),還包括與Medline中的文獻(xiàn)、GenBank中的序列、圖譜以及其他數(shù)據(jù)庫的鏈接。Books提供相關(guān)生物醫(yī)學(xué)圖書的查詢。TaxBrower提供按生物學(xué)門進(jìn)行檢索或瀏覽其核苷酸序列、蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)等功能。,StructureNCBI的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,包括X線結(jié)晶學(xué)和磁共振測定的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),這些結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)與序列數(shù)據(jù)、生物分類和PubMed中的文獻(xiàn)建立了交叉鏈接。運(yùn)用NCBI的3D結(jié)構(gòu)瀏覽器和Cn3D,可以很容易地從Entrez獲得分子的分子結(jié)構(gòu)間相互作用的圖像。,美國國立衛(wèi)生研究院(NIH),網(wǎng)址為:美國國立衛(wèi)生研究院是世界一流的生物醫(yī)學(xué)研究中心,在科研成果開發(fā),生物醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫方面都居于世界前列。它為專業(yè)人員提供許多綜合性與??菩钥蒲信c臨床信息資源,也為公眾提供許多衛(wèi)生與病人教育資料。,NIH主頁包括的欄目有:衛(wèi)生信息、科研資助、新聞與事件、科學(xué)資源、NIH下屬機(jī)構(gòu)、NIH介紹等。從NIH可獲取以下衛(wèi)生信息(HealthInformaiton),NIH匯集的衛(wèi)生信息和數(shù)據(jù)庫有:最近1年NIH衛(wèi)生信息索引(NIHHealthInformaitonIndex)、網(wǎng)上免費(fèi)數(shù)據(jù)庫(MEDLINEPlus,PubMed,ClinicalT,CombinedHealthInformationDatabase等)、NIH出版物、健康熱線、藥物信息、特別研究項目等。,ClinicalT臨床試驗數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址為:http:/ClinicalT臨床試驗數(shù)據(jù)庫是向病人、病人家屬、公眾和醫(yī)務(wù)人員提供美國國內(nèi)臨床試驗研究信息的數(shù)據(jù)庫,創(chuàng)建于2000年,收錄了由NIH、美國其他聯(lián)邦機(jī)構(gòu)和全球范圍內(nèi)7萬多個制藥公司資助的將近6600多項臨床試驗研究信息。,CombinedHealthInformaitonDatabase綜合衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)()創(chuàng)建于1985年,是提供衛(wèi)生信息和健康教育資源的書目型數(shù)據(jù)庫。文獻(xiàn)數(shù)據(jù)來源于美國聯(lián)邦政府下屬的多個衛(wèi)生機(jī)構(gòu),每季度更新一次,收錄的文獻(xiàn)類型包括:期刊論文、專著、教材章節(jié)、手冊、培訓(xùn)指南、廣告、報告、小冊子、書目、視聽資料及其他難以得到的文獻(xiàn)資料。,美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)/,美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)是世界上最大的醫(yī)學(xué)圖書館。NLM不僅館藏量大,而且網(wǎng)上醫(yī)學(xué)信息資源豐富,提供包括Medline在內(nèi)的幾十種數(shù)據(jù)庫供互聯(lián)網(wǎng)用戶免費(fèi)使用。NLM主頁包括的欄目有:衛(wèi)生信息、圖書館服務(wù)、研究項目、更新和公告、一般信息。,從NLM上的衛(wèi)生信息(HealthInformation)欄目可以檢索以下常用數(shù)據(jù)庫:MEDLINE/PubMed著名的醫(yī)學(xué)書目數(shù)據(jù)庫,收錄了4500種生物醫(yī)學(xué)期刊。MEDLINEplus該數(shù)據(jù)庫提供的信息包括衛(wèi)生專題信息、NIH下屬研究所的全文出版物、醫(yī)學(xué)百科全書、藥物信息、醫(yī)學(xué)詞典和詞匯、主要醫(yī)學(xué)學(xué)會鏈接、醫(yī)生醫(yī)院名錄、統(tǒng)計資料、衛(wèi)生設(shè)施、Medline中專題文獻(xiàn)的檢索鏈接等。,DIRLINE(DirectoryofInformationResourcesOnline)DIRLINE()是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館提供的在線數(shù)據(jù)庫??蓹z索與生物醫(yī)學(xué)有關(guān)的各種信息資源的地址和描述性信息。LOCATORplus可以查詢NLM的圖書、期刊、視聽資料的館藏目錄。AdditionalInformationbySubject列出其他主題信息的鏈接,包括艾滋病、寒帶保健、生物倫理學(xué)等信息資源。,美國疾病控制與預(yù)防中心(CDC)(/),美國疾病控制與預(yù)防中心(CentersforDiseaseControlandPrevention,CDC)是美國衛(wèi)生與服務(wù)部(DepartmentofHealthandHumanServices)的一個下級機(jī)構(gòu)。CDC的主頁包含CDC介紹、公告、數(shù)據(jù)與統(tǒng)計資料、旅游者衛(wèi)生、健康主題A-Z、出版物,軟件與產(chǎn)品、培訓(xùn)與招聘、訂購、其它站點(diǎn)等內(nèi)容。,世界衛(wèi)生組織(WHO)(/),WHO的主頁對WHO進(jìn)行了介紹并報道了最新消息,包括疾病爆發(fā)新聞、專題報道、會議消息、新聞等,此外還鏈接了國家、衛(wèi)生專題、出版物、研究工具、WHO站點(diǎn)等。,中國醫(yī)學(xué)生物信息網(wǎng)(CMBI,(),中國醫(yī)學(xué)生物信息網(wǎng)(CMBI)是由北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部開發(fā)研制的綜合性醫(yī)學(xué)生物信息網(wǎng)。其目的是結(jié)合我國實際,全面系統(tǒng)和有重點(diǎn)地搜集整理國際醫(yī)學(xué)和生物學(xué)的研究信息,并加以分析綜合,為我國醫(yī)學(xué)和生物學(xué)的教學(xué)科研醫(yī)療和生物高技術(shù)產(chǎn)業(yè)的開發(fā)提供信息服務(wù)。,中國醫(yī)學(xué)生物信息網(wǎng)的信息部分主要由醫(yī)學(xué)新聞、最新文獻(xiàn)、特別報道、lnsight、專題網(wǎng)頁、今日臨床、數(shù)據(jù)庫等八部分內(nèi)容組成,每一頁下又有若干細(xì)類。如專題網(wǎng)頁里包括了近期熱點(diǎn)如干細(xì)胞、基因治療等網(wǎng)頁,內(nèi)容豐富新穎。數(shù)據(jù)庫里包括了心血管病、生物活性多肽等多個醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫。,中國醫(yī)學(xué)生物信息網(wǎng)主頁的左側(cè)有多個網(wǎng)絡(luò)工具的鏈接,如導(dǎo)航系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)資源及友情鏈接等,不僅為用戶提供了許多通用和生物醫(yī)學(xué)專用的搜索引擎,還提供了MEDLINE、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBMdisc)等多個生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的鏈接。,國家科技圖書文獻(xiàn)中心,國家科技圖書文獻(xiàn)中心是根據(jù)國務(wù)院領(lǐng)導(dǎo)的批示于2000年6月12日組建的一個虛擬的科技文獻(xiàn)信息服務(wù)機(jī)構(gòu),由中國科學(xué)院文獻(xiàn)情報中心、工程技術(shù)圖書館(中國科學(xué)技術(shù)信息研究所、機(jī)械工業(yè)信息研究院、冶金工業(yè)信息標(biāo)準(zhǔn)研究院、中國化工信息中心)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院圖書館、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院圖書館組成。,互聯(lián)網(wǎng)上的電子期刊大致可以分為兩類:一類是免費(fèi)資源,對用戶免費(fèi)開放;另一類是收費(fèi)資源,需要付費(fèi)注冊才能使用。國內(nèi)主要電子期刊數(shù)據(jù)庫有中文科技期刊數(shù)據(jù)庫(VIP)中國期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI-CJFD)萬方數(shù)據(jù)庫(萬方數(shù)據(jù)資源系統(tǒng)),國內(nèi)電子期刊數(shù)據(jù)庫,OVID系統(tǒng)醫(yī)學(xué)期刊全文數(shù)據(jù)庫()共有上千種醫(yī)學(xué)期刊,回溯至1993年EBSCO期刊全文數(shù)據(jù)庫()共1200多種,其中生物醫(yī)學(xué)期刊554種,回溯至1984年,國外電子期刊數(shù)據(jù)庫,ElservierScience()荷蘭Elsevier公司是世界著名的學(xué)術(shù)期刊出版商,出版有1300多種學(xué)術(shù)期刊,其中醫(yī)學(xué)期刊232種,生命科學(xué)期刊339種。從1997年開始,該

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