MEGA軟件——系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法_第1頁
MEGA軟件——系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法_第2頁
MEGA軟件——系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法_第3頁
MEGA軟件——系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法_第4頁
MEGA軟件——系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法_第5頁
已閱讀5頁，還剩6頁未讀， 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明：本文檔由用戶提供并上傳，收益歸屬內(nèi)容提供方，若內(nèi)容存在侵權(quán)，請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

MEGA軟件系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法（圖文講解）一、序列文本的準(zhǔn)備構(gòu)樹之前先將目標(biāo)基因序列都分別保存為txt文本文件中（或者把所有序列保存在同一個(gè)txt文本中,可以用“>基因名稱”作為第一行，然后重起一行 編輯基因序列），序列只包含序列字母（ATCG或氨基酸簡寫字母）。文件名名稱可以已經(jīng)您的想法隨意編輯。二、序列導(dǎo)入到Mega 5軟件（1）打開Mega 5軟件，界面如下（2）導(dǎo)入需要構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的目的序列OK選擇分析序列類型（如果是DNA序列，點(diǎn)擊DNA，如果是蛋白序列，點(diǎn)擊Protein）出現(xiàn)新的對(duì)話框，創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)文件選擇序列類型導(dǎo)入序列導(dǎo)入序列成功。（3）序列比對(duì)分析點(diǎn)擊工具欄中“W”工具，進(jìn)行比對(duì)分析，比對(duì)結(jié)束后刪除兩端不能夠完全對(duì)齊堿基（4）系統(tǒng)發(fā)育分析關(guān)閉窗口，選擇保存文件路徑，自定義文件名稱三、系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建根據(jù)不同分析目的，選擇相應(yīng)的分析算法，本例子以NJ算法為例Bootstrap 選擇1000，點(diǎn)擊Compute，開始計(jì)算計(jì)算完畢后，生成系統(tǒng)發(fā)育樹。根據(jù)不同目的，導(dǎo)出分析結(jié)果，進(jìn)行簡單的修飾，保存

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明，都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等，如果需要附件，請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙，網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽，若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間，僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理，對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯，并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容，請(qǐng)與我們聯(lián)系，我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論