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文檔簡介
1、生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫PubMedPubMed數(shù)據(jù)庫簡介數(shù)據(jù)庫簡介 PubMedPubMed是美國國立醫(yī)學圖書館是美國國立醫(yī)學圖書館(NLM) (NLM) 的國家生物技的國家生物技術(shù)信息中心術(shù)信息中心(NCBI)(NCBI)開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學信息檢索開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學信息檢索系統(tǒng)。系統(tǒng)。 收錄收錄19661966年以來的包含醫(yī)學、護理、牙科、獸醫(yī)、年以來的包含醫(yī)學、護理、牙科、獸醫(yī)、健康保健系統(tǒng)及前臨床科學的文獻。這些數(shù)據(jù)來源健康保健系統(tǒng)及前臨床科學的文獻。這些數(shù)據(jù)來源于于7070多個國家和地區(qū)的多個國家和地區(qū)的40004000多種生物醫(yī)學期刊。多種生物醫(yī)學期刊。 數(shù)據(jù)類型:
2、期刊論文、綜述、以及會議論文等。數(shù)據(jù)類型:期刊論文、綜述、以及會議論文等。PUBMEDPUBMED檢索途徑檢索途徑一、基本檢索區(qū)一、基本檢索區(qū)二、輔助檢索區(qū)二、輔助檢索區(qū)三、個性化檢索區(qū)三、個性化檢索區(qū)基本檢索區(qū)基本檢索區(qū)輔助檢索區(qū)提供輔助檢索區(qū)提供輔助檢索功能輔助檢索功能個性化檢索區(qū)個性化檢索區(qū)PubMedPubMed主頁主頁一、基本檢索一、基本檢索可對任何具有實質(zhì)意義的詞都可以進行檢索,如可對任何具有實質(zhì)意義的詞都可以進行檢索,如: 1.詞語檢索詞語檢索 自動匹配功能自動匹配功能 2.精確檢索精確檢索 用用“ ”進行強制短語檢索進行強制短語檢索 3.截詞檢索截詞檢索 用通配符用通配符 ?,
3、?,*檢索檢索 4.邏輯組配檢索邏輯組配檢索 AND OR NOT 5.作者檢索作者檢索 6.期刊檢索期刊檢索一、基本檢索一、基本檢索1.詞語檢索詞語檢索自動匹配轉(zhuǎn)換自動匹配轉(zhuǎn)換.自動匹配轉(zhuǎn)換功能 主題詞索引主題詞索引 作者索引作者索引 期刊索引期刊索引自動匹配轉(zhuǎn)換過程自動匹配轉(zhuǎn)換過程.2.精確檢索精確檢索一、基本檢索一、基本檢索強制將其作為強制將其作為一個詞組檢索一個詞組檢索3.截詞檢索截詞檢索一、基本檢索一、基本檢索無限截詞檢索無限截詞檢索3.截詞檢索截詞檢索一、基本檢索一、基本檢索有限截詞檢索有限截詞檢索4.邏輯組配檢索邏輯組配檢索一、基本檢索一、基本檢索邏輯組配檢索邏輯組配檢索(1)通
4、過)通過“l(fā)imit”的的”search by author”5.作者檢索作者檢索一、基本檢索一、基本檢索一、基本檢索一、基本檢索(2)用字段限定)用字段限定au檢索檢索5.作者檢索作者檢索一、基本檢索一、基本檢索5.作者檢索作者檢索(3)通過系統(tǒng)自動)通過系統(tǒng)自動匹配功能自動檢索匹配功能自動檢索一、基本檢索一、基本檢索6.期刊檢索期刊檢索(1)用字段限定)用字段限定ta檢索檢索一、基本檢索一、基本檢索(2)通過系統(tǒng)自動)通過系統(tǒng)自動匹配功能自動檢索匹配功能自動檢索6.期刊檢索期刊檢索一、基本檢索一、基本檢索(3)通過)通過“l(fā)imit”的的“search by journal”6.期刊檢索期
5、刊檢索一、基本檢索一、基本檢索6.期刊檢索期刊檢索(4)通過)通過“期刊期刊數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫”檢索檢索一、基本檢索一、基本檢索6.期刊檢索期刊檢索一、基本檢索一、基本檢索點擊選中點擊選中發(fā)送至檢索恇發(fā)送至檢索恇6.期刊檢索期刊檢索一、基本檢索一、基本檢索點擊執(zhí)行檢點擊執(zhí)行檢索索6.期刊檢索期刊檢索一、基本檢索一、基本檢索6.期刊檢索期刊檢索檢索結(jié)果檢索結(jié)果二、輔助檢索區(qū)二、輔助檢索區(qū)1.Limit 1.Limit (限定檢索)(限定檢索)2.Preview/index2.Preview/index(預覽(預覽/ /索引)索引)3.History3.History(檢索史)(檢索史)4.Clipbo
6、rard4.Clipborard(剪貼板)(剪貼板)5.Detail5.Detail(檢索式詳覽)(檢索式詳覽)作者限定作者限定添加作者姓名輸入框添加作者姓名輸入框清除限定清除限定期刊限定期刊限定作者姓名索引選詞作者姓名索引選詞多作者邏輯多作者邏輯匹配選項匹配選項全文、免費全文、摘要限全文、免費全文、摘要限定定日期限定日期限定1.Limit 對檢索結(jié)果進行多重對檢索結(jié)果進行多重限定限定出版日期限定出版日期限定入庫日期限定入庫日期限定研究對象研究對象人人/動物限定動物限定研究對象性別限定研究對象性別限定語種限定語種限定子文檔限定子文檔限定文獻類型限定文獻類型限定研究對象年齡限定研究對象年齡限定檢
7、索字段限定檢索字段限定執(zhí)行檢索執(zhí)行檢索清除所有限定清除所有限定2.Previw/index(檢索策略預覽) 瀏覽檢索式 改變檢索式 (可用檢索式編號#1 OR #2) 瀏覽索引(index)檢索預覽檢索預覽檢索歷史檢索歷史索引加詞檢索索引加詞檢索步驟步驟3 索引選詞索引選詞步驟步驟4 確定與檢索欄中確定與檢索欄中檢索提問的邏輯關(guān)系檢索提問的邏輯關(guān)系步驟步驟2 輸入待選詞輸入待選詞步驟步驟1 點擊預覽和索引點擊預覽和索引 檢索式回顧 編輯檢索式 如#3 AND child3.History(檢索史)檢索歷史回顧檢索歷史回顧檢索式檢索式檢索時間檢索時間檢出篇數(shù)檢出篇數(shù)檢索式編號可替代檢索式進行輸入
8、檢索檢索式編號可替代檢索式進行輸入檢索如:如:#5 AND #6用于暫時存放選中的文獻,以備集中顯示、打印或存盤。4.Clipboard(剪貼板)檢索時間檢索時間4.Clipboard(剪貼板)點擊剪貼板顯示點擊剪貼板顯示被剪貼的內(nèi)容被剪貼的內(nèi)容5.Details (匹配過程) 顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運算詳細過程顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運算詳細過程 用途:轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范詞用途:轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范詞 如:如:liver cancer liver neoplasms 修改檢索策略修改檢索策略顯示數(shù)據(jù)庫自動顯示數(shù)據(jù)庫自動匹配轉(zhuǎn)換過程匹配轉(zhuǎn)換過程檢索詞轉(zhuǎn)換檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用戶輸入的檢索式顯示用戶輸入的檢索式檢索明細檢
9、索明細5.Details (匹配過程)三、個性化檢索三、個性化檢索1.Mesh Database1.Mesh Database2.2.引文匹配器引文匹配器3.3.臨床問題臨床問題三、個性化檢索三、個性化檢索1.Mesh DatabaseMesh Database 確定規(guī)范檢索詞確定規(guī)范檢索詞 查看詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表查看詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表 副主題詞、擴展、主要主題詞副主題詞、擴展、主要主題詞 例:欲查腎衰竭的飲食療法相關(guān)文獻?例:欲查腎衰竭的飲食療法相關(guān)文獻?MeSH Database 規(guī)范主題詞數(shù)據(jù)庫檢索規(guī)范主題詞數(shù)據(jù)庫檢索腎衰竭飲食療法課題腎衰竭飲食療法課題1.輸入檢索詞輸入檢索詞3.點
10、按規(guī)范詞可獲詳細注解點按規(guī)范詞可獲詳細注解2.執(zhí)行瀏覽執(zhí)行瀏覽主題詞注釋主題詞注釋可選副主題詞可選副主題詞限定作為限定作為主要主題主要主題詞匹配詞匹配不進行下位詞擴檢不進行下位詞擴檢該主題詞所替代的該主題詞所替代的非規(guī)范詞形式非規(guī)范詞形式主題詞樹形結(jié)構(gòu)主題詞樹形結(jié)構(gòu)表:顯示該詞的表:顯示該詞的學科隸屬關(guān)系學科隸屬關(guān)系可選副主題詞可選副主題詞選擇檢索選擇檢索點擊執(zhí)行檢索點擊執(zhí)行檢索檢出結(jié)果更為專指檢出結(jié)果更為專指通過通過MeSH Database檢索的結(jié)果,其中檢索的結(jié)果,其中4篇篇綜述文獻綜述文獻2.2.引文匹配器引文匹配器(Citation MatcherCitation Matcher):
11、 : Single citation matcher(單篇引文匹配器) 查找特定文獻進行補缺,以查文獻的準確信息。如查找:由Chang PY(taiwan yi xue hui za zhi ) 撰寫、 1975 發(fā)表文獻的其他著者 Batch citation matcher(批量引文匹配器)輸入待檢刊名輸入待檢刊名輸入待檢第一著者輸入待檢第一著者特定文獻查找(已知文獻第一著特定文獻查找(已知文獻第一著者,欲查其他信息如其他著者等)者,欲查其他信息如其他著者等)得出其他著者得出其他著者用于核對批量文獻信息用于核對批量文獻信息插入文件插入文件輸入輸入EMAIL地址地址輸入已知文獻信息輸入已知文
12、獻信息3.臨床問題(Clinical Queries)專門為臨床醫(yī)生設計的一種檢索服務,專門為臨床醫(yī)生設計的一種檢索服務, Search by clinical study categorySearch by clinical study category Find systematic reviewsFind systematic reviews Special queriesSpecial queries3.3.臨床問題(臨床問題(Clinical Queries)Clinical Queries)用于臨床問題的檢索用于臨床問題的檢索3.3.臨床問題(臨床問題(Clinical Queri
13、es)Clinical Queries)輸入檢索詞輸入檢索詞檢索設置檢索設置3.3.臨床問題(臨床問題(Clinical Queries)Clinical Queries)檢索結(jié)果檢索結(jié)果檢索結(jié)果輸出 顯示檢索結(jié)果顯示檢索結(jié)果 保存檢索結(jié)果保存檢索結(jié)果 保存檢索策略保存檢索策略 打印檢索結(jié)果打印檢索結(jié)果顯示字段選擇(顯示字段選擇(Display)Display) Abstract :Abstract :來源期刊、標題、著者、著者地來源期刊、標題、著者、著者地址、記錄性質(zhì)、文獻類型、勘誤、評論、址、記錄性質(zhì)、文獻類型、勘誤、評論、PMIDPMID或或UIUI、摘要。、摘要。 SummerySum
14、mery:作者:作者 Citation : Citation : 顯示除上述內(nèi)容外,加顯示除上述內(nèi)容外,加MeSHMeSH敘敘詞、化學物質(zhì)名稱、資助項目號等字段。詞、化學物質(zhì)名稱、資助項目號等字段。 MEDLINE : (MEDLINE : (最完整,有標識符)最完整,有標識符)顯示格式選擇顯示格式選擇顯示字段選擇(Display)記錄選擇 單一記錄:著者姓名 所有記錄: 選定記錄: 方框內(nèi)打鉤輸出格式選擇(send to)選中題錄(或文摘)后選中題錄(或文摘)后 TextText: 文本格式文本格式,用瀏覽器文件保存用瀏覽器文件保存 File File : 文件格式保存文件格式保存 Clip
15、boadClipboad :暫存需下載記錄,暫存需下載記錄,多項檢索后一起多項檢索后一起保存。保存。 最多最多允許存儲允許存儲500500條,保留條,保留8 8小時。小時。 EmailEmail: 通過郵件發(fā)送通過郵件發(fā)送 OtherOther: 全文傳遞服務等申請,需帳號、收費全文傳遞服務等申請,需帳號、收費獲取原文及相關(guān)資源 1.聯(lián)機獲取原文(聯(lián)機獲取原文( free full text articlefree full text article) 2. link out2. link out 3.3.向有關(guān)圖書館索要向有關(guān)圖書館索要 4.4.其他數(shù)據(jù)庫資源(生物信息學等)其他數(shù)據(jù)庫資源(
16、生物信息學等)文摘中的期刊圖標鏈接文摘中的期刊圖標鏈接Linkout鏈接點擊獲取原文點擊獲取原文檢索實例1. 1.哮喘的藥物治療(哮喘的藥物治療(asthma, drug therapyasthma, drug therapy) asthma/drug therapyasthma/drug therapy2.2.阿司匹林治療心肌梗死(阿司匹林治療心肌梗死(aspirin, aspirin, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapeutic use, myocardial infarction, drug therapytherap
17、y)aspirin/therapeutic use ANDaspirin/therapeutic use ANDmyocardial infarction/drug therapymyocardial infarction/drug therapy1.哮喘的藥物治療選擇選擇MeSH Database輸入檢索詞(單詞、詞組)輸入檢索詞(單詞、詞組)(不能輸有運算符的語句如:(不能輸有運算符的語句如:asthma AND therapy)點擊相關(guān)規(guī)范詞點擊相關(guān)規(guī)范詞選擇副主題詞選擇副主題詞選擇檢索選擇檢索執(zhí)行檢索執(zhí)行檢索檢索結(jié)果檢索結(jié)果題錄:著者、篇名、刊名題錄:著者、篇名、刊名2.阿司匹林治療心肌梗死首先,將概念切分成首先,將概念切分成2個面:個面:Aspirin/治療應用治療應用心肌梗死心肌梗死/藥物治療藥物治療然后,分別進行規(guī)范詞選擇檢索然后,分別進行規(guī)范詞選擇檢索這里是第一個這里是第一個概念面檢出的概念面檢出的文獻,文獻,18885條
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