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文檔簡(jiǎn)介
1、人類染色體疾病的診斷三1 第五節(jié)第五節(jié) 熒光原位雜交(熒光原位雜交(FISH) 人類染色體疾病的診斷三2 染色體顯帶技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)染色體顯帶技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn) 人類染色體疾病的診斷三3 一、一、FISH原理原理 依據(jù)DNA雙鏈堿基互補(bǔ)、變性雙鏈堿基互補(bǔ)、變性 和復(fù)性原理,用已知堿基序列和復(fù)性原理,用已知堿基序列 的單鏈核酸片段作為探針檢測(cè)的單鏈核酸片段作為探針檢測(cè) 樣本中是否存在與其互補(bǔ)的同樣本中是否存在與其互補(bǔ)的同 源核酸序列,這一過程叫做雜源核酸序列,這一過程叫做雜 交。交。 原位雜交 (in situ hybridization)是用已是用已 標(biāo)記的核酸探針與組織切片或標(biāo)記的核酸探針與組織切片或
2、 細(xì)胞中的待測(cè)核酸中的互補(bǔ)序細(xì)胞中的待測(cè)核酸中的互補(bǔ)序 列雜交列雜交,從而對(duì)組織細(xì)胞中的從而對(duì)組織細(xì)胞中的 核酸進(jìn)行定性、定位和相對(duì)定核酸進(jìn)行定性、定位和相對(duì)定 量分析。量分析。 人類染色體疾病的診斷三4 原位雜交原位雜交 人類染色體疾病的診斷三5 熒光原位雜交(熒光原位雜交(FISH) 人類染色體疾病的診斷三6 原理:通過觀察熒光信號(hào)在染色體上的位置來反映相應(yīng)基因的情況。 人類染色體疾病的診斷三7 人類染色體疾病的診斷三8 二、二、FISH的優(yōu)點(diǎn):的優(yōu)點(diǎn): 人類染色體疾病的診斷三9 三、三、FISH探針探針 l優(yōu)點(diǎn):在信號(hào)較 弱或較小時(shí)可經(jīng)抗 原抗體反應(yīng)擴(kuò)大 l缺點(diǎn) 步驟較多, 操作麻煩。
3、(一)、直接標(biāo)記和間接標(biāo)記(一)、直接標(biāo)記和間接標(biāo)記 人類染色體疾病的診斷三10 直接用熒光素標(biāo)記DNA的方法稱為直接標(biāo)記直接標(biāo)記。 l優(yōu)點(diǎn):由于直接標(biāo)記的探針雜交后可馬上觀察到熒光信 號(hào), 省去了煩瑣的免疫熒光反應(yīng)。由于近年來熒光素的亮度 和抗淬滅性的不斷改進(jìn)和提高, 直接標(biāo)記的熒光探針應(yīng)用越 來越多。 人類染色體疾病的診斷三11 探針標(biāo)記 人類染色體疾病的診斷三12 (二)、(二)、FISH探針的種類探針的種類 人類染色體疾病的診斷三13 人類染色體疾病的診斷三14 人類染色體疾病的診斷三15 四、FISH的臨床應(yīng)用 人類染色體疾病的診斷三16 人類染色體疾病的診斷三17 染色體著絲粒熒光
4、 人類染色體疾病的診斷三18 染色體端粒熒光 人類染色體疾病的診斷三19 人類染色體疾病的診斷三20 人類染色體疾病的診斷三21 人類染色體疾病的診斷三22 人類染色體疾病的診斷三23 人類染色體疾病的診斷三24 人類染色體疾病的診斷三25 人類染色體疾病的診斷三26 人類染色體疾病的診斷三27 FISH檢測(cè)不需要進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),是臨床遺傳學(xué)檢測(cè)的有效補(bǔ)充檢測(cè)不需要進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),是臨床遺傳學(xué)檢測(cè)的有效補(bǔ)充 手段:手段: 傳統(tǒng)的染色體檢查方法周期長(zhǎng),人工消耗大,而且染色體分 析需要有較好質(zhì)量的中期分裂相。白血病患者腫瘤細(xì)胞中期分 裂相不易獲得,而且有些重要預(yù)后意義的累及基因位點(diǎn)的微缺 失或僅存在于
5、間期細(xì)胞中的異常,傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)是不 能檢測(cè)出來的。 熒光原位雜交技術(shù)不需要中期分裂相,因此可分析大量間期 細(xì)胞,且具有操作相對(duì)簡(jiǎn)單、重復(fù)性好、敏感性和特異性高的 優(yōu)點(diǎn)。但需要指定基因特異性的探針,失去了核型分析的宏觀 性。 人類染色體疾病的診斷三28 Translocation t(9;22)(q34;q11) 人類染色體疾病的診斷三29 Translocation t(9;22)(q34;q11) 人類染色體疾病的診斷三30 在正常的細(xì)胞中,兩個(gè)紅點(diǎn)和兩個(gè)綠點(diǎn)分別表 示正常的ABL和BCR基因的正常位置。在不正 常的細(xì)胞中,BCR-ABL融合基因呈現(xiàn)為紅綠兩 種顏色的融合,這種融合基
6、因常常在觀察中顯 示為黃色熒光(箭頭所指)。 人類染色體疾病的診斷三31 五、幾種新技術(shù)介紹五、幾種新技術(shù)介紹 人類染色體疾病的診斷三32 1.多色熒光原位雜交(多色熒光原位雜交(M-FISH) 采用全染色體探針(WCP)與染色體雜交,分析染色體數(shù)量和結(jié)構(gòu)異常的 分子生物學(xué)方法。 探針是經(jīng)過聚合酶鏈反應(yīng)(Degenerate oligonucleotideprimed polymerase chain reaction, DOP-PCR)擴(kuò)增、 流式分選、 并用 5 種熒光素組合熒光標(biāo)記法標(biāo)記的 同源染色體。這種經(jīng)過標(biāo)記的探針集合(Pool) 與制備好的間期細(xì)胞染色體雜交, 可使雜交后的每 條
7、染色體表現(xiàn)出獨(dú)有的顏色, 從而能夠分辨出人的 22 對(duì)常染色體和X、Y 兩條性染色體(圖215), 雜交 后的圖像通過濾光裝置被計(jì)算機(jī)獲得并分析得出結(jié) 果。如果一條染色體的顏色不相同, 則提示 該條染色體有重組現(xiàn)象, 根據(jù)每條染色體各自獨(dú)有 的顏色, 可以知道哪幾條染色體之間進(jìn)行了重組 人類染色體疾病的診斷三33 M-FISH 對(duì)染色體間復(fù)雜易位的分析有突出優(yōu)勢(shì), 但是對(duì)染色體微小易位(1MB)的分析則受到限制, 而對(duì)染色體內(nèi)部異常的分析則無能為力, 這包括 染色體的擴(kuò)增、微小缺失和倒位 人類染色體疾病的診斷三34 染色體光譜核型比對(duì)分析技術(shù)(SKY-spectral- karyotyping
8、)-創(chuàng)新的染色體數(shù)目和結(jié)構(gòu)異常檢查工具 原理:光譜核型分析SKY經(jīng)由CCD相機(jī)擷取圖像, 利用光譜干涉儀及傅立葉轉(zhuǎn)換技術(shù),分辨獲得圖像每一 像素點(diǎn)的光譜,以此標(biāo)定出不同光譜的不同顏色。 優(yōu)勢(shì): 對(duì)比傳統(tǒng)的M-FISH,光譜核型分析技術(shù)的采 用優(yōu)勢(shì)無法比擬。 一 傳統(tǒng)的技術(shù)使用顯微鏡熒光濾鏡來分辨熒光信號(hào), 缺點(diǎn)存在嚴(yán)重的熒光信號(hào)干擾(cross-talk),信號(hào)重疊, 信號(hào)位移等,無法有效分辨染色體,也無法準(zhǔn)確診斷染 色體的細(xì)微變異,異位。而SKY完全克服以上缺點(diǎn),對(duì) 圖像每一像素的光譜標(biāo)以不同顏色,顯而易見。 二 從成本上看,不需要電動(dòng)顯微鏡,熒光濾鏡僅使 用一顆SKY濾鏡,SKYPaint
9、探針做一次雜交,一次圖像 擷取,讓使用人員減輕時(shí)間,精力,同時(shí)獲取穩(wěn)定結(jié)果。 人類染色體疾病的診斷三35 人類染色體疾病的診斷三36 4. 4. 比較基因組雜交比較基因組雜交 Comparative Genomic Hybridization (CGH) (CGH) 原理:原理:在熒光原位雜交基礎(chǔ)上,結(jié)合消減雜在熒光原位雜交基礎(chǔ)上,結(jié)合消減雜 交技術(shù)而發(fā)展起來的技術(shù),主要用于交技術(shù)而發(fā)展起來的技術(shù),主要用于 腫瘤的檢測(cè)及其基因組分析腫瘤的檢測(cè)及其基因組分析 是由是由Kallioniemi等在等在1992年首先提出的,是年首先提出的,是 檢測(cè)整個(gè)腫瘤基因組檢測(cè)整個(gè)腫瘤基因組DNA增加或減少的強(qiáng)有
10、力增加或減少的強(qiáng)有力 的工具的工具 人類染色體疾病的診斷三37 比較基因組雜交(CGH) 人類染色體疾病的診斷三38 比較基因組雜交原理示意比較基因組雜交原理示意 腫瘤腫瘤DNADNA和對(duì)照和對(duì)照DNADNA在染色在染色 體上的相對(duì)結(jié)合量取決于兩體上的相對(duì)結(jié)合量取決于兩 種種DNADNA標(biāo)本中相應(yīng)雜交序列標(biāo)本中相應(yīng)雜交序列 的多少的多少 因此可根據(jù)不同熒光強(qiáng)度因此可根據(jù)不同熒光強(qiáng)度 的比率而定量分析腫瘤基因的比率而定量分析腫瘤基因 組中組中DNADNA的增加或丟失的增加或丟失 等比混合等比混合 人類染色體疾病的診斷三39 比較基因組雜交過程比較基因組雜交過程 人類染色體疾病的診斷三40 DAP
11、IDAPI 4 4,6-,6-二聯(lián)脒二聯(lián)脒-2-2- 吲哚苯吲哚苯 FITC 異硫氰酸酯異硫氰酸酯 TRITC 硫氰酸四甲基羅丹明硫氰酸四甲基羅丹明 人染色體不同熒光素染色結(jié)果人染色體不同熒光素染色結(jié)果 人類染色體疾病的診斷三41 數(shù)字化圖像數(shù)字化圖像 人類染色體疾病的診斷三42 FITC/TRITC FITC/TRITC 熒光強(qiáng)度比率分析圖熒光強(qiáng)度比率分析圖 Ratio image FITC/TRITCRatio image FITC/TRITC 人類染色體疾病的診斷三43 人類染色體疾病的診斷三44 比較基因組雜交應(yīng)用范疇比較基因組雜交應(yīng)用范疇 人類染色體疾病的診斷三45 優(yōu)勢(shì):優(yōu)勢(shì): 可快捷檢測(cè)中期、間期基因組可快捷檢測(cè)中期、間期基因組 不需預(yù)先知道不需預(yù)先知道DNA發(fā)生改變的部位發(fā)生改變的部位 一次實(shí)驗(yàn)即可檢出待測(cè)樣本整個(gè)基因一次實(shí)驗(yàn)即可檢出待
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