【圖文】更換體系進(jìn)行計(jì)算的流程

1、【精品文檔】如有侵權(quán)，請(qǐng)聯(lián)系網(wǎng)站刪除，僅供學(xué)習(xí)與交流【圖文】更換體系進(jìn)行計(jì)算的流程.精品文檔.【圖文】更換體系進(jìn)行計(jì)算的流程1、 尋找體系1. 雙擊，打開(kāi)軟件。在此處輸入體系中所含的元素2. 點(diǎn)擊左邊按鈕中的，出現(xiàn)如下對(duì)話框點(diǎn)擊Search若不允許其他元素出現(xiàn)，可不勾選該項(xiàng)3. 出現(xiàn)如下對(duì)話框點(diǎn)擊該處4. 出現(xiàn)如下對(duì)話框在此處選擇所需的體系點(diǎn)擊藍(lán)色數(shù)字鏈接點(diǎn)擊“Author/Journal”點(diǎn)擊OK選擇該項(xiàng)隨便輸入信息點(diǎn)擊該項(xiàng)，下載得到一個(gè)cif文件點(diǎn)擊此處在出現(xiàn)的網(wǎng)頁(yè)中輸入CCDC號(hào)出現(xiàn)如下頁(yè)面隨便輸入信息勾選該項(xiàng)（另法：打開(kāi)Conquest1.8，單擊Author/Journal,在Aut

2、hors Names一欄輸入Cotton，單擊search； start search后找到IZOYAX；單擊菜單欄File, Export Entries as，點(diǎn)File Popup）2、 文件間的轉(zhuǎn)換1. 下載的文件用軟件“mercury.exe”打開(kāi)（圖標(biāo)為Hg的軟件）。2. 單擊filesave as，選擇文件類型為Mol2 files (*xmol2)，保存3. 用Gauss View打開(kāi)保存的文件，右鍵選擇Builder，單擊Delete Atom，刪除不需要的原子，然后Save(gjf)。4. 用Chemcraft打開(kāi)保存文件，單擊save point group ，選擇Cn-

3、C4,單擊Choose；單擊 Coord +show in format + Molpro format,然后復(fù)制坐標(biāo)到gjf文件5. 用Gauss view打開(kāi)gjf文件，單擊Edit,點(diǎn)Point Group,勾選Enable*,選擇C4,然后save。得到該體系的gjf文件。 將該段文件復(fù)制至1CrCrZn-b3pw91.gjf文件中取代原先的關(guān)鍵字三、gjf文件的修改1.將保存的gjf文件重命名，例：1CrCrZn-b3pw91.gjf。2.登陸學(xué)校機(jī)群下載之前成功算出的CrCrFe的gjf、pbs文件3.打開(kāi)CrCrFe的gjf文件將所用泛函復(fù)制1CrCrZn-b3pw91.gjf文件中取代坐標(biāo)以下的文字，將Fe均修改Zn，最后空兩行以上四、pbs文件的修改將此處修改跟g