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文檔簡介
1、 技術(shù)咨詢電話:400-607-9999土壤腐殖酸清除劑Soil Humic Acid Erasol貨號(hào): M090138產(chǎn)品及特點(diǎn) 土壤和湖海沉積物中都含有棕黑色或黑色的腐殖酸,它們對(duì)PCR等后續(xù)反應(yīng)有極大的抑制作用,所以有效去除土壤中腐殖酸是提取土壤微生物DNA的重要環(huán)節(jié),但是目前市場(chǎng)上沒有專門的產(chǎn)品,針對(duì)這一情況,本公司開發(fā)了本產(chǎn)品,專門用于對(duì)提取DNA用的土壤進(jìn)行預(yù)處理,以清除腐殖酸成分。1. 清除效果好,一次能使腐殖酸的濃度降低50%左右。2. 適合于黃色、紅色、黑色和棕黑色等各種質(zhì)地的土壤和河海沉積物。3. 操作過程簡單快速,一次處理只需要10分鐘。4. 擴(kuò)容性好,可小規(guī)模操作,也
2、可以大規(guī)模操作。規(guī)格及成分 成份100mL包裝本產(chǎn)品100 mL使用手冊(cè)1份運(yùn)輸及保存常溫運(yùn)輸,4保存,有效期一年。使用方法1. 按每1克土壤加10 mL本產(chǎn)的比例將土壤樣品與本產(chǎn)品混合。2. 震蕩器上震蕩3-5分鐘。3. 3000-5000 g室溫離心5分鐘,棄上清,沉淀的土壤可直接用于DNA提取。注意:此操作可以多次重復(fù)。具體次數(shù)取決于土壤中腐殖酸的濃度,一般每洗滌1次就可以取掉50%以上的腐殖酸,一般土壤洗滌1-3次即可。疑難解答Q: 如何判斷提取的沒有腐植酸污染?A:方法一是目測(cè)法,即看得到的溶液是否無色。如果呈淡棕黑色或淡黃色,說明可能是少量殘留的未除盡的腐植酸。方法二是檢測(cè)最大光吸
3、收。注意:有腐植酸污染并不表示DNA不能使用,有的腐殖酸并不抑制PCR擴(kuò)增。Q: 腐殖酸的最大吸收波長是多少?A:腐植酸(humic acid)是一大類呈棕黑色或黑色的物質(zhì),其結(jié)構(gòu)千差萬別,土壤中腐殖酸的組成和特點(diǎn)隨土壤不同而不同,所以其最大吸收波長也各不相同。有的土壤的腐殖酸的最大吸收波長在260 nm(見Appl. Environ. Microbiol., 63:4993, 1997),有的則在340 nm,所以用特定的波長測(cè)定OD值時(shí)波長的選定要根據(jù)土壤而決定。Sigma, Fluka等公司出售的腐植酸產(chǎn)品成分一般比較簡單,其最大吸收波長不能推廣到成分更為復(fù)雜的土壤腐殖酸樣品。Q: 是否
4、腐植酸都會(huì)抑制后續(xù)的DNA反應(yīng)?A:否,因?yàn)楦菜崾且淮箢愇镔|(zhì)的統(tǒng)稱,他們的結(jié)構(gòu)和特性各不相同,所以是否對(duì)后續(xù)反應(yīng)有影響最好通過實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證。如果用提取的DNA溶液原液進(jìn)行反應(yīng)而反應(yīng)沒發(fā)生,而對(duì)照樣品(已知的不含污染的DNA)能夠發(fā)生,說明可能有抑制作用。Q:有什么有效方法去除DNA樣品中的腐植酸?A:可以先電泳,然后用超大片段膠回收試劑Magic Gel DNABACK(CAT#:M060021)純化DNA,還可以使用本公司的柱式腐植酸清除劑(CAT#:M090146)。Q:在用土壤DNA進(jìn)行細(xì)菌專一性PCR時(shí),為何沒加DNA模版的陰性對(duì)照有擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)?A:這是由于使用的Taq DNA聚合酶
5、一般從E.coli表達(dá)菌株中提取,提取過程中污染了E.coli的基因組DNA,而使用的廣譜細(xì)菌專一性引物可以識(shí)別所有細(xì)菌DNA基因組DNA模版,所以會(huì)產(chǎn)生擴(kuò)增。建議使用高質(zhì)量的Taq DNA聚合酶。技術(shù)資料腐殖酸及其特點(diǎn)腐植酸(humic acid)是動(dòng)、植物的殘骸經(jīng)過微生物的分解轉(zhuǎn)化和成千上萬年的復(fù)雜化學(xué)反應(yīng)而產(chǎn)生的,廣泛存在于土壤表面和江海沉積物中的一大類呈棕黑色或黑色的物質(zhì),其典型的分子結(jié)構(gòu)如下:腐殖酸的特點(diǎn)一是結(jié)構(gòu)千差萬別,二是能與金屬離子復(fù)合,三是能跟很多有機(jī)分子相互作用。由于這些特點(diǎn),一般DNA提取方法很難將各種腐殖酸分子與土壤DNA分離。污染的腐植酸可以抑制反應(yīng)和限制性內(nèi)切酶酶切反應(yīng),還可以降低的雜交效率和質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化效率。由于腐殖酸是一大類物質(zhì),其組成和特點(diǎn)隨土壤不同而不同,所以其最大吸收波長也各不相同,有的土壤的腐殖酸在260 nm有最大吸收(見Appl. Environ. Microbiol., 63:4993, 1997),有的則在340 nm。所以用特定的波長測(cè)定OD值不是定量腐殖酸的最佳方法, 波長的選定要根據(jù)土壤的不同而
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