文獻檢索pubmed解資料PPT課件

.,1,PubMed文獻服務(wù)系統(tǒng)及PubMedRSS學(xué)科跟蹤服務(wù),.,2,PubMed簡介,PubMed(Medline)由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NLM）、國際MEDLARS成員（中國為第16個成員國）及合作的專業(yè)組織共同研制開發(fā)，是目前國際上公認(rèn)的檢索生物醫(yī)學(xué)文獻最具權(quán)威、利用率最高、影響最廣的數(shù)據(jù)庫，也是我國衛(wèi)生部認(rèn)定的科技查新必須檢索的國外醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫。,.,3,提綱,PubMed概況PubMed功能欄介紹認(rèn)識PubMed文獻PubMed基本檢索PubMed高級檢索主題詞MeSH檢索循證及臨床查詢檢索PubMed全文獲取PubMedRSS學(xué)科跟蹤,.,4,概況,網(wǎng)址：/pubmed或PubMed收錄的期刊最早追溯至1865年，共收錄了70余個國家36000余種期刊，1900多萬篇文獻；PubMed的子集Medline收錄的文獻最早追溯至1902年，現(xiàn)有記錄1790多萬篇；目前每年增加約60余萬條文獻記錄；在全部記錄中有76%的文獻為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻為英文，共計收錄國內(nèi)出版的期刊170余種。,.,5,/pubmed,WelcometoPubMed,使用幫助,檢索詞輸入框,常用工具,更多服務(wù),.,6,認(rèn)識PubMed文獻,出處SO,篇名TI,作者AU,文獻類型(狀態(tài)),Summary,.,7,認(rèn)識PubMed文獻,調(diào)整顯示設(shè)置可改變顯示模式，顯示數(shù)量及檢索結(jié)果排序,顯示設(shè)置,顯示摘要,顯示數(shù)量,排序模式,.,8,認(rèn)識PubMed文獻,在摘要顯示模式下可以看到詳細(xì)的文獻信息,作者地址,文獻摘要,文獻作者,文獻篇名,全文鏈接,文獻類型,文獻主題詞,.,9,認(rèn)識PubMed文獻,出版社上傳,PreMedline,PubMed,Medline,PubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻的狀態(tài)，主要為Medline,.,10,認(rèn)識PubMed文獻,非英文的文獻篇名上有方括號且注明有語種,英文文獻,土耳其語,篇名,英文文獻,.,11,認(rèn)識PubMed文獻,電子優(yōu)先即最新文獻，一般比印刷出版提前三個月以上,電子優(yōu)先,2009年5月,2008年9月,.,12,PubMed基本檢索,自由詞檢索在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。例如：檢索腫瘤(cancer)方面的文章。在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進行檢索，比如，檢索“cancer”將自動轉(zhuǎn)換為：neoplasmsMeSHTermsORneoplasmsAllFieldsORcancerAllFields,.,13,自由詞檢索時PubMed自動將不規(guī)范的詞轉(zhuǎn)換成規(guī)范的詞進行檢索,自動詞匯轉(zhuǎn)換,PubMed基本檢索,.,14,PubMed基本檢索,布爾邏輯組合檢索，常用的邏輯關(guān)系詞有AND，OR，NOT等,邏輯與（AND）-檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B.如：AANDB,邏輯非（NOT）-在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。如：ANOTB,邏輯或（OR）-檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時含有檢索詞A和B的文獻。如：AORB,.,15,PubMed基本檢索,作者姓名檢索按照姓+名縮寫（不用標(biāo)點）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。姓名第一個字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫。考慮到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動轉(zhuǎn)換功能進行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號將作者名引起來，再加作者字段限定AU，如：smithjau，這樣可避免PubMed自動轉(zhuǎn)換，實現(xiàn)精確查找。,.,16,PubMed基本檢索,作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標(biāo)點鍵入作者姓名,smithj,.,17,PubMed基本檢索,精確檢索避免PubMed自動詞匯轉(zhuǎn)換，實現(xiàn)精確查找,smithjau,.,18,PubMed基本檢索,期刊檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：Europeanjournalofimmunology，系統(tǒng)的“自動詞語匹配”功能會將它轉(zhuǎn)換成EurJImmunolJournalOReuropeanjournalofimmunologyAllFields進行檢索。也可以直接輸入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式，如：EurJImmunol，或者是輸入刊物的ISSN（國際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）進行檢索，如：0014-2980。如果一個雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進行檢索。因此，需要將檢索請求進行標(biāo)準(zhǔn)化處理，即在雜志名后面加TA。如：cellta,.,19,PubMed基本檢索,期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號,EurJImmunol,.,20,PubMed基本檢索,期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢索，是在期刊名后面加字段限定TA.比如:cellta,cellta,.,21,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫（journaldatabase)期刊數(shù)據(jù)庫的作用：1、可以查看期刊的詳細(xì)信息，包括出版國家，出版社，出版語言，期刊類目等等；2、可以根據(jù)期刊的主題分類，查看medline收錄的各學(xué)科的期刊，比如查看medline收錄的關(guān)于麻醉學(xué)(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便檢索某本期刊上被PubMed收錄的所有文章。比如：我們想知道期刊AcadPediatr的全稱以及具體的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：點擊導(dǎo)航欄上的Journaldatabase，打開期刊數(shù)據(jù)庫檢索界面，在檢索框中輸入AcadPediatr，再點擊Go按鈕即可。,.,22,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角部分,期刊數(shù)據(jù)庫,.,23,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫可以查看指定期刊的詳細(xì)信息,Elsevier出版,期刊數(shù)據(jù)庫,.,24,PubMed基本檢索,按期刊主題瀏覽medline收錄的各學(xué)科的期刊,期刊主題,期刊數(shù)據(jù)庫,.,25,PubMed基本檢索,按字母順序瀏覽medline收錄的各學(xué)科期刊,麻醉學(xué)方面,.,26,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫可以方便的查看medline收錄的各學(xué)科方面的期刊,medline收錄的麻醉學(xué)方面的期刊,.,27,PubMed基本檢索,截詞檢索截詞檢索的作用：擴大檢索范圍，提高查全率。截詞符：用*表示，代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進行檢索。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacteriophage，bacterium，等最多600個單詞。,.,28,PubMed基本檢索,截詞檢索可以擴大檢索范圍提高查全率。,bacter*TI,.,29,PubMed基本檢索,字段限制檢索采用字段限制方式進行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1字段標(biāo)識邏輯運算符檢索詞2字段標(biāo)識如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻.檢索式：crickauAND1993dpANDDNA,.,30,PubMed基本檢索,crickauAND1993dpANDDNA,字段限制檢索其規(guī)則是：檢索詞+字段標(biāo)識,.,31,PubMed基本檢索,常用檢索字段描述和標(biāo)識Titleti：篇名字段Abstractab：摘要字段Affiliationad：著者地址字段。Authornameau：文章的作者，檢索格式：姓+名。如：smithjaauJournaltitleta：期刊名稱。如：celltaLanguagela：論文出版語種。語種檢索時可只輸入前3個字母，如：chila=chinesela；Englishlang=engla比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻檢索式:hypertensiontiANDchila,.,32,PubMed基本檢索,hypertensiontiANDchila,檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻,.,33,PubMed基本檢索,常用檢索字段描述和標(biāo)識Publicationdatedp:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DDDP要檢索一段時期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號，如：1993/01:1995/06DPPublicationtypept:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗等。如：reviewptMeSHtermsmh：主題詞字段。如：hypertensionmhSubheadingssh:副主題詞。與主題詞組配檢索.比如：檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻。1995/01:1996/12DPANDhypertensionmhANDreviewpt,.,34,PubMed基本檢索,檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻,1995/01:1996/12DPANDhypertensionmhANDreviewpt,.,35,PubMed基本檢索,常用檢索字段描述和標(biāo)識FILTERFilter：由PubMed系統(tǒng)鏈接的外部資源站點所使用的用來限定文獻的技術(shù)標(biāo)識，此檢索字段常用來限定檢索比如被F1000M評價的文獻等Facultyof1000是英國現(xiàn)代生物出版集團（BioMedCentral）為彌補只用期刊影響因子（IF）來衡量刊物的不足，近年來提出了“Facultyof1000”計劃。從全世界邀請數(shù)千名頂尖的生物學(xué)家和醫(yī)學(xué)專家，請他們從每年所發(fā)表的生物醫(yī)學(xué)SCI論文中評選出一小部分（約占0.1%）的文章，賦予F1000論文稱號，推薦給全世界的生物學(xué)和醫(yī)學(xué)工作者，并由“Facultyof1000”中的科學(xué)家對F1000論文逐篇加以評論。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的被Medline正式收錄且被F1000評價過的研究文獻”要求查準(zhǔn)不要求查全，對此構(gòu)建的檢索式：(nasopharyngealcancer)AND(Therapy/Narrowfilter)ANDmedlinesbANDloprovf1000mfilter,.,36,PubMed基本檢索,檢索鼻咽癌治療方面的且被Medline正式收錄及F1000評價過的研究文獻,F1000M文獻評價,.,37,PubMed基本檢索,強制檢索功能PubMed允許使用雙引號來強制系統(tǒng)進行短語檢索。如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“singlecell”，并用雙引號引起來。點擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。如果不使用雙引號進行強制檢索，系統(tǒng)就會將其分成2個詞：single和cell檢索，其檢索表達式為：singleANDcell.很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號要求的。,.,38,PubMed基本檢索,強制檢索,普通檢索,singlecell,singlecell,.,39,PubMed高級檢索,高級檢索,.,40,PubMed高級檢索,限定欄,預(yù)覽,高級檢索界面下可以看到明細(xì)欄，預(yù)覽，檢索史，限定和高級檢索等,檢索史,明細(xì)欄,高級檢索,更多服務(wù),.,41,PubMed高級檢索,姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻,姚開泰,作者,.,42,PubMed高級檢索,姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻,時間,2001,使用說明,.,43,PubMed高級檢索,Limit限定,年齡,物種,子集,全文,字段,時間,性別,語言,文獻類型,.,44,PubMed高級檢索,限定檢索范圍為近半年來以英文發(fā)表的循證醫(yī)學(xué)方面的文獻,限定為英文,限定為循證等文獻,限定為近半年,.,45,PubMed高級檢索,限定檢索范圍為被Medline正式收錄的有電子全文鏈接的中老年病例,限定為Medline,限定為有電子全文,限定為中老年,.,46,主題詞MeSH檢索,醫(yī)學(xué)主題詞表數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)醫(yī)學(xué)主題詞表是對生物醫(yī)學(xué)文獻進行主題分析、標(biāo)引和檢索的權(quán)威性詞表，它的作用是使醫(yī)學(xué)文獻的主題標(biāo)引和檢索達到統(tǒng)一和一致，并指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻。它可以指導(dǎo)用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞，告訴用戶主題詞如何使用，顯示主題詞之間的相互關(guān)系。,.,47,主題詞MeSH檢索,醫(yī)學(xué)主題詞表數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)利用主題詞進行檢索方法:1、點擊主頁右下角的MeSHDatabase進入主題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞；3、點擊該主題詞進一步顯示該主題詞的定義、樹狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點擊sendto按鈕，進入檢索表達式瀏覽窗口；5、點擊SearchPubMed將顯示檢索結(jié)果。,.,48,主題詞MeSH檢索,主題詞數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角,主題詞數(shù)據(jù)庫,.,49,主題詞MeSH檢索,輸入普通詞查找對應(yīng)主題詞,MeSH,主題詞檢索可以指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻,.,50,主題詞MeSH檢索,一般一個主題詞還要配合一個副主題詞進行組合檢索,選擇副主題詞,.,51,SearchBoxwithAND,主題詞MeSH檢索,點Sentto將檢索詞添加到檢索表達式瀏覽窗口,.,52,主題詞MeSH檢索,SearchPubMed,主題詞檢索可以達到比較滿意的查全率和查準(zhǔn)率,.,53,主題詞MeSH檢索,主題詞檢索是在有主題標(biāo)引的Medline數(shù)據(jù)庫中檢索,主題詞檢索結(jié)果,.,54,主題詞MeSH檢索,普通詞不是規(guī)范化的主題詞檢索結(jié)果相關(guān)度低,普通詞檢索結(jié)果,.,55,臨床查詢檢索,“Clinicalqueries”是專門為臨床醫(yī)生研究設(shè)計的內(nèi)置的臨床方法學(xué)“過濾器”（ClinicalMethodologyFilters），這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學(xué)和生物統(tǒng)計學(xué)研究人員HaynesRB等人在1994年提出來的，并進行了查全率和查準(zhǔn)率分析。用戶通過這一臨床方法學(xué)檢索過濾器，不需掌握復(fù)雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻。,.,56,臨床查詢檢索,使用方法:1、點擊主頁左側(cè)導(dǎo)航欄的ClinicalQueries進入臨床查詢頁面；2、在檢索框中輸入檢索詞，并選擇副主題詞組配，指定檢索結(jié)果是查全(sensitive)，還是查準(zhǔn)(specific)；3、點擊GO按鈕執(zhí)行檢索。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的研究文獻”,.,57,臨床查詢檢索,臨床查詢在PubMed首頁導(dǎo)航欄的中間部分,臨床查詢,.,58,臨床查詢檢索,臨床查詢主要用于檢索臨床方面的研究文獻,臨床查詢檢索,.,59,臨床查詢檢索,臨床查詢主要包括某種疾病的治療，診斷病因和預(yù)后四個方面,檢索結(jié)果,.,60,PubMed全文獲取,通過PubMed檢索出來的文獻，部分我們通過瀏覽摘要即可，部分我們還需要查看全文，以作進一步的研究，那么，我們?nèi)绾潍@取全文呢？一：免費的全文,.,61,PubMed全文獲取,PubMed收錄的文獻大約有5%是免費的可以直接打開全文,免費全文可直接打開,.,62,PubMed全文獲取,打開PDF全文,免費的全文并不代表學(xué)術(shù)價值低，大部分的生命科學(xué)的全文都是免費的,.,63,PubMed全文獲取,二：學(xué)校已訂購的全文如果我們所需要的文獻，學(xué)校已訂購了該文獻所在的全文型數(shù)據(jù)庫，我們也可以直接打開或到相應(yīng)的全文數(shù)據(jù)庫中查找。,.,64,國內(nèi)出版的期刊，學(xué)校一般都有訂購，請查找清華同方或維普，萬方,學(xué)校已訂購,PubMed全文獲取,.,65,PubMed全文獲取,SpringerLink和EBSCO等外文全文庫，一般學(xué)校也有