微生物分類(lèi)知識(shí)

微生物分類(lèi)知識(shí)微生物分類(lèi)知識(shí)微生物分類(lèi)知識(shí)V:1.0精細(xì)整理，僅供參考微生物分類(lèi)知識(shí)日期：20xx年X月微生物的概念及其在生物分類(lèi)中的地位錄入時(shí)間:2011-4-1511:11:57來(lái)源：中國(guó)食品商務(wù)網(wǎng)

1.1微生物的概念

微生物（Microorganism,microbe）一詞并非生物分類(lèi)學(xué)上的專(zhuān)門(mén)名詞，而是指大量的、極其多樣的、不借助顯微鏡看不見(jiàn)的微小生物類(lèi)群的總稱(chēng)。因此，微生物通常包括病毒、細(xì)菌、真菌、原生動(dòng)物和某些藻類(lèi)，它們的大小和特征見(jiàn)表1-1。表1-1.微生物形態(tài)、大小和細(xì)胞類(lèi)型微生物

大小近似值

細(xì)胞特征病毒

0.01～0.25μm

非細(xì)胞的細(xì)菌

0.1～10μm

原核生物真菌

2μm～1m

真核生物原生動(dòng)物

2～1000μm

真核生物藻類(lèi)

1μm～幾米

真核生物

但是有些例外。如許多真菌子實(shí)體、蘑菇等常肉眼可見(jiàn)；相同的，某些藻類(lèi)能生長(zhǎng)幾米長(zhǎng)。一般來(lái)說(shuō)，微生物可以認(rèn)為是相當(dāng)簡(jiǎn)單的生物，大多數(shù)的細(xì)菌、原生動(dòng)物、某些藻類(lèi)和真菌是單細(xì)胞的微生物，即使為多細(xì)胞的微生物，也沒(méi)有許多的細(xì)胞類(lèi)型。病毒甚至沒(méi)有細(xì)胞，只有蛋白質(zhì)外殼包圍著的遺傳物質(zhì)，且不能獨(dú)立生活。1.2微生物在生物分類(lèi)中的地位

在生物發(fā)展的歷史上，曾把所有的生物分為動(dòng)物界和植物界兩大類(lèi)。而微生物，不僅形體微小、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單，而且它們中間有些類(lèi)型像動(dòng)物，有些類(lèi)型像植物，還有些類(lèi)型既有動(dòng)物的某些特征，又具有植物的某些特征，因而歸于動(dòng)物或植物都不合適。于是，1866年?？藸枺℉aeckel）提出區(qū)別動(dòng)物界與植物界的第三界——原生生物界。它包括藻類(lèi)、原生動(dòng)物、真菌和細(xì)菌。

隨著科學(xué)的發(fā)展，新技術(shù)和研究方法的應(yīng)用，尤其是電子顯微鏡和超顯微結(jié)構(gòu)研究技術(shù)的應(yīng)用，發(fā)現(xiàn)了生物的細(xì)胞核有兩種類(lèi)型，一種是沒(méi)有真正的核結(jié)構(gòu)，稱(chēng)為原核，其細(xì)胞不具核膜，只有一團(tuán)裸露的核物質(zhì)；另一種是由核膜、核仁及染色體組成的真正的核結(jié)構(gòu)稱(chēng)為真核。動(dòng)物界、植物界及原生生物界中的大部分藻類(lèi)、原生動(dòng)物和真菌是真核生物，而細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌則是原核生物。真核生物和原核生物不僅細(xì)胞核的結(jié)構(gòu)不同，而且其性狀也有差別，真核生物和原核生物性狀的比較內(nèi)容將在第二章詳細(xì)介紹。

根據(jù)核結(jié)構(gòu)的不同，1969年魏塔科（Whittaker）提出五界系統(tǒng)，即動(dòng)物界、植物界、原生生物界、真菌界和原核生物界。五界系統(tǒng)的生物都有細(xì)胞結(jié)構(gòu)。病毒作為一界被提出的較晚，主要原因是①病毒和類(lèi)病毒是生物還是非生物，是原始類(lèi)型還是次生類(lèi)型是長(zhǎng)期爭(zhēng)論未決的問(wèn)題；②病毒不是用雙命法，分類(lèi)不用階元系統(tǒng)。但經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期研究發(fā)現(xiàn)，病毒和細(xì)胞型生物是有共同特性：①遺傳物質(zhì)是DNA（部分病毒是RNA）；②使用共同的遺傳密碼。在此基礎(chǔ)上，我國(guó)學(xué)者于1979年提出將無(wú)細(xì)胞結(jié)構(gòu)病毒立為病毒界，從而建立了六界系統(tǒng)。細(xì)胞型生物動(dòng)物界（Animalia）植物界（Plantae）原生生物界（Protista）：原生動(dòng)物、大部分藻類(lèi)及粘菌真菌界（Fungi）：酵母、霉菌原核生物界（Procaryotae）：細(xì)菌、放線(xiàn)菌、藍(lán)細(xì)菌等非細(xì)胞型生物：病毒界（Vira）

微生物分類(lèi)綱要

錄入時(shí)間:2012-8-148:38:03來(lái)源：原創(chuàng)

原核分類(lèi)系統(tǒng)綱要

原核界特點(diǎn)：?jiǎn)渭?xì)胞及集合/基因組無(wú)膜包裹/二等分裂增殖無(wú)減數(shù)分離/無(wú)膜隔細(xì)胞器/無(wú)細(xì)胞質(zhì)流現(xiàn)象/為70S核糖體/壁含肽聚糖等

真核分類(lèi)系統(tǒng)綱要真菌界特點(diǎn)為分解吸收式營(yíng)養(yǎng)/具獨(dú)特發(fā)達(dá)菌絲體和子實(shí)體/壁含幾丁質(zhì)成分/胞質(zhì)無(wú)葉綠體線(xiàn)粒簡(jiǎn)/粗內(nèi)質(zhì)網(wǎng)松散/組織化程度低/核分裂方式簡(jiǎn)一、原核微生物伯杰氏分類(lèi)系統(tǒng)：《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》、《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》古生菌域中三界與代表屬

古生菌域中三界為：古古生菌界、泉古生菌界、廣古生菌界微生物的分類(lèi)系統(tǒng)錄入時(shí)間:2006-10-1914:57:39來(lái)源：其它

微生物的分類(lèi)系統(tǒng)

這里僅簡(jiǎn)述原核微生物和真核微生物的分綱體系。

1

原核生物界（Procaryotae）

（1）

光能營(yíng)養(yǎng)原核生物門(mén)

Ⅰ

藍(lán)綠光合細(xì)菌綱（藍(lán)細(xì)菌類(lèi)）

Ⅱ

紅色光合細(xì)菌綱

Ⅲ

綠色光合細(xì)菌綱

（2）化能營(yíng)養(yǎng)原核生物門(mén)

Ⅰ

細(xì)菌綱

Ⅱ

立克次氏體綱

Ⅲ

柔膜體綱

Ⅳ

古細(xì)菌綱

2

真核微生物（Eucaryotic

microbes）

真核策生物主要包括各類(lèi)真菌，還有粘菌等。

真菌劃分各能分類(lèi)單位的基本原則是以形態(tài)特征為主，生理生化、細(xì)胞化學(xué)和生態(tài)等特征為輔。絲狀真菌主要根據(jù)其孢子產(chǎn)生的方法和孢子本身的特征，以及培養(yǎng)特征來(lái)劃分各級(jí)的分類(lèi)單位。一些病原真菌的鑒定，寄生和癥狀也可作為參考依據(jù)。真菌可分以下四綱：

Ⅰ

藻狀菌綱菌絲體無(wú)分隔，含多個(gè)核。有性繁殖形成卵孢子或接合孢子。

Ⅱ

子囊菌綱菌絲體有分隔，有性階段形成子囊孢子。

Ⅲ

擔(dān)子菌綱菌絲體有分隔，有性階段形成擔(dān)孢子。

Ⅳ

半知菌綱包括一切只發(fā)現(xiàn)無(wú)性世代未發(fā)現(xiàn)有性階段的真菌。

粘菌也可分為四綱，即

Ⅰ

網(wǎng)粘菌綱自細(xì)胞兩端各自伸出長(zhǎng)的粘絲并接連形成粘質(zhì)的網(wǎng)絡(luò)——假原質(zhì)團(tuán)。

Ⅱ

集胞粘菌綱分泌集胞粘菌素，形成假原質(zhì)團(tuán)。

Ⅲ

粘菌綱形成原質(zhì)團(tuán)，腐生性自由生活。

Ⅳ

根腫病菌綱形成原質(zhì)團(tuán)，專(zhuān)性寄生。亦有將之歸于真菌類(lèi)。微生物的分類(lèi)依據(jù)錄入時(shí)間:2006-10-1914:55:17來(lái)源：其它

微生物的分類(lèi)依據(jù)

1.

形態(tài)特征

（１）個(gè)體形態(tài)鏡檢細(xì)胞形狀、大小、排列，革蘭氏染色反應(yīng)，運(yùn)動(dòng)性，鞭毛位置、數(shù)目，芽孢有無(wú)、形狀和部位，莢膜，細(xì)胞內(nèi)含物；放線(xiàn)菌和真菌的菌絲結(jié)構(gòu)，孢子絲、孢子囊或孢子穗的形狀和結(jié)構(gòu)，孢子的形狀、大小、顏色及表面特征等。

（２）培養(yǎng)特征

１）在固體培養(yǎng)基平板上的菌落（colony）和斜面上的菌苔（lawn）性狀（形狀、光澤、透明度、顏色、質(zhì)地等）；

２）在半固體培養(yǎng)基中穿刺接種培養(yǎng)的生長(zhǎng)情況；

３）在液體培養(yǎng)基中混濁程度，液面有無(wú)菌膜、菌環(huán)，管底有無(wú)絮狀沉淀，培養(yǎng)液顏色

等。

2.生理生化特征

（１）能量代謝利用光能還是化學(xué)能；

（２）對(duì)Ｏ2的要求專(zhuān)性好氧、微需氧、兼性厭氧及專(zhuān)性厭氧等；

（２）營(yíng)養(yǎng)和代謝特性所需碳源、氮源的種類(lèi)，有無(wú)特殊營(yíng)養(yǎng)需要，存在的酶的種類(lèi)等。

3.生態(tài)習(xí)性

生長(zhǎng)溫度，酸堿度，嗜鹽性，致病性，寄生、共生關(guān)系等。

4.血清學(xué)反應(yīng)

用已知菌種、型或菌株制成抗血清，然后根據(jù)它們與待鑒定微生物是否發(fā)生特異性的血清學(xué)反應(yīng)，來(lái)確定未知菌種、型或菌株。

5

噬菌反應(yīng)

菌體的寄生有專(zhuān)一性，在有敏感菌的平板上產(chǎn)生噬菌斑，斑的形狀和大小可作為鑒定的依據(jù)；在液體培養(yǎng)中，噬菌體的侵染液由混濁變?yōu)槌吻?。噬菌體寄生的專(zhuān)業(yè)性有差別，寄生范圍廣的謂多價(jià)噬菌體，能侵染同一屬的多種細(xì)菌；單價(jià)噬菌體只侵染同一種的細(xì)菌；極端專(zhuān)業(yè)化的噬菌體甚至只對(duì)同一種菌的某一菌株有侵染力，故可尋找適當(dāng)專(zhuān)化的噬菌體作為鑒定各種細(xì)菌的生物試劑。

6

細(xì)胞壁成分

革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌的細(xì)胞壁含肽聚糖多，脂類(lèi)少。革蘭陰性細(xì)菌與之相反。鏈霉菌屬（Streptomyces）的細(xì)胞壁含丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和２，６-氨基庚二酸，而含有阿拉伯糖是諾卡氏菌屬（Nocardia）的特征。霉菌細(xì)胞壁則主要含幾丁質(zhì)。

7

紅外吸收光譜

利用紅外吸收譜技術(shù)測(cè)定微生物細(xì)胞的化學(xué)成分，了解微生物的化學(xué)性質(zhì)，作為分類(lèi)依據(jù)之一。

8

ＧＣ含量

生物遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)是核酸，核酸組成上的異同反映生物之間的親緣關(guān)系。就一種生物的ＤＮＡ來(lái)說(shuō)，它的堿基排列順序是固定的。測(cè)定四種堿基中鳥(niǎo)嘌呤（Ｇ）和胞密啶（Ｃ）所占的摩爾百分比，就可了解各種微生物ＤＮＡ分子不同源性程度。親緣關(guān)系接近的微生物，它們的Ｇ＋Ｇ含量相同或近似的兩種微生物，不一定緊密相關(guān)，因?yàn)樗鼈兊模模危恋乃膫€(gè)堿基的排列順序不一定相同。

9

ＤＮＡ雜合率

要判斷微生物之間的親緣關(guān)系，須比較它們的ＤＮＡ的堿基順序，最常用的方法是ＤＮＡ雜合法。其基本原理是ＤＮＡ解鏈的可逆性和堿基配對(duì)的專(zhuān)一性。提?。模危敛⑹怪怄?，再使互補(bǔ)的堿基重新配對(duì)結(jié)合成雙鏈。根據(jù)能生成雙鏈的情況，可測(cè)知雜合率。雜合率越高，表示兩個(gè)ＤＮＡ之間堿基順序的相似越高，它們間的親緣關(guān)系也就越近。

10

核糖體核糖酸（rＲNA

）相關(guān)度

在ＤＮＡ相關(guān)度低的菌株之間，rRNA同源性能顯示它們的親緣關(guān)系。Rrna-DNA分子雜交試驗(yàn)可沒(méi)定Rrna的相關(guān)度，揭示Rrna

的同源性。

11

rRNA的堿基順序

ＲＮＡ的堿基順序由ＤＮＡ轉(zhuǎn)錄來(lái)的，故完全具有相對(duì)應(yīng)的關(guān)系。提取并分離細(xì)菌內(nèi)標(biāo)記的１６SrRNA,以核糖核酸消化，可獲得各種寡核苷酸，測(cè)定這些寡核苷酸上的堿基順序，可作為細(xì)菌分類(lèi)學(xué)的一種標(biāo)記。

12

核糖體蛋白的組成分析

分離被測(cè)細(xì)菌的３０Ｓ和５０Ｓ核糖體蛋白亞單位，比較其中所含核糖體蛋白的種類(lèi)及其含量，可將被鑒定的菌株分為若干類(lèi)群，并繪制系統(tǒng)發(fā)生圖。

13

其它

如脂類(lèi)分析、核磁共振（NMR）譜、細(xì)胞色素類(lèi)型以及輔酶Ｑ的種類(lèi)（所含異間二烯側(cè)鏈的長(zhǎng)度）等。微生物的分類(lèi)單位與命名錄入時(shí)間:2006-10-1914:48:57來(lái)源：其它生物最基本的分類(lèi)單位是種(species)、其上是屬（genns）、科（family）、目（order）、綱（class）和門(mén)（phyllum）等。門(mén)、綱、目、科、屬名的字首字母要大寫(xiě)，除屬名外不印成斜體字。屬、種名印刷用斜體字下劃線(xiàn)。如釀酒酵母在分類(lèi)系統(tǒng)中的歸屬情況為

門(mén)：真菌門(mén)

Eumycophyta

綱：子囊菌綱

Ascomyeetes

亞綱：原子囊菌亞綱

Protoascomycetes

目：內(nèi)孢霉目Endomyctales

科：內(nèi)孢霉科Endomycetaceae

亞科：酵母亞科Sacchromycetoideae

屬：酵母屬Sacchromyces

種：釀酒酵母S.cerevisiae

Hansen

微生物的命名，與其他生物一樣，采用國(guó)際上通用的雙名法，學(xué)名通常由一個(gè)屬名加一個(gè)種的加詞構(gòu)成。出現(xiàn)在分類(lèi)學(xué)文獻(xiàn)中的學(xué)名，往往還加上首次定名人（外加括號(hào)）、現(xiàn)名定人和現(xiàn)名定名年份，但在一般使用時(shí)，這幾個(gè)部分總是省略的。

例如，由Ehrenberg于1838年定名為Vibrio

subtilis（枯草弧菌）的細(xì)菌，到1872年，Cohn發(fā)現(xiàn)弧狀不是該菌的特征，它的特征是桿狀具芽孢，故將它轉(zhuǎn)到芽孢桿菌屬，稱(chēng)為枯草芽孢桿菌（簡(jiǎn)稱(chēng)枯草桿菌），其學(xué)名為Bacillus

subtilis(Ehrenberg)Cohn1872。再如，可使許多科的植物生腫瘤的土壤桿菌屬細(xì)菌稱(chēng)為根癌土壤菌，學(xué)名為Agrobacterium

tumefaciens(Smith&Townsend)Conn1972;寄居于溫血?jiǎng)游锬c道下部的埃希氏菌屬細(xì)菌稱(chēng)為大腸埃希氏菌（簡(jiǎn)稱(chēng)大腸桿菌），其學(xué)名為Excherichia

coli(Migula)

Castellani&Chalmers1919；葡萄球菌屬呈金黃色葡萄球菌，學(xué)名為Staphylococcus

aureus

Rosenbach1884；呈銅綠色的假單胞菌（即綠膿桿菌）學(xué)名為

Pseusomonas

aeruginosa(Schroeter)Migula1920。

有時(shí)，從自然界分離到的某一微生物純種，與典型的特征不完全符合，而不相符的這一特性又是穩(wěn)定的，則將這種微生物稱(chēng)為典型種的變種（variety，簡(jiǎn)稱(chēng)var）。在實(shí)驗(yàn)室里獲得的變異型則稱(chēng)為亞種(subspecies，簡(jiǎn)稱(chēng)subsp)。

變種或亞種的學(xué)名按“三名法”構(gòu)成。

例如，有一種芽孢桿菌，能產(chǎn)生黑色素，其余特征與典型的枯草桿菌完全符合，該菌學(xué)名為Bacillus

substilis

var.niger（枯草芽孢桿菌黑色變種）。

同種不同來(lái)源的微生物純培養(yǎng)，稱(chēng)為菌株（strain）。菌株的名稱(chēng)都放在學(xué)名（即屬名和種的加詞）的后面，可用字母、符號(hào)、編號(hào)等自行決定。例如Ｂ.subtilis

AS1.398和B.subtilisBF7.658是枯草桿菌的兩個(gè)菌株，前者可生產(chǎn)蛋白酶，后者生產(chǎn)α－淀粉酶。有害微生物及病毒分類(lèi)

錄入時(shí)間:2011-11-189:25:28來(lái)源：互聯(lián)網(wǎng)1高度危害性鼠疫耶爾森氏菌、霍亂弧菌(包括EL-tor弧菌)、天花病毒、黃熱病毒(黑毒株)、新疆出血熱(克里米亞剛果出血熱)病毒、東、西方馬腦炎病毒、委內(nèi)瑞接馬腦炎病毒、拉沙熱(Lassa)病毒、馬堡(Marburg)病毒、埃波拉(Ebola)病毒、猴皰疹病毒(猴B病毒)；粗球孢子菌、莢膜組織胞漿菌、杜波氏組織胞漿菌。2中度危害性土拉弗郎西絲氏菌、布氏菌、炭疽芽胞菌、肉毒梭菌、鼻疽假單胞菌、類(lèi)鼻疽假單胞菌、麻風(fēng)分枝桿菌、結(jié)核分枝桿菌?？袢?/p>