出生缺陷家系對照病例遺傳資源采集規(guī)范

1、 出生缺陷家系對照病例遺傳資源采集規(guī)范完成人： 鄧 瑩朱 軍完成單位： 中國出生缺陷監(jiān)測中心版 本 號： 2008-01完成時(shí)間：2008年10月出生缺陷家系對照病例遺傳資源采集規(guī)范第一章 總則1制定的目的和原則 目的: 出生缺陷家系對照病例遺傳資源的采集具有重要意義和價(jià)值，制定出生缺陷家系的對照選取原則，規(guī)范采集對象和采集程序，規(guī)范對照病例的遺傳資源信息，確保采集的對照病例遺傳資源有正確的臨床信息，從而為出生缺陷的病因和機(jī)制研究提供準(zhǔn)確、客觀的對照資料，同時(shí)促進(jìn)實(shí)現(xiàn)對照病例遺傳資源的共享。 對照選取的原則：嚴(yán)格意義上的對照是指不患有任何出生缺陷的正常個(gè)體，其直系親屬中也無出生缺陷的家系。這類

2、家系對任何出生缺陷家系而言，都是最為理想的對照。如實(shí)際工作中無法滿足此條件，則只要不患有特定的出生缺陷的個(gè)體及其親屬組成的家系均可作為對照家系。遺傳資源采集原則: 充分考慮遺傳資源提供者的權(quán)利,采取自愿合作的原則,采集過程中尊重提供者的意愿,保證相關(guān)信息的安全.2范圍的界定 本規(guī)范適用于全國各地區(qū)收集整理保存人類出生缺陷家系對照病例遺傳資源的研究機(jī)構(gòu)、大專院校、醫(yī)院、企業(yè)等。3規(guī)范性引用文件下列文件中的條款通過本規(guī)范的引用而成為本規(guī)范的條款。凡是注日期的引用文件，其隨后所有的修改單(不包括勘誤的內(nèi)容)或修訂版均不適用于本規(guī)范。凡是不注日期的引用文件，其最新版本適用于本規(guī)范。ICD10 疾病和有

3、關(guān)健康問題的國際統(tǒng)計(jì)分類GB/T 2261.12003 人的性別代碼GB/T 330491 中國各民族名稱羅馬字母拼寫法和代碼GB/T2260 中華人民共和國行政區(qū)劃代碼GB/T 12404 單位隸屬關(guān)系代碼GB/T 2261.32003 健康狀況代碼GB/T 7408 數(shù)據(jù)元交換格式 信息交換日期和時(shí)間表示法（GB/T 7408-1994,eqv ISO 8601:1998）SMITHS Recognizable Patterns of Human Malformation 6e,Kenneth Lyons Jones, MD ISBN: 1-7216-0615-6SMITH 人類先天性畸形

4、圖譜分類、判定標(biāo)準(zhǔn)與遺傳咨詢。傅松濱主譯，北京：人民衛(wèi)生出版社，2007.5人類遺傳資源管理暫行辦法 自然科技資源共性描述規(guī)范4定義及注意事項(xiàng)4.1定義出生缺陷(birth defects)，又稱先天異常(congenital anomalies)，是指胚胎或胎兒在發(fā)育過程中所發(fā)生的結(jié)構(gòu)或功能異常。出生缺陷家系可分為核心家系、多代家系等.核心家系：指包括出生缺陷患者及其父母所組成的家系。多代家系：指包括出生缺陷患者及其三代以上具有血緣關(guān)系的直系親屬所組成的家系。出生缺陷家系對照病例可分為正常對照家系（核心家系、多代家系）、正常對照個(gè)體.正常對照家系指不患有已確定的出生缺陷類型的個(gè)體及其父母.親

5、屬組成的家系。正常對照個(gè)體.指不患有已確定的出生缺陷類型的個(gè)體。4.2注意事項(xiàng)1出生缺陷類型的診斷必須準(zhǔn)確,這是確定對照的前提。盡可能利用與病例相同的診斷方法，并確定所選對照個(gè)體不具有所要研究的疾病。即一方面要求對照個(gè)體未患所研究疾?。涣硪环矫?，要求病例組和對照組的診斷手段最好一致。因?yàn)橥患膊∮貌煌脑\斷方法進(jìn)行診斷時(shí)，可能有不同的敏感性和特異性；如果用于確定病例和對照的診斷方法不同，就有可能在對照中混入輕型病例。2對照與病例要有可比性。為了保證對照與病例的可比性，許多病例對照研究加上了相應(yīng)的配對條件。在注重這種兩組可比性的時(shí)候，也不應(yīng)過份追求嚴(yán)格配對，如果要求病例和對照除研究因素以外，其他

6、因素都相同的話，就可能導(dǎo)致過度匹配。3在選擇醫(yī)院對照時(shí)，應(yīng)將與研究因素有關(guān)的疾病從對照中排除。如果不排除這類疾病，可能就會出現(xiàn)研究因素的危險(xiǎn)性做出過高或過低的估計(jì)。4. 遺傳資源采集過程中,必須得到提供者的同意,不對提供者造成不必要的損傷.5. 遺傳資源的保存須根據(jù)其類型的不同采用合適的方式,以將損失減少到最低為原則.6. 應(yīng)當(dāng)有專人對遺傳資源進(jìn)行管理,保證遺傳資源的安全可用.7質(zhì)量控制應(yīng)當(dāng)貫穿于對照病例收集的整個(gè)過程，因?yàn)樵谑占倪^程中的各個(gè)環(huán)節(jié)產(chǎn)生的誤差或偏倚均可影響后續(xù)的工作，導(dǎo)致最終研究結(jié)果的不精確和不真實(shí)。第二章 對照病例遺傳資源采集程序1. 確定出生缺陷類型及對照 可根據(jù)各地的具體

7、情況，選取當(dāng)?shù)匕l(fā)病率較高、嚴(yán)重威脅生命的出生缺陷類型，根據(jù)其特征，確定診斷標(biāo)準(zhǔn)、制定選擇對照的納入和排除標(biāo)準(zhǔn)。2. 對照來源及類型由于出生缺陷家系的特殊性，在選擇對照病例時(shí)需要考慮到與一般意義上的對照來源的不同之處。應(yīng)當(dāng)明確是來自社區(qū)還是醫(yī)院，此外還可考慮病例的同胞，如雙生子，養(yǎng)子，半同胞等。 人群或社區(qū)來源：選擇與出生缺陷家系在同一地區(qū)，生活習(xí)慣、經(jīng)濟(jì)條件、社會地位等方面相似的家系。 醫(yī)院或診所來源：選擇與出生缺陷患兒同一家醫(yī)院或診所出生或就診的,不患任何畸形的孩子. 患者同胞: 如雙生子中的健康者,或患者的 核心家系: 正常個(gè)體及其父母組成的家系. 多代家系: 家系成員均不患任何畸形,至少

8、三代以上的家系. 正常個(gè)體: 不患有任何出生缺陷的健康個(gè)體,與出生缺陷患者有無血緣關(guān)系均可.3采集遺傳資源類型及相關(guān)資料 確定符合條件的對照家系后, 及時(shí)向其家系成員介紹本項(xiàng)目的目的,并宣讀知情同意書,以征得各成員的同意. 遺傳資源類型 收集對照家系各成員的靜脈血; 對新生兒及其父母均收集紙血片.其他類型可參考中的人類遺傳資源共性描述規(guī)范. 采集標(biāo)本的原則 首先盡量采集靜脈血(1-3ml), 如果有困難,則可選擇采集靜脈血制成血紙片。采血后盡早處理如提取其中的DNA，血紙片標(biāo)本采集后需在清潔的空氣中晾干再保存。 相關(guān)資料的收集 研究對象簽署知情同意書后,對家系成員調(diào)查一般情況及其它暴露歷史.調(diào)

9、查內(nèi)容包括: 一般情況(婦女基本信息, 家族史, 既往病史, 婚育史, 家庭近親結(jié)婚史, 生育畸形史等), 懷孕前后患病情況, 接觸致畸因素情況, 孕期生活方式, 居住條件, 孕期葉酸服用等情況, 詳細(xì)的調(diào)查內(nèi)容可根據(jù)不同情況具體規(guī)定. 還應(yīng)附有體格檢查表。4遺傳資源的保存及管理 遺傳資源由于來源珍貴，其保存及管理就尤為重要。應(yīng)當(dāng)有專人專職負(fù)責(zé)遺傳資源的保存及管理。遺傳資源的保存應(yīng)該有專用的空間及相應(yīng)的設(shè)備。將遺傳資源的信息數(shù)字化，有利于遺傳資源的共享和交流。 相關(guān)資料的整理及管理 包括知情同意書，調(diào)查問卷，體格檢查表，應(yīng)當(dāng)詳細(xì)檢查這些資料的填寫情況，是否填寫的完整，真實(shí)。第三章 描述規(guī)范1平

10、臺資源號國家自然科技資源E平臺統(tǒng)一的資源編號，由18位數(shù)字和字母組成，可分為兩部分。第一部分由9位字母和數(shù)字組成，為E平臺登記注冊的單位編碼，詳見E平臺附表，如1751C0001代表四川大學(xué)中國出生缺陷監(jiān)測中心；第二部分由9位數(shù)字組成，為該樣本的資源編號。詳見重要疾病遺傳資源數(shù)據(jù)規(guī)范中“平臺資源編號”指標(biāo)項(xiàng)。2 出生缺陷家系對照病例編號由11位字母和數(shù)字組成，出生缺陷家系對照病例標(biāo)識符（JXDZ）分項(xiàng)目承擔(dān)者編碼（3位）家系流水號（4位）。如，QXDZ5150001表示分項(xiàng)目承擔(dān)者編碼為515的第一個(gè)對照家系。3出生缺陷家系對照病例個(gè)體編號由13位字母和數(shù)字組成，出生缺陷家系對照病例編號（11

11、位）個(gè)體流水號（2位）。如，QXDZ515000101表示缺陷家系對照病例編號為QXDZ5150001的第一個(gè)個(gè)體樣本。4 對照病例家系名稱字符型，不超過50個(gè)中文字符。參照已確定的出生缺陷家系，注明是該家系的對照家系。如已確定的出生缺陷家系為多指家系，則在相應(yīng)的對照家系中注明為多指家系對照5 出生缺陷家系對照病例類型按照以下代碼填寫。家系類型代碼多代家系Family核心家系Core正常個(gè)體CTRL6 對照病例的診斷資料 字符型，不超過100個(gè)中文字符的描述內(nèi)容。目的是說明該對照病例無確定的出生缺陷。如對照病例照片、體檢報(bào)告、染色體檢查報(bào)告等診斷資料。7 基本信息7.1.性別根據(jù)國家標(biāo)準(zhǔn)人的性

12、別代碼編寫。代碼性別0未知性別1男性2女性3兩性9未說明的性別7.2 民族2位阿拉伯?dāng)?shù)字，人體生物標(biāo)本涉及民族分類均采用經(jīng)國家認(rèn)定的民族名稱，編碼參考國家標(biāo)準(zhǔn)GB/T 3304-1991中華人民共和國各民族名稱的羅馬字母拼寫法和代碼。7.3 籍貫2位阿拉伯?dāng)?shù)字，編碼按照國家標(biāo)準(zhǔn)全國縣及縣以上行政區(qū)劃代碼表國家標(biāo)準(zhǔn)GB/T 2260-1999的前兩位編寫，代碼對應(yīng)到省市自治區(qū)。同時(shí)補(bǔ)充“99”作為資料不詳代碼。7.4出生日期日期型，按照年月日順序編寫，格式為YYYY-MM-DD,沒有相關(guān)記錄者，記為99999999。7.5 家庭住址及聯(lián)系方式字符型。7.6樣本采集日期 按照公歷填寫，填寫格式按照GB/T 7408數(shù)據(jù)元交換格式信息交換日期和時(shí)間表示法（GB/T 7408-1994, eqv ISO 8601: 1998）的要求。格式為YYYYMMDD.7.7樣本保存期限 2位阿拉伯?dāng)?shù)字，單位位月，按照樣本實(shí)際可保存的時(shí)間進(jìn)行填寫，其中99為永久保存。7.8樣本保存條件 按照樣本保存溫度進(jìn)行分類編碼，1位阿拉伯?dāng)?shù)字 123459常溫冷藏（2-8）低溫冷凍（-20到-40）超低溫冷凍（-70到-150）液氮其他8收藏單位信息8.1 保存地 字符型，填寫保存地點(diǎn)的名稱。8.2實(shí)物狀態(tài)1位數(shù)字，表示該個(gè)體遺傳資源實(shí)物的狀態(tài)。“1”表示可用，“2”表示不可用，“3”表示無實(shí)物。