人類單基因病和染色體病遺傳資源

1、人類單基因病和染色體病遺傳資源標(biāo)準(zhǔn)化整理、整合的技術(shù)規(guī)程中國(guó)人類遺傳資源平臺(tái)項(xiàng)目組 2007年12月 前 言 人類單基因病和染色體病遺傳資源是我國(guó)重大疾病遺傳資源的重要組成部分。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)已經(jīng)進(jìn)入生物醫(yī)學(xué)時(shí)代，多種疾病的發(fā)生都與遺傳因素相關(guān)。單基因病和染色體病的研究已成為人類疾病致病機(jī)制研究的重要切入點(diǎn)之一。規(guī)范的人類單基因病、染色體病遺傳資源庫(kù)將為我國(guó)人類重大疾病研究提供重要資源平臺(tái)。我國(guó)自2004年起，就開始陸續(xù)有多家單位參與人類遺傳資源平臺(tái)的建設(shè)，但迄今尚無一個(gè)統(tǒng)一的單基因病、染色體病的標(biāo)準(zhǔn)化的整理和整合的技術(shù)規(guī)范。根據(jù)目前的工作積累，我們參考國(guó)際相關(guān)做法，結(jié)合中國(guó)已經(jīng)制定的人類遺傳資源相

2、關(guān)技術(shù)規(guī)范及國(guó)內(nèi)外其他領(lǐng)域技術(shù)規(guī)范，制定本規(guī)程。該規(guī)程的制定為進(jìn)一步完善人類單基因病和染色體病遺傳資源庫(kù)，從技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)和安全標(biāo)準(zhǔn)方面提出了原則性要求。目 次前 言. . .II1.范圍. .12.規(guī)范性引用文件. .13.術(shù)語和定義. .14.單基因病和染色體病資源庫(kù)課題承擔(dān)單位的基本條件.25.組織管理. . . . . . . . . . . .35.1 管理. . . . . . . . . . . .35.2 一般管理. .36.人員資質(zhì)和培訓(xùn). .37.實(shí)驗(yàn)室環(huán)境. . . .48.設(shè)備. . . . . . . . . . . . .48.1 校準(zhǔn)、檢測(cè)和設(shè)備保養(yǎng). . . . .

3、. . . . .48.2 使用的授權(quán). . . . . . . . . . .48.3 監(jiān)控. .49.工作程序. . . . . . . . . . . .49.1 采樣前準(zhǔn)備. . . . . . . . . . .49.2 樣本采集. . . . . . . . . . .59.3 樣本標(biāo)識(shí). . . . . . . . . . . .59.4 DNA的提取. . . . . . . . . . .6.9.5 樣本保存和使用.610.計(jì)算機(jī)信息化管理. . . . .611 質(zhì)量核查及質(zhì)量評(píng)價(jià). 611.1 目的. . . . .611.2 職責(zé). . . .611.3 執(zhí)行. .61

4、1.4 規(guī)劃和文檔. . . .711.5 質(zhì)量控制系統(tǒng). . .712 實(shí)驗(yàn)室安全. . . .713 操作方法. . .713.1 政策和規(guī)范. . . . . .713.2 可用性. . . . .713.3 方法和程序文檔. .714 信息記錄系統(tǒng). . . . . . . . . . .714.1 樣品信息記錄. . . . . . .714.2 保護(hù). . . . . .714.3 保留. . . 815 人類單基因病和染色體病遺傳資源的保密要求. . .8參考文獻(xiàn). . .81 范圍 本規(guī)范規(guī)定了人類單基因病和染色體病遺傳資源標(biāo)準(zhǔn)化整理和整合的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)和管理規(guī)范。本規(guī)程內(nèi)容包括人

5、類單基因病、染色體病遺傳資源庫(kù)參與單位的基本條件、人員資質(zhì)及培訓(xùn)、建筑和設(shè)施、儀器設(shè)備、資源采集范圍和分類、采樣前準(zhǔn)備、血樣采集、標(biāo)本標(biāo)識(shí)、標(biāo)本保存和使用、計(jì)算機(jī)信息化管理、質(zhì)量管理體系等。2 規(guī)范性引用文件下列文件中的條款通過本規(guī)程的引用而成為本規(guī)程的條款。凡是注明日期的引用文件，其隨后所有的修改單（不包括勘誤的內(nèi)容）或修訂版均不適用于本規(guī)程；然而，鼓勵(lì)根據(jù)本規(guī)程達(dá)成協(xié)議的各方研究是否可使用這些文件的最新版本。凡是不注明日期的引用文件，其最新版本適用于本規(guī)程。GB/T 1.1-2000 標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)和編寫規(guī)則GB/T 2261.12261.7-2003 個(gè)人基本信息分類與代碼GB15980-1

6、995標(biāo)準(zhǔn)ICD-10 WHO國(guó)際疾病分類編碼ICD-10 中國(guó)修訂版IND 國(guó)際醫(yī)學(xué)科學(xué)組織理事會(huì)（CIOMS）遺傳資源的共享原則3.術(shù)語和定義 3.1 人類遺傳資源 human genetic resource 人類遺傳資源是指含有人體基因組、基因及其產(chǎn)物的器官、組織、細(xì)胞、血液、制備物、重組脫氧核糖核酸（DNA）構(gòu)建體等遺傳材料及相關(guān)的信息資料。3.2 單基因病 monogenic disease，single gene disease 指受一對(duì)主基因影響而發(fā)生的疾病，遺傳方式符合孟德爾定律，因此也稱孟德爾遺傳的疾病。3.3 染色體病 chromosomal disorder 3.3.1

7、 染色體病 指先天性染色體數(shù)目異常或結(jié)構(gòu)畸變而引起的疾病。染色體異常表現(xiàn)為具有多種畸形的綜合征，因此又稱染色體綜合征。 3.3.2 核型 一個(gè)體細(xì)胞中的全部染色體所構(gòu)成的圖像即稱核型（karyotype）。Denver體制確定的正常人核型的基本特點(diǎn)是識(shí)別人類各種染色體病的基礎(chǔ)。按照Denver體制，將待測(cè)細(xì)胞的染色體進(jìn)行分析和確定是否正常以及異常特點(diǎn)即稱核型分析（karyotype analysis）。3.4 知情同意 informed consent保證被收集者了解并理解研究的目的和內(nèi)容，并自愿同意參加實(shí)驗(yàn)的原則。知情同意具有國(guó)際性，是對(duì)所有進(jìn)行人體研究或人體取樣調(diào)查的研究人員的倫理要求。在

8、以人為研究/試驗(yàn)對(duì)象的科研領(lǐng)域，收集者必須獲得研究對(duì)象/參與者的知情同意，保護(hù)被收集者合法權(quán)益的同時(shí)保護(hù)收集者免予訴訟。3.5 知情同意書 informed consent form 是每位被收集者表示自愿參加某一項(xiàng)試驗(yàn)而簽署的文件。知情同意的具體體現(xiàn)實(shí)知情同意書的簽署。知情同意書由收集者和被收集者共同簽署，一式兩份。正本由收集者保存，被收集者保存副本。3.6 設(shè)備 equipment 非消耗性有形財(cái)產(chǎn)的某物品，其使用壽命超過一年，并且其單位數(shù)量的獲得成本等于或大于5000元人民幣或者該組織設(shè)定的資產(chǎn)估價(jià)金限額（滿足其一即可）。3.7 研究 research 旨在增進(jìn)對(duì)研究對(duì)象的知識(shí)或理解的系

9、統(tǒng)而廣泛的研究，特別針對(duì)新知識(shí)的應(yīng)用以滿足公認(rèn)的需要，或系統(tǒng)地應(yīng)用現(xiàn)有知識(shí)生產(chǎn)有用的材料、設(shè)備和方式或方法，包括設(shè)計(jì)、開發(fā)和原型改造、新工藝的研制生產(chǎn)。3.8 條形碼 是指由一組按一定編碼規(guī)則排列的條、空符號(hào)，用以表示一定的字符、數(shù)字及符號(hào)組成的信息。3.9 條形碼系統(tǒng) 是由條碼符號(hào)設(shè)計(jì)、制作及掃描閱讀組成的自動(dòng)識(shí)別系統(tǒng)，現(xiàn)已應(yīng)用在國(guó)防、公共安全、交通運(yùn)輸、醫(yī)療保健、工業(yè)、商業(yè)、金融、海關(guān)及政府管理等多個(gè)領(lǐng)域。4 單基因病和染色體病遺傳資源課題承擔(dān)單位的基本條件4.1 必須是專門從事人類單基因病和染色體病相關(guān)研究的單位4.2 必須是省級(jí)以上的計(jì)劃生育研究所或臨床3等甲級(jí)醫(yī)院的遺傳病研究中心4.

10、3 必須建立與其業(yè)務(wù)相關(guān)的組織結(jié)構(gòu)和工作流程4.4 具有符合儲(chǔ)寸1萬份單基因病血樣標(biāo)本、DNA樣本及染色體玻片標(biāo)本的高清潔度空間4.5 已經(jīng)收藏了大量樣本資源4.6 具有相關(guān)研究和計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)管理儀器設(shè)備4.7 具有可靠的單基因病和染色體病的標(biāo)本來源4.8 具有多渠道籌集資金和運(yùn)轉(zhuǎn)經(jīng)費(fèi)的能力4.9 必須經(jīng)過遺傳病研究相關(guān)倫理委員會(huì)討論通過5 組織管理5.1 管理國(guó)家對(duì)人類遺傳資源實(shí)行分級(jí)管理，統(tǒng)一審批制度。各種類型人類遺傳資源庫(kù)及其合作機(jī)構(gòu)在遵守中華人民共和國(guó)有關(guān)法律、法規(guī)及規(guī)章制度的前提下進(jìn)行機(jī)構(gòu)之間的合作。明確各自擁有的權(quán)力和義務(wù)，并履行其義務(wù)與職責(zé)。遺傳資源庫(kù)的管理包括以下方面：機(jī)構(gòu)或組織

11、遺傳資源庫(kù)建立、樣本保存及安全服務(wù)范圍5.2 一般管理根據(jù)職責(zé)權(quán)限及范圍，所有工作人員按要求履行各自的職責(zé)。按照試驗(yàn)室程序手冊(cè)執(zhí)行所有程序，不同資源庫(kù)的試驗(yàn)程序應(yīng)由各自特點(diǎn)。6 人員資質(zhì)和培訓(xùn)遺傳資源庫(kù)任職人員資格及培訓(xùn)主要包括以下幾個(gè)方面內(nèi)容：工作人員有多種層次，不論那種層次的工作人員，只有經(jīng)過嚴(yán)格的職業(yè)培訓(xùn)后，才允許上崗；工作人員要根據(jù)所服務(wù)的資源庫(kù)特點(diǎn)，經(jīng)過特殊的職業(yè)培訓(xùn)，并接受每年的繼續(xù)教育的培訓(xùn)。使用設(shè)備等的授權(quán)證明資料也要記錄在培訓(xùn)記錄中。新職員需經(jīng)過使用培訓(xùn)，或經(jīng)資深職員的指導(dǎo)后才可使用高壓滅菌器、凍干設(shè)備、低溫儲(chǔ)藏設(shè)備及生物安全柜等必須經(jīng)過專門培訓(xùn)才能使用的設(shè)備。7 實(shí)驗(yàn)室環(huán)境

12、 提供一個(gè)良好的環(huán)境是每個(gè)遺傳資源庫(kù)建立的前提條件，這個(gè)環(huán)境應(yīng)保證免除樣本的污染，并方便的進(jìn)行準(zhǔn)確的測(cè)量和記錄。安排專職的工作人員定期檢查實(shí)驗(yàn)室是否符合樣本保存的各項(xiàng)要求，主要參照實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求。8 設(shè)備8.1 校準(zhǔn)、檢測(cè)和設(shè)備保養(yǎng) 保存所有設(shè)備的詳細(xì)目錄及使用登記。在保養(yǎng)合同中記載所有設(shè)備的主要條款，并保留記錄。 為保證可重復(fù)性，所有測(cè)量器具和設(shè)備都要定期校準(zhǔn)。質(zhì)量管理機(jī)構(gòu)，負(fù)責(zé)建立和實(shí)施校準(zhǔn)項(xiàng)目（根據(jù)各自實(shí)驗(yàn)室程序手冊(cè)）。資源庫(kù)的所有設(shè)備的使用和維護(hù)，應(yīng)與制造廠商的指南/手冊(cè)中的說明相一致。操作和保養(yǎng)的指導(dǎo)說明一般要保存在設(shè)備的附近，以便查閱。測(cè)量裝置由有資格的服務(wù)機(jī)構(gòu)及校準(zhǔn)工程師

13、來校準(zhǔn)。8.2 使用的授權(quán) 所有的操作人員都要經(jīng)過全面的設(shè)備使用和培訓(xùn)，并保存在他們個(gè)人的培訓(xùn)記錄中。8.3 監(jiān)控 任何損壞的設(shè)備，或顯示令人懷疑的結(jié)果、有故障，或有缺陷不宜使用的設(shè)備，都要立即停止使用，并在該設(shè)備上迅速貼上標(biāo)簽或做上標(biāo)記，在修理好重新生效之后才能重新投入使用。9工作程序9.1 采樣前準(zhǔn)備臨床診斷和家系調(diào)查 對(duì)先證者進(jìn)行全面的臨床檢查，并根據(jù)檢查結(jié)果做出診斷。對(duì)先證者進(jìn)行至少三代以上的家族本病發(fā)病史調(diào)查，直到追溯到最早本病患者為止。對(duì)現(xiàn)存全部患者進(jìn)行臨床檢查和診斷，通過詢問盡可能全面了解已故患者的臨床特征，并繪制詳盡的家系系譜圖，判斷遺傳方式。 填寫健康狀況調(diào)查表 需要采樣的所

14、有家系成員填寫健康狀況調(diào)查表。逐項(xiàng)填寫，字跡清楚，調(diào)查表填寫內(nèi)容真實(shí)、準(zhǔn)確。9.1.3 簽署知情同意書 研究者仔細(xì)為患者及其家人對(duì)疾病的表現(xiàn)、遺傳方式、研究的目的、對(duì)患者及其家人可能從研究中獲得的權(quán)益進(jìn)行講解。參與者或參與者的合法監(jiān)護(hù)人（或代理者）在清醒、正常的精神狀態(tài)下，仔細(xì)閱讀知情同意書，同意后簽字或按手印。同時(shí)告知供體的隱私權(quán)將被嚴(yán)格保密，未經(jīng)同意不會(huì)泄露有關(guān)信息，并告知參與者樣本將儲(chǔ)備于國(guó)家人類重大疾病遺傳資源數(shù)據(jù)庫(kù)，可能被國(guó)內(nèi)非商業(yè)性研究使用。9.2 樣本采集 采血器械 采血所需醫(yī)療用品必須符合GB15980-1995標(biāo)準(zhǔn)產(chǎn)品的要求。 血樣采集量 每個(gè)個(gè)體一次采集量5-10ml,可根

15、據(jù)研究需要酌情增減。 采血程序 采血前，采樣人員登記收集管批號(hào)，在標(biāo)簽處填寫樣本編號(hào)，并與表格中填寫的被采集人信息進(jìn)行核對(duì)；無菌操作采集周靜脈外周血。 產(chǎn)前診斷樣本 樣本為孕9-11周絨毛或孕16-18周羊水細(xì)胞，由專門產(chǎn)科醫(yī)生抽取。羊水細(xì)胞DNA不用于數(shù)據(jù)庫(kù)收藏。 填寫樣本登記卡 根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)要求，詳細(xì)填寫標(biāo)本登記卡，并進(jìn)行電子信息錄入。9.3標(biāo)本標(biāo)示 采用條形碼技術(shù)對(duì)樣本進(jìn)行標(biāo)示 外周血樣本、 DNA樣本和染色體標(biāo)本都以條形碼進(jìn)行標(biāo)示，標(biāo)記號(hào)與標(biāo)本的電子檔案一致，點(diǎn)擊時(shí)，可獲悉樣本所有信息。 條形碼標(biāo)簽技術(shù)要求標(biāo)簽的底色應(yīng)為白色并全部與遺傳資源標(biāo)本存放管管壁牢固結(jié)合；標(biāo)簽信息應(yīng)采用實(shí)體黑色字

16、體，通過打印或印刷產(chǎn)生；標(biāo)簽材質(zhì)能防水、耐低溫、耐磨損。 貼簽 單基因病和染色體病遺傳資源的標(biāo)識(shí)是通過貼簽活動(dòng)實(shí)現(xiàn)的，貼簽活動(dòng)作為一項(xiàng)關(guān)鍵活動(dòng)，必須將發(fā)生錯(cuò)誤的潛在因素降低到最少。負(fù)責(zé)貼簽的人員應(yīng)經(jīng)過充分培訓(xùn)和評(píng)估。應(yīng)建立和執(zhí)行核對(duì)制度，并檢測(cè)一定百分比的遺傳資源存放管以保證貼簽過程準(zhǔn)確無誤。 留樣 所有標(biāo)本的標(biāo)簽都應(yīng)該存檔保留。 標(biāo)識(shí)管理建立單基因病和染色體病遺傳資源標(biāo)本標(biāo)識(shí)的管理程序，以確保每一份標(biāo)本均可通過條形碼追溯到被采集者基本信息資料、健康狀況、疾病信息、表型、基因型或核型、標(biāo)本存放地點(diǎn)、目前使用情況等信息。單基因病和染色體病遺傳資源標(biāo)本標(biāo)識(shí)管理的關(guān)鍵控制點(diǎn)包括標(biāo)簽的材質(zhì)、標(biāo)簽的內(nèi)容

17、、條形碼系統(tǒng)的應(yīng)用以及貼簽管理。9.4 DNA的提取 采用常規(guī)酚氯仿法或全血基因組DNA提取試劑盒抽取外周血或絨毛組織的基因組DNA。9.5 標(biāo)本保存和使用 外周血、絨毛及羊水細(xì)胞沉淀保存在-80冰箱，DNA樣本保存于-20冰箱。10 計(jì)算機(jī)信息化管理10.1 應(yīng)建立和使用單基因病和染色體病遺傳資源標(biāo)本庫(kù)計(jì)算機(jī)管理系統(tǒng)，對(duì)從標(biāo)本采集、標(biāo)本信息、入庫(kù)、使用情況和質(zhì)量管理全過程實(shí)行計(jì)算機(jī)管理。10.2 建立和實(shí)施計(jì)算機(jī)管理系統(tǒng)使用的風(fēng)險(xiǎn)分析、培訓(xùn)、確認(rèn)、使用以及使用后的評(píng)估程序。10.3 建立和實(shí)施標(biāo)本信息儲(chǔ)存、標(biāo)本保存、標(biāo)本檢測(cè)和計(jì)算機(jī)管理系統(tǒng)發(fā)生意外事件的應(yīng)急預(yù)案和恢復(fù)程序，確保標(biāo)本庫(kù)正常運(yùn)轉(zhuǎn)

18、。11質(zhì)量核查及質(zhì)量評(píng)價(jià)11.1 目的 人類單基因病和染色體病遺傳資源庫(kù)的管理者要定期核查，以保證資源庫(kù)建設(shè)政策和程序得以執(zhí)行。所有工作至少每年核查一次。另外每年都要有一次獨(dú)立的核查。質(zhì)量管理系統(tǒng)和實(shí)驗(yàn)室程序的年度審查也要進(jìn)行。11.2 職責(zé) 質(zhì)量負(fù)責(zé)機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)對(duì)實(shí)驗(yàn)室程序的效力進(jìn)行評(píng)述，并確保記錄評(píng)述及所有評(píng)價(jià)活動(dòng)得以貫徹執(zhí)行；另有一位獨(dú)立的工作人員進(jìn)行獨(dú)立的核查；并且驗(yàn)證核查過程中所要求的矯正活動(dòng)在規(guī)定的時(shí)間內(nèi)是否全部完成。在資源庫(kù)監(jiān)管部門的安排下，另一個(gè)相關(guān)資源庫(kù)的工作人員對(duì)本資源庫(kù)的質(zhì)量管理系統(tǒng)和實(shí)驗(yàn)室程序進(jìn)行年度核查。11.3 執(zhí)行 根據(jù)人類單基因病和染色體病保存樣本的特點(diǎn)，在本實(shí)驗(yàn)室程序手冊(cè)中對(duì)質(zhì)量核查和質(zhì)量系統(tǒng)評(píng)價(jià)工作的安排進(jìn)行詳細(xì)論述。11.4 規(guī)劃和文檔 由質(zhì)量負(fù)責(zé)機(jī)構(gòu)掌管所有的核查記錄、評(píng)價(jià)和執(zhí)行記錄。11.5 質(zhì)量控制系統(tǒng) 除了核查和評(píng)價(jià)以外，在各自實(shí)驗(yàn)室程序手冊(cè)中詳細(xì)論述的方法和程序質(zhì)量檢查也要貫徹執(zhí)行。12 實(shí)驗(yàn)室安全12.1 應(yīng)遵從實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求（G B19489-2004）和微生物和生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通用準(zhǔn)則（WS 233-2002）的要求。12.2 建立和實(shí)施實(shí)驗(yàn)室安全與衛(wèi)生管理程序，覆蓋從標(biāo)本采集到標(biāo)本貯存整個(gè)過程。12.3 限制非授權(quán)人員進(jìn)入遺傳資源標(biāo)本庫(kù)。13 操作方法13.1 政策和規(guī)范 單基