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1、晶體生長(zhǎng)和單晶質(zhì)量的評(píng)估這雖是進(jìn)行單晶結(jié)構(gòu)分析的予備階段。但卻決定著最后單晶結(jié)構(gòu)分析結(jié)果的好壞。因?yàn)檠苌鋽?shù)據(jù)一般都得由專門技術(shù)人員來收集。所以就大多數(shù)研究人員來說,要進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,獲得較好的結(jié)構(gòu)分析結(jié)果,自已能做的就是先獲得合格的單晶。顯然沒有高質(zhì)量的晶體就得不到高質(zhì)量的衍射數(shù)據(jù),而沒有高質(zhì)量的衍射數(shù)據(jù),許多分析都成問題。質(zhì)優(yōu)的單晶還可以大大節(jié)省收集數(shù)據(jù)時(shí)間。晶體生長(zhǎng)有許多文獻(xiàn),有專門的刊物Journal of Crystal Growth (Amsterdam:Elsevier).此外還有許多專著。這里不一一列舉。怎樣獲得優(yōu)質(zhì)單晶?結(jié)晶過程涉及氣體、液體或溶液相中的離子、原子或分子有序的進(jìn)入
2、固態(tài)中有規(guī)則的位置。從晶體生成來看,初始階段是先形成晶核,接著的是離子、原子或分子在晶核的各晶面上有序的沉積,后者可被考慮為流體與晶體間的動(dòng)力學(xué)平衡,當(dāng)向前速度占支配地位時(shí),晶體就生長(zhǎng),否則則晶體重新溶解。影響平衡的因素包括晶體表面的化學(xué)性質(zhì),被結(jié)晶物質(zhì)的濃度,晶體內(nèi)和晶體周圍介質(zhì)的性質(zhì)。要指出的是晶體的形成只是發(fā)生在出現(xiàn)臨界大小的晶核以后,否則晶核會(huì)重新溶解。當(dāng)晶核大于臨界大小時(shí),體系的生成自由能才由正值或零變?yōu)樨?fù)值。這樣晶體生長(zhǎng)在熱力學(xué)上就變得有利,晶體才會(huì)增大。成核的速率一般隨過飽和度的提高而顯著增加,為了只讓幾顆晶體生長(zhǎng),必須限制晶核數(shù)量,過飽和度應(yīng)盡可能的低,過飽和應(yīng)慢慢到達(dá),一旦到
3、達(dá)這種低程度的過飽和以后,就要小心控制,使少數(shù)幾顆晶核在準(zhǔn)平衡狀態(tài)下慢慢生長(zhǎng)。在成核過程中,外部物體,諸如灰塵顆粒,器壁的劃痕等往往成為結(jié)晶中心,這又往往使得成核過程在熱力學(xué)上變得更有利,晶核就大量形成,不利于少數(shù)幾顆晶核長(zhǎng)大成晶體,所以這些灰塵顆粒要通過離心分離或過濾的方法事先去除。結(jié)晶的容器要選用新的,或用相應(yīng)的方法惰化(如硅化),但有時(shí)情況剛好相反,晶核很難形成,這時(shí)加晶種方法或者用一定工具輕輕的磨擦器壁,也常是獲得一定的晶核和控制晶核數(shù)量的一種方法。低分子量的有機(jī)、無機(jī)化合物、蛋白質(zhì)的晶體生長(zhǎng)大概有以下幾種方法:1)、單溶劑蒸發(fā)2)、兩元溶劑混和物蒸發(fā)3)、成批結(jié)晶4)、液-液擴(kuò)散5)
4、、座滴或懸滴汽相擴(kuò)散6)、改變溫度7)、凝膠結(jié)晶法8)、升華法9)、固化法以下就結(jié)構(gòu)分析用的晶體(一般尺寸為0.1-0.5mm)的生長(zhǎng),按結(jié)晶的介質(zhì)情況概括為溶液法,升華法,流動(dòng)相生長(zhǎng)法和固態(tài)合成法,簡(jiǎn)述如下:(一)溶液法:為了能使生長(zhǎng)的晶體沒有絲毫的損傷,生長(zhǎng)的容器必須是直壁的,有時(shí)為了控制蒸發(fā)的速度,容器的開口要小,或者溶劑蒸發(fā)的口徑設(shè)計(jì)成可以控制的。溶劑選擇的原則是:性質(zhì)相類似的相溶,類似的含義是指極性、功能團(tuán)等相似,相反地有時(shí)溶解度太大了,為了要減低溶解度,卻要使用一些“反溶劑”,這是指一類性能和化合物極不相似的溶劑。這樣溶液法又有單溶劑和混合溶劑之分。怎樣長(zhǎng)晶體呢?冷卻,大多數(shù)分子化
5、合物,溶解度是隨溫度升高而增加的。冷卻法結(jié)晶就是制備熱的接近飽和的溶液,然后讓其慢慢地冷卻下來,或者是室溫下的溶液在冰箱里冷卻到較低的溫度,使用的物體體積和質(zhì)量越大,冷卻的速度就越慢,另外物體保溫或絕熱材料越好,冷卻的速度也就越慢,這樣有良好保溫層的大容器中的小容量的溶液就能以相對(duì)慢的速率冷下來。冷卻法一般獲得晶體有成效,是依據(jù)溶解度隨溫度降低而減少,直至有可能達(dá)到飽和。但也有例外(如Na2SO4在水中),另外,象KNO3那種溶解度隨溫度急劇變化的,其冷卻速度不能很好控制的也難于控制結(jié)晶,但通常總可能找到一定的溶質(zhì)和溶劑的組合,它們的溶解度隨溫度能緩慢變化并易于控制的。 對(duì)流法,目的是在溶液里
6、建立一個(gè)溫度梯度,使得物質(zhì)在溫暖部位溶解,而在冷處沉積。梯度可有不同方法建立:(1)容許太陽光照射在容器的一部分,(2)將容器的一部分對(duì)著較涼爽的表面,如夜晚的窗口,(3)在儀器的某部位裝配一種低功率的電加熱元件。用該法生長(zhǎng)結(jié)構(gòu)分析用的單晶,平滑的濃度梯度將會(huì)給出最好的結(jié)果。 濃度法,如果溶液的體積通過揮發(fā)性的溶劑蒸發(fā)而減少,溶質(zhì)的濃度將提高,直至開始結(jié)晶。當(dāng)使用混合溶劑時(shí),如果溶解度差的溶劑揮發(fā)性差,溶質(zhì)的溶解度在混合溶劑揮發(fā)時(shí),溶解度應(yīng)減少。這樣都有可能達(dá)到飽和而生長(zhǎng)晶體。蒸發(fā)速率能以不同方式控制:如改變樣品的溫度或調(diào)節(jié)溶劑蒸汽逃逸的出口孔徑大小都行。值得注意的是,要避免溶液蒸發(fā)直至干涸,
7、就把好的晶體取出。溶劑蒸發(fā)干涸這樣將使合用的晶體表面長(zhǎng)殼,或長(zhǎng)成聚集體或被雜質(zhì)沾污而使之變差。好的晶體也可能因失去結(jié)晶的溶劑分子特別象二氯甲烷之類分子而降解。這就是為什么在用二氯甲烷或氯仿作溶劑的場(chǎng)合下即便看到得好的晶體,不受損傷的取出晶體,也很難得到合格的單晶。有時(shí)為了避免溶劑分子逃逸,晶體必須及時(shí)的密封在玻璃毛細(xì)管里。緩慢蒸發(fā)溶劑,晶體生長(zhǎng)不受干擾常能培養(yǎng)出高質(zhì)量的單晶,這也就不難理解:遺忘在通風(fēng)櫥背后或冰箱一角達(dá)幾星期甚至幾個(gè)月之久,明顯密封著NMR管會(huì)成為高質(zhì)量晶體的的來源。只要NMR管清潔,其光滑的內(nèi)壁少有劃痕,加上狹窄的口徑提供了晶體生長(zhǎng)的良好條件。對(duì)于溶解性很差的化合物,一個(gè)結(jié)合
8、濃度和溫度同時(shí)變化的有效方法是Soxhlet萃取法。 溶劑的再循環(huán)是關(guān)鍵的一環(huán),晶體甚至可出現(xiàn)在回流的溶劑里。既便不能如此,在溶液慢慢冷卻后也能正常地出現(xiàn)晶體。控制濃度還能用其它一些方法:透析法,溶劑通過半透膜到一種惰性介質(zhì)的濃溶液中。溶質(zhì)濃度的增加可導(dǎo)致晶體的形成。 溶劑擴(kuò)散法,該法是依據(jù)于化合物可很好地溶解于某些溶劑(良溶劑)而不能溶解于另一些溶劑(不良溶劑或反溶劑),但這兩種溶劑是可混溶的。如果將化合物溶解在良溶劑里并置于一條狹的管子中,使用帶細(xì)針頭的注射器很慢地注入清潔的反溶劑,如果后者比溶液輕,它就在頂端成層,如果后者較重,就將它慢慢注到溶液的底部,在溶液下部成層。注入法比沿管壁倒入
9、更好,如果管子靜置沒有振動(dòng),這些層就通過界面慢慢互相擴(kuò)散,在界面上達(dá)到飽和時(shí)就長(zhǎng)出晶體。如果必要的話,冷卻管子可以降低擴(kuò)散速度,減少溶解度。 反應(yīng)擴(kuò)散法,有時(shí)有可能將合成與晶體生長(zhǎng)結(jié)合在一起。在有利的條件下,晶體可以自反應(yīng)混合物中簡(jiǎn)單的析出,若反應(yīng)速度過快使得晶體形成很快,則形成的晶體質(zhì)量差。如果慢慢加入一種反應(yīng)物,使反應(yīng)速度可以控制,就可克服這個(gè)問題。通過插入一種半透性的位壘(如膜或灰網(wǎng)或者液體石蠟之類的惰性液體),或者利用溶膠結(jié)晶法,控制反應(yīng)物的混和速度,就可獲得最好控制。另一種變通法是把固體反應(yīng)物放在管子的底部,在其上面蓋一層能慢慢溶解化合物的溶劑,再在上部蓋一層第二種反應(yīng)物的溶液,固體
10、溶解所需的額外時(shí)間減少了反應(yīng)能發(fā)生的反應(yīng)速度。 沸石晶體和許多具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)物質(zhì)的晶體不能復(fù)結(jié)晶,因而只能通過反應(yīng)混合物的方法獲得。細(xì)致地調(diào)制反應(yīng)條件和配比以及反應(yīng)物的濃度,很可能是唯一提供控制晶體大小和質(zhì)量的最現(xiàn)實(shí)的方法。溶膠結(jié)晶是一種獲得低溶解度化合物晶體的一種尚未被充分開發(fā)的方法。因?yàn)槿芤旱幕旌瓦^程是受通過粘性介質(zhì)的擴(kuò)散所制約,這時(shí)對(duì)流、沉積等過程的競(jìng)爭(zhēng)已被減到最低程度,因而利用該法有可能建立十分接近于微重力空間下結(jié)晶的實(shí)驗(yàn)室條件。一種典型的裝置是用膠半充滿U型管,將一種反應(yīng)物的溶液放在U型管頂部的一端,另一種反應(yīng)物的溶液放在頂部的另一端,因?yàn)槿苣z通常是無色的,這就較容易檢測(cè)得到和離析出有
11、強(qiáng)烈顏色產(chǎn)物的晶體。溶膠有許多制備方法,詳見(。還可以用有機(jī)溶劑處理溶膠產(chǎn)生.各種憎水或?qū)駳饷舾谢衔锓矫娴膽?yīng)用。晶種晶體,有時(shí)化合物結(jié)晶雖然能給出高質(zhì)的晶體,但供結(jié)構(gòu)分析使用還是嫌尺寸太小,但這些小顆粒能放到化合物的熱飽和溶液中用作晶種,待溶液慢慢冷卻時(shí),晶體就會(huì)長(zhǎng)大,希望晶體能長(zhǎng)成合適的大小。因?yàn)橹幌MХN長(zhǎng)大,不希望再形成新的晶核,這里要十分注意的是容器必須清潔,沒有劃痕。(二)升華法, 升華是指固態(tài)物質(zhì)直接轉(zhuǎn)化為氣態(tài)的一種現(xiàn)象。如果這種蒸氣遇冷就有可能結(jié)成晶體。它一直被用來制備無溶劑的晶體電介質(zhì)材料,但只能限于溫度低于分解溫度或熔點(diǎn)就有一定蒸氣壓的固體?;緦?shí)驗(yàn)裝置很簡(jiǎn)單:封閉式通常
12、可抽真空的容器,如必要內(nèi)部固體可被加熱,內(nèi)部還有供晶體生長(zhǎng)的冷表面。如果可以避免加熱固體,在盡可能低的溫度下還經(jīng)??傻玫礁鼉?yōu)質(zhì)的晶體。如果固體極容易升華,則整個(gè)容器可以變冷一些。如果化合物蒸氣壓太低,容器抽真空并使用一只含丙酮/干冰(-78C)而不是冷水(5-10C)的冷指頭瓶冷卻析出晶體的容器,也能使升華加強(qiáng)。 (三)流動(dòng)相生長(zhǎng)經(jīng)常使用在位技術(shù)有可能直接從液體或氣體生長(zhǎng)晶體。流動(dòng)相法同時(shí)包括高溫自熔體生長(zhǎng)和低溫直接自化合物生長(zhǎng)(若熔點(diǎn)低于室溫時(shí))。高溫法(Bridgman, Czochralski, zone refiining, etc)被廣泛地用來純化和生長(zhǎng)半導(dǎo)體晶體和其它電子材料,但僅
13、限于熔融時(shí)沒有分解的樣品,因而不包括許多分子化合物。和溶液法相比,它也很難防止諸如孿晶等現(xiàn)象。經(jīng)常不可能分開重疊或相鄰的晶體。一旦晶體生成,通常就不可能分離。這不象溶液法生長(zhǎng)晶體,實(shí)際上只有一種變量即樣品的溫度需要控制。而且許多方法還可以加以控制。這里策劃晶體生長(zhǎng)的中心是要建立液固相間的穩(wěn)定介面。對(duì)空氣穩(wěn)定的化合物,在冰箱或冰筒里結(jié)晶需要注意的是保持晶體一直處于冷卻狀態(tài),直至晶體轉(zhuǎn)移到衍射儀低溫設(shè)備的冷氣流時(shí)為止。(四)固態(tài)合成在有利的環(huán)境下,有可能制備合適的單晶,但更為典型的是得到微晶樣品。如大多數(shù)高溫超導(dǎo)體不能得到單晶,它們的結(jié)構(gòu)總是由粉末衍射法測(cè)定。用溶液法合成沸石,合成條件的改變似乎是
14、得到較好單晶的唯一方法。晶體生長(zhǎng)這個(gè)問題常被忽視,特別對(duì)新的化合物。既便最初的努力失敗,也不應(yīng)沮喪,得到微晶材料雖然不能直接用于單晶結(jié)構(gòu)分析,但它確確實(shí)實(shí)指明化合物是晶體,改變結(jié)晶技術(shù)一定可導(dǎo)致大的晶體。一個(gè)好的辦法是同時(shí)試驗(yàn)幾種方法,做制備條件和獲得結(jié)果的詳細(xì)記錄,這不僅有利于鑒出最有利的方法和條件,也奠定了將來的操作基礎(chǔ),有利于用經(jīng)驗(yàn)改善晶體的質(zhì)量,從早期差的晶體開始。一直持續(xù)進(jìn)行到晶體質(zhì)量不再有所改變?yōu)橹?。有時(shí),不管用什么方法,都不能形成晶體或者形成的晶體都不合適,可采用修飾化合物的辦法。離子化合物可改變配對(duì)離子的種類,(如PF6-用BF4-代替),中性化合物??筛淖兘Y(jié)構(gòu)中那些化學(xué)上并不
15、重要的基團(tuán)種類,如哌啶取代為嗎啉,這里只改變遠(yuǎn)處的一個(gè)CH2為氧原子,晶體質(zhì)量很可能就有明顯的改變。晶體質(zhì)量的評(píng)估晶體一旦出現(xiàn),就要確定它是否適合于收集衍射數(shù)據(jù),如能快速鑒定,可以節(jié)省大量的衍射儀時(shí)間。鑒定時(shí),要小心以防止晶體損壞,如從母液取出晶體易因損失結(jié)晶的溶劑分子而損壞。如有足夠數(shù)量的晶體可用,可先將一、二顆取出放在顯微鏡的載波片上,利用顯微鏡可先有規(guī)則地觀察它們,得到變壞的有關(guān)訊息。對(duì)一般的晶體,可按下面的方法檢測(cè),棄去那些無爭(zhēng)議不合適的晶體。對(duì)那些質(zhì)量有任何不確定因素的抱懷疑態(tài)度總是有好處的。1、顯微鏡。在顯微鏡下觀察僅花幾秒到幾分鐘,就能鑒定不合適的晶體,而在衍射儀或照相機(jī)上卻要幾
16、小時(shí)。顯微鏡要帶偏振附件,放大倍數(shù)高至40倍,視場(chǎng)要深一些,光源要強(qiáng)一些。晶體觀察分三階段:第一步:不必使用偏光附件(只用正常光)觀察晶體,看它形狀是否好,丟棄那些彎曲的或有其它變形的,諸如附有顯著傍晶又無法去掉的或有凹角的晶體。都得丟棄。丟棄的晶體也不能僅僅是因?yàn)樾。且阎瑯哟笮〉耐惢衔镞^去證明過不行。對(duì)含組分不超過氧元素的有機(jī)化合物,通常的衍射儀器,晶體尺寸小于0.10.10.1mm3偶而也能給出好的數(shù)據(jù)。然而這個(gè)尺寸對(duì)于含鋨的簇合物來說卻可能是十分理想。第二步:使用偏光附件觀察晶體,大多數(shù)晶體能透射偏振光,但四方或六方的沿主軸c方向以及立方晶系的晶體在任何方向卻是例外。而在主軸外
17、的其它方向,四方或六方晶系的晶體能透射偏振光,但立方晶系象玻璃這類無定形晶體不能消光晶體,不過這三種晶系的晶體總共只占分子晶體的5%.第三步:如果一種晶體能透射偏振光,旋轉(zhuǎn)顯微鏡臺(tái)直至晶體轉(zhuǎn)暗(消光),再轉(zhuǎn)90,又轉(zhuǎn)亮,這種消光性質(zhì)是晶體質(zhì)量的最好指標(biāo)。整顆晶體都應(yīng)消光,消光的角度很尖銳(約1),任何不能完全消光的晶體不是單晶,可立即丟掉。缺乏消光尖銳性的可能指明在晶體里有大的鑲嵌結(jié)構(gòu),如果一種晶體從不消光的話那肯定是小晶體的聚集體。當(dāng)觀察整批晶體時(shí),可確定樣品的總的質(zhì)量,還可確定哪幾顆晶體適合于進(jìn)一步研究。2,X射線照相,照片比起四圓衍射儀獲得的反射數(shù)據(jù)輸出表更能給出倒易點(diǎn)陣的外觀,它能記錄期望位置外存在的任何衍射。用POLAROID照相機(jī)可以拍得5-10內(nèi)回?cái)[的回?cái)[照片。除了能得出晶體質(zhì)量的信息外,照片也能用于確立晶胞大小,衍射對(duì)稱性。使用POLAROID照相,也可篩選丟棄有疑問的晶體。面探測(cè)器(CCD和映象板)的映象可給出同照片一樣的倒易點(diǎn)陣外觀,它不需要底片,但速度快,靈活性大,更精確。3,衍射儀,晶體的最后試驗(yàn)是它在衍射儀上的表現(xiàn),反射應(yīng)有足夠的強(qiáng)度,峰形好,(不會(huì)分裂或過分寬化),指標(biāo)化能給出通情達(dá)理的晶胞參數(shù),帶面探器的衍射儀能具同時(shí)具有照片和電子計(jì)數(shù)器的優(yōu)點(diǎn),能很快確定晶體的質(zhì)量。它
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